RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482904.1

RHBDF1-208, Transcript of rhomboid 5 homolog 1, humanhuman

TSL 3

Gene RHBDF1, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1-208ENST00000482904 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.77■■■■■ 6.84
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RHBDF1-208ENST00000482904 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.79■■■■■ 5.4
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RHBDF1-208ENST00000482904 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.52■■■■■ 5.36
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RHBDF1-208ENST00000482904 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.58■■■■■ 5.21
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RHBDF1-208ENST00000482904 SMARCA2P51531 1590 aa44.76■■■■■ 4.76
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RHBDF1-208ENST00000482904 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.52■■■■■ 4.72
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RHBDF1-208ENST00000482904 WIZO95785 1651 aa44.02■■■■■ 4.64
RHBDF1-208ENST00000482904 ERCC6Q03468 1493 aa44■■■■■ 4.63
RHBDF1-208ENST00000482904 NESP48681 1621 aa43.91■■■■■ 4.62
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RHBDF1-208ENST00000482904 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.75■■■■■ 4.59
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RHBDF1-208ENST00000482904 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.51■■■■■ 4.56
RHBDF1-208ENST00000482904 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.48■■■■■ 4.55
RHBDF1-208ENST00000482904 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.38■■■■■ 4.54
RHBDF1-208ENST00000482904 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.36■■■■■ 4.53
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RHBDF1-208ENST00000482904 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.07■■■■■ 4.49
RHBDF1-208ENST00000482904 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.06■■■■■ 4.48
RHBDF1-208ENST00000482904 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.01■■■■■ 4.48
RHBDF1-208ENST00000482904 WDR62O43379 1518 aa42.93■■■■■ 4.46
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RHBDF1-208ENST00000482904 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.62■■■■■ 4.41
RHBDF1-208ENST00000482904 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.47■■■■■ 4.39
RHBDF1-208ENST00000482904 TOPBP1Q92547 1522 aa42.3■■■■■ 4.36
RHBDF1-208ENST00000482904 ABCC8Q09428 1581 aa42.26■■■■■ 4.36
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RHBDF1-208ENST00000482904 IFT140Q96RY7 1462 aa42.16■■■■■ 4.34
RHBDF1-208ENST00000482904 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
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RHBDF1-208ENST00000482904 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.77■■■■■ 4.28
RHBDF1-208ENST00000482904 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.73■■■■■ 4.27
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RHBDF1-208ENST00000482904 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
RHBDF1-208ENST00000482904 WDR97A6NE52 1622 aa41.51■■■■■ 4.24
RHBDF1-208ENST00000482904 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.41■■■■■ 4.22
RHBDF1-208ENST00000482904 CHD1O14646 1710 aa41.36■■■■■ 4.21
RHBDF1-208ENST00000482904 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.34■■■■■ 4.21
RHBDF1-208ENST00000482904 FBLN2P98095 1184 aa41.34■■■■■ 4.21
RHBDF1-208ENST00000482904 TOP2BQ02880 1626 aa41.33■■■■■ 4.21
RHBDF1-208ENST00000482904 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.33■■■■■ 4.21
RHBDF1-208ENST00000482904 GRIN2BQ13224 1484 aa41.32■■■■■ 4.2
RHBDF1-208ENST00000482904 SYNJ1O43426 1573 aa41.32■■■■■ 4.2
RHBDF1-208ENST00000482904 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.31■■■■■ 4.2
RHBDF1-208ENST00000482904 TRIM41Q8WV44 630 aa41.26■■■■■ 4.2
RHBDF1-208ENST00000482904 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.25■■■■■ 4.19
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RHBDF1-208ENST00000482904 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.11■■■■■ 4.17
RHBDF1-208ENST00000482904 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.11■■■■■ 4.17
RHBDF1-208ENST00000482904 SYNJ2O15056 1496 aa41.09■■■■■ 4.17
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RHBDF1-208ENST00000482904 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.19■■■■■ 4.02
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