RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482643.1

SLC35D2-204, Transcript of solute carrier family 35 member D2, humanhuman

TSL 5

Gene SLC35D2, Length 754 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35D2-204ENST00000482643 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.82■■■■■ 6.85
SLC35D2-204ENST00000482643 ABCC9O60706 1549 aa52.61■■■■■ 6.01
SLC35D2-204ENST00000482643 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.05■■■■■ 5.92
SLC35D2-204ENST00000482643 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.96■■■■■ 5.59
SLC35D2-204ENST00000482643 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.79■■■■■ 5.56
SLC35D2-204ENST00000482643 NACADO15069 1562 aa49.35■■■■■ 5.49
SLC35D2-204ENST00000482643 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.99■■■■■ 5.43
SLC35D2-204ENST00000482643 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.94■■■■■ 5.43
SLC35D2-204ENST00000482643 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.77■■■■■ 5.4
SLC35D2-204ENST00000482643 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.53■■■■■ 5.36
SLC35D2-204ENST00000482643 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.48■■■■■ 5.35
SLC35D2-204ENST00000482643 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.79■■■■■ 5.24
SLC35D2-204ENST00000482643 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.71■■■■■ 5.23
SLC35D2-204ENST00000482643 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.64■■■■■ 5.22
SLC35D2-204ENST00000482643 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.49■■■■■ 5.19
SLC35D2-204ENST00000482643 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.42■■■■■ 5.18
SLC35D2-204ENST00000482643 SCRIBQ14160 1630 aa47.41■■■■■ 5.18
SLC35D2-204ENST00000482643 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.25■■■■■ 5.15
SLC35D2-204ENST00000482643 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.17■■■■■ 4.98
SLC35D2-204ENST00000482643 NCAPD3P42695 1498 aa45.62■■■■■ 4.89
SLC35D2-204ENST00000482643 CUX2O14529 1486 aa45.5■■■■■ 4.87
SLC35D2-204ENST00000482643 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.4■■■■■ 4.86
SLC35D2-204ENST00000482643 ERCC6Q03468 1493 aa45.37■■■■■ 4.85
SLC35D2-204ENST00000482643 SMARCA4P51532 1647 aa45.19■■■■■ 4.83
SLC35D2-204ENST00000482643 SMARCA2P51531 1590 aa45.18■■■■■ 4.82
SLC35D2-204ENST00000482643 HMGXB3Q12766 1538 aa45.17■■■■■ 4.82
SLC35D2-204ENST00000482643 NESP48681 1621 aa45.08■■■■■ 4.81
SLC35D2-204ENST00000482643 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.86■■■■■ 4.77
SLC35D2-204ENST00000482643 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.86■■■■■ 4.77
SLC35D2-204ENST00000482643 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.77■■■■■ 4.76
SLC35D2-204ENST00000482643 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.69■■■■■ 4.74
SLC35D2-204ENST00000482643 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.6■■■■■ 4.73
SLC35D2-204ENST00000482643 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.58■■■■■ 4.73
SLC35D2-204ENST00000482643 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.45■■■■■ 4.71
SLC35D2-204ENST00000482643 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.36■■■■■ 4.69
SLC35D2-204ENST00000482643 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.19■■■■■ 4.67
SLC35D2-204ENST00000482643 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.02■■■■■ 4.64
SLC35D2-204ENST00000482643 WIZO95785 1651 aa44■■■■■ 4.63
SLC35D2-204ENST00000482643 WDR62O43379 1518 aa43.94■■■■■ 4.63
SLC35D2-204ENST00000482643 TRIM41Q8WV44 630 aa43.85■■■■■ 4.61
SLC35D2-204ENST00000482643 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.72■■■■■ 4.59
SLC35D2-204ENST00000482643 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.66■■■■■ 4.58
SLC35D2-204ENST00000482643 CFTRP13569 1480 aa43.58■■■■■ 4.57
SLC35D2-204ENST00000482643 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.47■■■■■ 4.55
SLC35D2-204ENST00000482643 OSCARQ8IYS5 282 aa43.39■■■■■ 4.54
SLC35D2-204ENST00000482643 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.54
SLC35D2-204ENST00000482643 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.36■■■■■ 4.53
SLC35D2-204ENST00000482643 PRDM2Q13029 1718 aa43.05■■■■■ 4.48
SLC35D2-204ENST00000482643 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.94■■■■■ 4.46
SLC35D2-204ENST00000482643 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.94■■■■■ 4.46
SLC35D2-204ENST00000482643 IFT140Q96RY7 1462 aa42.89■■■■■ 4.46
SLC35D2-204ENST00000482643 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.88■■■■■ 4.45
SLC35D2-204ENST00000482643 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.88■■■■■ 4.45
SLC35D2-204ENST00000482643 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.88■■■■■ 4.45
SLC35D2-204ENST00000482643 TOPBP1Q92547 1522 aa42.81■■■■■ 4.44
SLC35D2-204ENST00000482643 ARHGEF11O15085 1522 aa42.68■■■■■ 4.42
SLC35D2-204ENST00000482643 ABCC8Q09428 1581 aa42.62■■■■■ 4.41
SLC35D2-204ENST00000482643 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
SLC35D2-204ENST00000482643 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.56■■■■■ 4.4
SLC35D2-204ENST00000482643 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
SLC35D2-204ENST00000482643 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.49■■■■■ 4.395e-7■■■■■ 32.6
SLC35D2-204ENST00000482643 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.42■■■■■ 4.38
SLC35D2-204ENST00000482643 CHD1O14646 1710 aa42.42■■■■■ 4.38
SLC35D2-204ENST00000482643 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.33■■■■■ 4.37
SLC35D2-204ENST00000482643 ARAP1Q96P48 1450 aa42.25■■■■■ 4.35
SLC35D2-204ENST00000482643 FBLN2P98095 1184 aa42.24■■■■■ 4.35
SLC35D2-204ENST00000482643 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.22■■■■■ 4.35
SLC35D2-204ENST00000482643 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
SLC35D2-204ENST00000482643 SOGA1O94964 1423 aa42.12■■■■■ 4.33
SLC35D2-204ENST00000482643 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
SLC35D2-204ENST00000482643 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.98■■■■■ 4.31
SLC35D2-204ENST00000482643 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.98■■■■■ 4.31
SLC35D2-204ENST00000482643 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.94■■■■■ 4.3
SLC35D2-204ENST00000482643 WDR97A6NE52 1622 aa41.91■■■■■ 4.3
SLC35D2-204ENST00000482643 CUX1P39880 1505 aa41.9■■■■■ 4.3
SLC35D2-204ENST00000482643 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
SLC35D2-204ENST00000482643 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
SLC35D2-204ENST00000482643 GRIN2BQ13224 1484 aa41.79■■■■■ 4.28
SLC35D2-204ENST00000482643 SYNJ1O43426 1573 aa41.79■■■■■ 4.28
SLC35D2-204ENST00000482643 SYNJ2O15056 1496 aa41.72■■■■■ 4.27
SLC35D2-204ENST00000482643 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.59■■■■■ 4.25
SLC35D2-204ENST00000482643 PBRM1Q86U86 1689 aa41.58■■■■■ 4.25
SLC35D2-204ENST00000482643 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.49■■■■■ 4.23
SLC35D2-204ENST00000482643 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.46■■■■■ 4.23
SLC35D2-204ENST00000482643 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.29■■■■■ 4.2
SLC35D2-204ENST00000482643 GRIN2AQ12879 1464 aa41.27■■■■■ 4.2
SLC35D2-204ENST00000482643 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.18■■■■■ 4.18
SLC35D2-204ENST00000482643 NUP160Q12769 1436 aa41.18■■■■■ 4.18
SLC35D2-204ENST00000482643 ADAMTS12P58397 1594 aa41.16■■■■■ 4.18
SLC35D2-204ENST00000482643 CEP170Q5SW79 1584 aa41.16■■■■■ 4.18
SLC35D2-204ENST00000482643 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
SLC35D2-204ENST00000482643 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
SLC35D2-204ENST00000482643 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.06■■■■■ 4.16
SLC35D2-204ENST00000482643 TOP2BQ02880 1626 aa41.05■■■■■ 4.16
SLC35D2-204ENST00000482643 SHROOM2Q13796 1616 aa41.05■■■■■ 4.16
SLC35D2-204ENST00000482643 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.04■■■■■ 4.16
SLC35D2-204ENST00000482643 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.92■■■■■ 4.14
SLC35D2-204ENST00000482643 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
SLC35D2-204ENST00000482643 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.81■■■■■ 4.12
SLC35D2-204ENST00000482643 JPH4Q96JJ6 628 aa40.77■■■■■ 4.12
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