RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482460.1

CYTH3-208, Transcript of cytohesin 3, human

TSL 3

Gene CYTH3, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CYTH3-208	ENST00000482460	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		56.09	■■■■■ 6.57
CYTH3-208	ENST00000482460	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		50.09	■■■■■ 5.61
CYTH3-208	ENST00000482460	ABCC9	O60706	1549 aa		49.56	■■■■■ 5.52
CYTH3-208	ENST00000482460	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.44	■■■■■ 5.18
CYTH3-208	ENST00000482460	NACAD	O15069	1562 aa		47.25	■■■■■ 5.15
CYTH3-208	ENST00000482460	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47.14	■■■■■ 5.14
CYTH3-208	ENST00000482460	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		46.79	■■■■■ 5.08
CYTH3-208	ENST00000482460	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	46.58	■■■■■ 5.05
CYTH3-208	ENST00000482460	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		46.38	■■■■■ 5.02
CYTH3-208	ENST00000482460	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.35	■■■■■ 5.01
CYTH3-208	ENST00000482460	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	46.24	■■■■■ 4.99
CYTH3-208	ENST00000482460	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		46.04	■■■■■ 4.96
CYTH3-208	ENST00000482460	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.01	■■■■■ 4.96
CYTH3-208	ENST00000482460	SCRIB	Q14160	1630 aa		45.65	■■■■■ 4.9
CYTH3-208	ENST00000482460	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		45.48	■■■■■ 4.87
CYTH3-208	ENST00000482460	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	44.84	■■■■■ 4.77
CYTH3-208	ENST00000482460	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		44.8	■■■■■ 4.76
CYTH3-208	ENST00000482460	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		44.59	■■■■■ 4.73
CYTH3-208	ENST00000482460	NCAPD3	P42695	1498 aa		43.63	■■■■■ 4.57
CYTH3-208	ENST00000482460	SMARCA4	P51532	1647 aa		43.62	■■■■■ 4.57
CYTH3-208	ENST00000482460	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		43.55	■■■■■ 4.56
CYTH3-208	ENST00000482460	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	43.5	■■■■■ 4.55
CYTH3-208	ENST00000482460	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.46	■■■■■ 4.55
CYTH3-208	ENST00000482460	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.32	■■■■■ 4.53
CYTH3-208	ENST00000482460	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		43.22	■■■■■ 4.51
CYTH3-208	ENST00000482460	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		43.21	■■■■■ 4.51
CYTH3-208	ENST00000482460	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.15	■■■■■ 4.5
CYTH3-208	ENST00000482460	ERCC6	Q03468	1493 aa		42.76	■■■■■ 4.44
CYTH3-208	ENST00000482460	NES	P48681	1621 aa		42.72	■■■■■ 4.43
CYTH3-208	ENST00000482460	WIZ	O95785	1651 aa		42.72	■■■■■ 4.43
CYTH3-208	ENST00000482460	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.55	■■■■■ 4.4
CYTH3-208	ENST00000482460	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	42.53	■■■■■ 4.4
CYTH3-208	ENST00000482460	CUX2	O14529	1486 aa		42.52	■■■■■ 4.4
CYTH3-208	ENST00000482460	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.33	■■■■■ 4.37
CYTH3-208	ENST00000482460	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		42.29	■■■■■ 4.36
CYTH3-208	ENST00000482460	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	42.21	■■■■■ 4.35
CYTH3-208	ENST00000482460	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.19	■■■■■ 4.34
CYTH3-208	ENST00000482460	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.18	■■■■■ 4.34
CYTH3-208	ENST00000482460	CFTR	P13569	1480 aa		41.94	■■■■■ 4.3
CYTH3-208	ENST00000482460	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		41.92	■■■■■ 4.3
CYTH3-208	ENST00000482460	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		41.86	■■■■■ 4.29
CYTH3-208	ENST00000482460	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		41.82	■■■■■ 4.29
CYTH3-208	ENST00000482460	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		41.81	■■■■■ 4.28
CYTH3-208	ENST00000482460	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		41.75	■■■■■ 4.27
CYTH3-208	ENST00000482460	WDR62	O43379	1518 aa		41.74	■■■■■ 4.27
CYTH3-208	ENST00000482460	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.56	■■■■■ 4.24
CYTH3-208	ENST00000482460	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.43	■■■■■ 4.22
CYTH3-208	ENST00000482460	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.08	■■■■■ 4.17
CYTH3-208	ENST00000482460	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.08	■■■■■ 4.17
CYTH3-208	ENST00000482460	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	41.06	■■■■■ 4.16
CYTH3-208	ENST00000482460	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		40.98	■■■■■ 4.15
CYTH3-208	ENST00000482460	IFT140	Q96RY7	1462 aa		40.97	■■■■■ 4.15
CYTH3-208	ENST00000482460	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	40.83	■■■■■ 4.13
CYTH3-208	ENST00000482460	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		40.71	■■■■■ 4.11
CYTH3-208	ENST00000482460	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	40.7	■■■■■ 4.11
CYTH3-208	ENST00000482460	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	40.67	■■■■■ 4.1
CYTH3-208	ENST00000482460	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	40.61	■■■■■ 4.09
CYTH3-208	ENST00000482460	CUX1	P39880	1505 aa		40.57	■■■■■ 4.08
CYTH3-208	ENST00000482460	SOGA1	O94964	1423 aa		40.55	■■■■■ 4.08
CYTH3-208	ENST00000482460	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.54	■■■■■ 4.08
CYTH3-208	ENST00000482460	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.53	■■■■■ 4.08
CYTH3-208	ENST00000482460	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		40.51	■■■■■ 4.08
CYTH3-208	ENST00000482460	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.38	■■■■■ 4.06
CYTH3-208	ENST00000482460	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.32	■■■■■ 4.05
CYTH3-208	ENST00000482460	TRIM41	Q8WV44	630 aa		40.27	■■■■■ 4.04
CYTH3-208	ENST00000482460	CHD1	O14646	1710 aa		40.22	■■■■■ 4.03
CYTH3-208	ENST00000482460	FBLN2	P98095	1184 aa		40.19	■■■■■ 4.02
CYTH3-208	ENST00000482460	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.13	■■■■■ 4.01
CYTH3-208	ENST00000482460	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.13	■■■■■ 4.01
CYTH3-208	ENST00000482460	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	40.11	■■■■■ 4.01
CYTH3-208	ENST00000482460	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.11	■■■■■ 4.01
CYTH3-208	ENST00000482460	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.07	■■■■■ 4.01
CYTH3-208	ENST00000482460	TOP2B	Q02880	1626 aa		40.07	■■■■■ 4.01
CYTH3-208	ENST00000482460	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		40.07	■■■■■ 4.01
CYTH3-208	ENST00000482460	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.06	■■■■■ 4
CYTH3-208	ENST00000482460	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		40.05	■■■■■ 4
CYTH3-208	ENST00000482460	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		40.05	■■■■■ 4
CYTH3-208	ENST00000482460	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		40.05	■■■■■ 4
CYTH3-208	ENST00000482460	SYNJ1	O43426	1573 aa		40.01	■■■■■ 4
CYTH3-208	ENST00000482460	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	40	■■■■□ 3.99
CYTH3-208	ENST00000482460	ARHGEF11	O15085	1522 aa		39.99	■■■■□ 3.99
CYTH3-208	ENST00000482460	PBRM1	Q86U86	1689 aa		39.98	■■■■□ 3.99
CYTH3-208	ENST00000482460	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		39.97	■■■■□ 3.99
CYTH3-208	ENST00000482460	SYNJ2	O15056	1496 aa		39.93	■■■■□ 3.98
CYTH3-208	ENST00000482460	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		39.78	■■■■□ 3.96
CYTH3-208	ENST00000482460	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		39.7	■■■■□ 3.95
CYTH3-208	ENST00000482460	ARAP1	Q96P48	1450 aa		39.63	■■■■□ 3.94
CYTH3-208	ENST00000482460	ADAMTS12	P58397	1594 aa		39.63	■■■■□ 3.93
CYTH3-208	ENST00000482460	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		39.62	■■■■□ 3.93
CYTH3-208	ENST00000482460	GRIN2A	Q12879	1464 aa		39.6	■■■■□ 3.93
CYTH3-208	ENST00000482460	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		39.57	■■■■□ 3.93
CYTH3-208	ENST00000482460	NUP160	Q12769	1436 aa		39.46	■■■■□ 3.91
CYTH3-208	ENST00000482460	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.42	■■■■□ 3.9
CYTH3-208	ENST00000482460	KIF27	Q86VH2	1401 aa		39.32	■■■■□ 3.89
CYTH3-208	ENST00000482460	IGF1R	P08069	1367 aa		39.26	■■■■□ 3.88
CYTH3-208	ENST00000482460	SHROOM2	Q13796	1616 aa		39.21	■■■■□ 3.87
CYTH3-208	ENST00000482460	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		39.18	■■■■□ 3.86
CYTH3-208	ENST00000482460	CUL7	Q14999	1698 aa		39.13	■■■■□ 3.86
CYTH3-208	ENST00000482460	JPH4	Q96JJ6	628 aa		39.1	■■■■□ 3.85
CYTH3-208	ENST00000482460	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	39.08	■■■■□ 3.85

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