RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482248.7

QARS-216, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 5

Gene QARS, Length 887 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QARS-216ENST00000482248 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.76■■■□□ 2.51
QARS-216ENST00000482248 ABCC9O60706 1549 aa27.82■■■□□ 2.04
QARS-216ENST00000482248 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.52■■■□□ 2
QARS-216ENST00000482248 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.45■■□□□ 1.82
QARS-216ENST00000482248 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.37■■□□□ 1.81
QARS-216ENST00000482248 NACADO15069 1562 aa26.19■■□□□ 1.78
QARS-216ENST00000482248 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.02■■□□□ 1.76
QARS-216ENST00000482248 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.751e-6■■□□□ 13.4
QARS-216ENST00000482248 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.86■■□□□ 1.73
QARS-216ENST00000482248 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.65■■□□□ 1.7
QARS-216ENST00000482248 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.57■■□□□ 1.68
QARS-216ENST00000482248 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.43■■□□□ 1.66
QARS-216ENST00000482248 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
QARS-216ENST00000482248 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.34■■□□□ 1.65
QARS-216ENST00000482248 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.13■■□□□ 1.61
QARS-216ENST00000482248 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.08■■□□□ 1.61
QARS-216ENST00000482248 SCRIBQ14160 1630 aa25.06■■□□□ 1.6
QARS-216ENST00000482248 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
QARS-216ENST00000482248 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.45■■□□□ 1.5
QARS-216ENST00000482248 NCAPD3P42695 1498 aa24.28■■□□□ 1.48
QARS-216ENST00000482248 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.13■■□□□ 1.45
QARS-216ENST00000482248 CUX2O14529 1486 aa24.11■■□□□ 1.45
QARS-216ENST00000482248 ERCC6Q03468 1493 aa24.01■■□□□ 1.43
QARS-216ENST00000482248 SMARCA2P51531 1590 aa23.99■■□□□ 1.43
QARS-216ENST00000482248 HMGXB3Q12766 1538 aa23.97■■□□□ 1.43
QARS-216ENST00000482248 SMARCA4P51532 1647 aa23.94■■□□□ 1.42
QARS-216ENST00000482248 NESP48681 1621 aa23.85■■□□□ 1.41
QARS-216ENST00000482248 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
QARS-216ENST00000482248 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
QARS-216ENST00000482248 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.8■■□□□ 1.4
QARS-216ENST00000482248 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.68■■□□□ 1.38
QARS-216ENST00000482248 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.63■■□□□ 1.37
QARS-216ENST00000482248 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.59■■□□□ 1.37
QARS-216ENST00000482248 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
QARS-216ENST00000482248 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.53■■□□□ 1.36
QARS-216ENST00000482248 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.37■■□□□ 1.33
QARS-216ENST00000482248 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.35■■□□□ 1.33
QARS-216ENST00000482248 WDR62O43379 1518 aa23.28■■□□□ 1.32
QARS-216ENST00000482248 WIZO95785 1651 aa23.27■■□□□ 1.32
QARS-216ENST00000482248 CFTRP13569 1480 aa23.21■■□□□ 1.31
QARS-216ENST00000482248 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.18■■□□□ 1.3
QARS-216ENST00000482248 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.18■■□□□ 1.3
QARS-216ENST00000482248 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
QARS-216ENST00000482248 TRIM41Q8WV44 630 aa23.14■■□□□ 1.29
QARS-216ENST00000482248 OSCARQ8IYS5 282 aa23.05■■□□□ 1.28
QARS-216ENST00000482248 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
QARS-216ENST00000482248 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
QARS-216ENST00000482248 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.85■■□□□ 1.25
QARS-216ENST00000482248 IFT140Q96RY7 1462 aa22.79■■□□□ 1.24
QARS-216ENST00000482248 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
QARS-216ENST00000482248 TOPBP1Q92547 1522 aa22.71■■□□□ 1.23
QARS-216ENST00000482248 ABCC8Q09428 1581 aa22.67■■□□□ 1.22
QARS-216ENST00000482248 PRDM2Q13029 1718 aa22.6■■□□□ 1.21
QARS-216ENST00000482248 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.58■■□□□ 1.21
QARS-216ENST00000482248 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.58■■□□□ 1.21
QARS-216ENST00000482248 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.58■■□□□ 1.21
QARS-216ENST00000482248 ARHGEF11O15085 1522 aa22.57■■□□□ 1.2
QARS-216ENST00000482248 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.57■■□□□ 1.2
QARS-216ENST00000482248 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
QARS-216ENST00000482248 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
QARS-216ENST00000482248 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
QARS-216ENST00000482248 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.49■■□□□ 1.19
QARS-216ENST00000482248 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
QARS-216ENST00000482248 SOGA1O94964 1423 aa22.41■■□□□ 1.18
QARS-216ENST00000482248 FBLN2P98095 1184 aa22.41■■□□□ 1.18
QARS-216ENST00000482248 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
QARS-216ENST00000482248 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.4■■□□□ 1.18
QARS-216ENST00000482248 ARAP1Q96P48 1450 aa22.35■■□□□ 1.17
QARS-216ENST00000482248 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.28■■□□□ 1.16
QARS-216ENST00000482248 CHD1O14646 1710 aa22.27■■□□□ 1.16
QARS-216ENST00000482248 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
QARS-216ENST00000482248 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.25■■□□□ 1.15
QARS-216ENST00000482248 WDR97A6NE52 1622 aa22.24■■□□□ 1.15
QARS-216ENST00000482248 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
QARS-216ENST00000482248 CUX1P39880 1505 aa22.24■■□□□ 1.15
QARS-216ENST00000482248 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
QARS-216ENST00000482248 GRIN2BQ13224 1484 aa22.22■■□□□ 1.15
QARS-216ENST00000482248 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.2■■□□□ 1.14
QARS-216ENST00000482248 SYNJ2O15056 1496 aa22.16■■□□□ 1.14
QARS-216ENST00000482248 SYNJ1O43426 1573 aa22.12■■□□□ 1.13
QARS-216ENST00000482248 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.09■■□□□ 1.13
QARS-216ENST00000482248 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.07■■□□□ 1.12
QARS-216ENST00000482248 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
QARS-216ENST00000482248 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.95■■□□□ 1.1
QARS-216ENST00000482248 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
QARS-216ENST00000482248 GRIN2AQ12879 1464 aa21.9■■□□□ 1.1
QARS-216ENST00000482248 NUP160Q12769 1436 aa21.9■■□□□ 1.1
QARS-216ENST00000482248 PBRM1Q86U86 1689 aa21.88■■□□□ 1.09
QARS-216ENST00000482248 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.84■■□□□ 1.09
QARS-216ENST00000482248 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.82■■□□□ 1.08
QARS-216ENST00000482248 TOP2BQ02880 1626 aa21.8■■□□□ 1.08
QARS-216ENST00000482248 ADAMTS12P58397 1594 aa21.78■■□□□ 1.08
QARS-216ENST00000482248 CEP170Q5SW79 1584 aa21.78■■□□□ 1.08
QARS-216ENST00000482248 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.75■■□□□ 1.07
QARS-216ENST00000482248 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.74■■□□□ 1.07
QARS-216ENST00000482248 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
QARS-216ENST00000482248 JPH4Q96JJ6 628 aa21.72■■□□□ 1.07
QARS-216ENST00000482248 SHROOM2Q13796 1616 aa21.72■■□□□ 1.07
QARS-216ENST00000482248 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
QARS-216ENST00000482248 IGF1RP08069 1367 aa21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms