RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481047.1

MDK-208, Transcript of midkine, humanhuman

TSL 2

Gene MDK, Length 775 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDK-208ENST00000481047 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.73■■■■■ 6.67
MDK-208ENST00000481047 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.68■■■■■ 5.7
MDK-208ENST00000481047 ABCC9O60706 1549 aa49.97■■■■■ 5.59
MDK-208ENST00000481047 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.92■■■■■ 5.26
MDK-208ENST00000481047 NACADO15069 1562 aa47.74■■■■■ 5.23
MDK-208ENST00000481047 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.6■■■■■ 5.21
MDK-208ENST00000481047 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.3■■■■■ 5.16
MDK-208ENST00000481047 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.18■■■■■ 5.14
MDK-208ENST00000481047 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.93■■■■■ 5.1
MDK-208ENST00000481047 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.74■■■■■ 5.07
MDK-208ENST00000481047 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.58■■■■■ 5.05
MDK-208ENST00000481047 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.39■■■■■ 5.02
MDK-208ENST00000481047 SCRIBQ14160 1630 aa46.2■■■■■ 4.99
MDK-208ENST00000481047 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.12■■■■■ 4.97
MDK-208ENST00000481047 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.99■■■■■ 4.95
MDK-208ENST00000481047 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.26■■■■■ 4.84
MDK-208ENST00000481047 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.18■■■■■ 4.82
MDK-208ENST00000481047 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.97■■■■■ 4.79
MDK-208ENST00000481047 SMARCA4P51532 1647 aa44.13■■■■■ 4.66
MDK-208ENST00000481047 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.05■■■■■ 4.64
MDK-208ENST00000481047 NCAPD3P42695 1498 aa44.02■■■■■ 4.64
MDK-208ENST00000481047 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.98■■■■■ 4.63
MDK-208ENST00000481047 SMARCA2P51531 1590 aa43.97■■■■■ 4.63
MDK-208ENST00000481047 HMGXB3Q12766 1538 aa43.81■■■■■ 4.6
MDK-208ENST00000481047 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.69■■■■■ 4.58
MDK-208ENST00000481047 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.68■■■■■ 4.58
MDK-208ENST00000481047 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.65■■■■■ 4.58
MDK-208ENST00000481047 WIZO95785 1651 aa43.21■■■■■ 4.51
MDK-208ENST00000481047 ERCC6Q03468 1493 aa43.18■■■■■ 4.5
MDK-208ENST00000481047 NESP48681 1621 aa43.08■■■■■ 4.49
MDK-208ENST00000481047 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.04■■■■■ 4.48
MDK-208ENST00000481047 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.97■■■■■ 4.47
MDK-208ENST00000481047 CUX2O14529 1486 aa42.85■■■■■ 4.45
MDK-208ENST00000481047 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
MDK-208ENST00000481047 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.73■■■■■ 4.43
MDK-208ENST00000481047 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.71■■■■■ 4.43
MDK-208ENST00000481047 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.58■■■■■ 4.41
MDK-208ENST00000481047 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
MDK-208ENST00000481047 CFTRP13569 1480 aa42.37■■■■■ 4.37
MDK-208ENST00000481047 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.3■■■■■ 4.36
MDK-208ENST00000481047 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.28■■■■■ 4.36
MDK-208ENST00000481047 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.26■■■■■ 4.36
MDK-208ENST00000481047 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.22■■■■■ 4.35
MDK-208ENST00000481047 WDR62O43379 1518 aa42.15■■■■■ 4.34
MDK-208ENST00000481047 PRDM2Q13029 1718 aa42.06■■■■■ 4.32
MDK-208ENST00000481047 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.95■■■■■ 4.31
MDK-208ENST00000481047 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
MDK-208ENST00000481047 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
MDK-208ENST00000481047 ABCC8Q09428 1581 aa41.54■■■■■ 4.24
MDK-208ENST00000481047 TOPBP1Q92547 1522 aa41.52■■■■■ 4.24
MDK-208ENST00000481047 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.46■■■■■ 4.23
MDK-208ENST00000481047 IFT140Q96RY7 1462 aa41.4■■■■■ 4.22
MDK-208ENST00000481047 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
MDK-208ENST00000481047 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
MDK-208ENST00000481047 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.17
MDK-208ENST00000481047 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
MDK-208ENST00000481047 CUX1P39880 1505 aa41.03■■■■■ 4.16
MDK-208ENST00000481047 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.99■■■■■ 4.15
MDK-208ENST00000481047 SOGA1O94964 1423 aa40.96■■■■■ 4.15
MDK-208ENST00000481047 OSCARQ8IYS5 282 aa40.96■■■■■ 4.15
MDK-208ENST00000481047 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.95■■■■■ 4.15
MDK-208ENST00000481047 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.9■■■■■ 4.143e-9■■■■■ 34.9
MDK-208ENST00000481047 WDR97A6NE52 1622 aa40.81■■■■■ 4.12
MDK-208ENST00000481047 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
MDK-208ENST00000481047 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.65■■■■■ 4.1
MDK-208ENST00000481047 CHD1O14646 1710 aa40.61■■■■■ 4.09
MDK-208ENST00000481047 TOP2BQ02880 1626 aa40.59■■■■■ 4.09
MDK-208ENST00000481047 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.59■■■■■ 4.09
MDK-208ENST00000481047 GRIN2BQ13224 1484 aa40.57■■■■■ 4.08
MDK-208ENST00000481047 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.57■■■■■ 4.08
MDK-208ENST00000481047 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.57■■■■■ 4.08
MDK-208ENST00000481047 FBLN2P98095 1184 aa40.56■■■■■ 4.08
MDK-208ENST00000481047 SYNJ1O43426 1573 aa40.53■■■■■ 4.08
MDK-208ENST00000481047 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
MDK-208ENST00000481047 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.5■■■■■ 4.07
MDK-208ENST00000481047 TRIM41Q8WV44 630 aa40.46■■■■■ 4.07
MDK-208ENST00000481047 PBRM1Q86U86 1689 aa40.45■■■■■ 4.07
MDK-208ENST00000481047 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.45■■■■■ 4.07
MDK-208ENST00000481047 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
MDK-208ENST00000481047 SYNJ2O15056 1496 aa40.35■■■■■ 4.05
MDK-208ENST00000481047 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.34■■■■■ 4.05
MDK-208ENST00000481047 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.34■■■■■ 4.05
MDK-208ENST00000481047 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.34■■■■■ 4.05
MDK-208ENST00000481047 ARHGEF11O15085 1522 aa40.31■■■■■ 4.04
MDK-208ENST00000481047 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.15■■■■■ 4.02
MDK-208ENST00000481047 ADAMTS12P58397 1594 aa40.11■■■■■ 4.01
MDK-208ENST00000481047 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.09■■■■■ 4.01
MDK-208ENST00000481047 GRIN2AQ12879 1464 aa40.03■■■■■ 4
MDK-208ENST00000481047 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.02■■■■■ 4
MDK-208ENST00000481047 ARAP1Q96P48 1450 aa39.94■■■■□ 3.98
MDK-208ENST00000481047 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.93■■■■□ 3.98
MDK-208ENST00000481047 NUP160Q12769 1436 aa39.85■■■■□ 3.97
MDK-208ENST00000481047 KIF27Q86VH2 1401 aa39.84■■■■□ 3.97
MDK-208ENST00000481047 CEP170Q5SW79 1584 aa39.83■■■■□ 3.97
MDK-208ENST00000481047 CUL7Q14999 1698 aa39.67■■■■□ 3.94
MDK-208ENST00000481047 IGF1RP08069 1367 aa39.66■■■■□ 3.94
MDK-208ENST00000481047 SHROOM2Q13796 1616 aa39.59■■■■□ 3.93
MDK-208ENST00000481047 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.53■■■■□ 3.92
MDK-208ENST00000481047 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.52■■■■□ 3.92
MDK-208ENST00000481047 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.46■■■■□ 3.91
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