RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479976.5

CHTF18-209, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF18, Length 1,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-209ENST00000479976 NISCHQ9Y2I1 1504 aa70.53■■■■■ 8.88
CHTF18-209ENST00000479976 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa63.04■■■■■ 7.68
CHTF18-209ENST00000479976 ABCC9O60706 1549 aa62.63■■■■■ 7.62
CHTF18-209ENST00000479976 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa59.82■■■■■ 7.17
CHTF18-209ENST00000479976 NACADO15069 1562 aa59.54■■■■■ 7.12
CHTF18-209ENST00000479976 DCAF8L2P0C7V8 631 aa59.42■■■■■ 7.1
CHTF18-209ENST00000479976 MYO15BQ96JP2 1530 aa58.88■■■■■ 7.02
CHTF18-209ENST00000479976 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP58.52■■■■■ 6.96
CHTF18-209ENST00000479976 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP58.44■■■■■ 6.95
CHTF18-209ENST00000479976 UNC13AQ9UPW8 1703 aa58.44■■■■■ 6.95
CHTF18-209ENST00000479976 DNAJC5BQ9UF47 199 aa58.41■■■■■ 6.94
CHTF18-209ENST00000479976 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa58.29■■■■■ 6.92
CHTF18-209ENST00000479976 BICRAQ9NZM4 1560 aa58.05■■■■■ 6.88
CHTF18-209ENST00000479976 SCRIBQ14160 1630 aa57.47■■■■■ 6.79
CHTF18-209ENST00000479976 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa57.32■■■■■ 6.77
CHTF18-209ENST00000479976 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa56.59■■■■■ 6.65
CHTF18-209ENST00000479976 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP56.59■■■■■ 6.65
CHTF18-209ENST00000479976 CECR2Q9BXF3 1484 aa56.39■■■■■ 6.62
CHTF18-209ENST00000479976 NCAPD3P42695 1498 aa54.98■■■■■ 6.39
CHTF18-209ENST00000479976 SMARCA4P51532 1647 aa54.89■■■■■ 6.38
CHTF18-209ENST00000479976 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa54.86■■■■■ 6.37
CHTF18-209ENST00000479976 SMARCA2P51531 1590 aa54.73■■■■■ 6.35
CHTF18-209ENST00000479976 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP54.71■■■■■ 6.35
CHTF18-209ENST00000479976 HMGXB3Q12766 1538 aa54.57■■■■■ 6.33
CHTF18-209ENST00000479976 PEG3Q9GZU2 1588 aa54.37■■■■■ 6.29
CHTF18-209ENST00000479976 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP54.35■■■■■ 6.29
CHTF18-209ENST00000479976 MROH2BQ7Z745 1585 aa54.34■■■■■ 6.29
CHTF18-209ENST00000479976 ERCC6Q03468 1493 aa54.05■■■■■ 6.24
CHTF18-209ENST00000479976 NESP48681 1621 aa53.93■■■■■ 6.22
CHTF18-209ENST00000479976 CUX2O14529 1486 aa53.8■■■■■ 6.2
CHTF18-209ENST00000479976 WIZO95785 1651 aa53.69■■■■■ 6.19
CHTF18-209ENST00000479976 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa53.64■■■■■ 6.18
CHTF18-209ENST00000479976 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP53.41■■■■■ 6.14
CHTF18-209ENST00000479976 PDS5BQ9NTI5 1447 aa53.36■■■■■ 6.13
CHTF18-209ENST00000479976 CADPSQ9ULU8 1353 aa53.35■■■■■ 6.13
CHTF18-209ENST00000479976 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa53.32■■■■■ 6.13
CHTF18-209ENST00000479976 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP53.25■■■■■ 6.12
CHTF18-209ENST00000479976 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa53.22■■■■■ 6.11
CHTF18-209ENST00000479976 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP53.04■■■■■ 6.08
CHTF18-209ENST00000479976 MRC2Q9UBG0 1479 aa52.82■■■■■ 6.05
CHTF18-209ENST00000479976 CFTRP13569 1480 aa52.82■■■■■ 6.05
CHTF18-209ENST00000479976 CEP164Q9UPV0 1460 aa52.71■■■■■ 6.03
CHTF18-209ENST00000479976 FANCD2Q9BXW9 1451 aa52.7■■■■■ 6.03
CHTF18-209ENST00000479976 WDR62O43379 1518 aa52.66■■■■■ 6.02
CHTF18-209ENST00000479976 CCDC88BA6NC98 1476 aa52.49■■■■■ 5.99
CHTF18-209ENST00000479976 PRDM2Q13029 1718 aa52.26■■■■■ 5.96
CHTF18-209ENST00000479976 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP52.23■■■■■ 5.95
CHTF18-209ENST00000479976 TOPBP1Q92547 1522 aa51.75■■■■■ 5.88
CHTF18-209ENST00000479976 ABCC8Q09428 1581 aa51.71■■■■■ 5.87
CHTF18-209ENST00000479976 IFT140Q96RY7 1462 aa51.65■■■■■ 5.86
CHTF18-209ENST00000479976 DNMBPQ6XZF7 1577 aa51.59■■■■■ 5.85
CHTF18-209ENST00000479976 OSCARQ8IYS5 282 aa51.51■■■■■ 5.84
CHTF18-209ENST00000479976 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP51.51■■■■■ 5.84
CHTF18-209ENST00000479976 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.43■■■■■ 5.82
CHTF18-209ENST00000479976 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP51.25■■■■■ 5.79
CHTF18-209ENST00000479976 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP51.25■■■■■ 5.79
CHTF18-209ENST00000479976 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP51.21■■■■■ 5.79
CHTF18-209ENST00000479976 TRIM41Q8WV44 630 aa51.14■■■■■ 5.78
CHTF18-209ENST00000479976 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP51.14■■■■■ 5.787e-7■■■□□ 16.7
CHTF18-209ENST00000479976 SOGA1O94964 1423 aa51.07■■■■■ 5.77
CHTF18-209ENST00000479976 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa51.07■■■■■ 5.77
CHTF18-209ENST00000479976 CUX1P39880 1505 aa51.02■■■■■ 5.76
CHTF18-209ENST00000479976 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50.99■■■■■ 5.75
CHTF18-209ENST00000479976 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP50.91■■■■■ 5.74
CHTF18-209ENST00000479976 WDR97A6NE52 1622 aa50.76■■■■■ 5.72
CHTF18-209ENST00000479976 FBLN2P98095 1184 aa50.75■■■■■ 5.71
CHTF18-209ENST00000479976 CHD1O14646 1710 aa50.75■■■■■ 5.71
CHTF18-209ENST00000479976 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa50.68■■■■■ 5.7
CHTF18-209ENST00000479976 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa50.68■■■■■ 5.7
CHTF18-209ENST00000479976 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa50.68■■■■■ 5.7
CHTF18-209ENST00000479976 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa50.59■■■■■ 5.69
CHTF18-209ENST00000479976 ARHGEF11O15085 1522 aa50.57■■■■■ 5.69
CHTF18-209ENST00000479976 GRIN2BQ13224 1484 aa50.55■■■■■ 5.68
CHTF18-209ENST00000479976 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP50.5■■■■■ 5.67
CHTF18-209ENST00000479976 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP50.47■■■■■ 5.67
CHTF18-209ENST00000479976 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa50.46■■■■■ 5.67
CHTF18-209ENST00000479976 GAPVD1Q14C86 1478 aa50.45■■■■■ 5.67
CHTF18-209ENST00000479976 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP50.37■■■■■ 5.65
CHTF18-209ENST00000479976 TOP2BQ02880 1626 aa50.33■■■■■ 5.65
CHTF18-209ENST00000479976 SYNJ2O15056 1496 aa50.33■■■■■ 5.65
CHTF18-209ENST00000479976 PBRM1Q86U86 1689 aa50.32■■■■■ 5.65
CHTF18-209ENST00000479976 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa50.31■■■■■ 5.64
CHTF18-209ENST00000479976 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa50.29■■■■■ 5.64
CHTF18-209ENST00000479976 SYNJ1O43426 1573 aa50.26■■■■■ 5.64
CHTF18-209ENST00000479976 CYB5RLQ6IPT4 315 aa50.26■■■■■ 5.64
CHTF18-209ENST00000479976 CLASP1Q7Z460 1538 aa50.19■■■■■ 5.62
CHTF18-209ENST00000479976 ARAP1Q96P48 1450 aa50.11■■■■■ 5.61
CHTF18-209ENST00000479976 GRIN2AQ12879 1464 aa49.88■■■■■ 5.58
CHTF18-209ENST00000479976 ADAMTS12P58397 1594 aa49.87■■■■■ 5.57
CHTF18-209ENST00000479976 ERICH3Q5RHP9 1530 aa49.83■■■■■ 5.57
CHTF18-209ENST00000479976 FHAD1B1AJZ9 1412 aa49.82■■■■■ 5.57
CHTF18-209ENST00000479976 NUP160Q12769 1436 aa49.71■■■■■ 5.55
CHTF18-209ENST00000479976 CEP170Q5SW79 1584 aa49.66■■■■■ 5.54
CHTF18-209ENST00000479976 TRHP20396 242 aaPredicted RBP49.55■■■■■ 5.52
CHTF18-209ENST00000479976 ERCC6L2Q5T890 1561 aa49.45■■■■■ 5.51
CHTF18-209ENST00000479976 SHROOM2Q13796 1616 aa49.41■■■■■ 5.5
CHTF18-209ENST00000479976 KIF27Q86VH2 1401 aa49.4■■■■■ 5.5
CHTF18-209ENST00000479976 IGF1RP08069 1367 aa49.36■■■■■ 5.49
CHTF18-209ENST00000479976 JPH4Q96JJ6 628 aa49.28■■■■■ 5.48
CHTF18-209ENST00000479976 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP49.21■■■■■ 5.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms