RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479499.1

LAMC1-204, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

TSL 3

Gene LAMC1, Length 700 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-204ENST00000479499 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.17■■■□□ 2.42
LAMC1-204ENST00000479499 ABCC9O60706 1549 aa27.22■■□□□ 1.95
LAMC1-204ENST00000479499 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.05■■□□□ 1.92
LAMC1-204ENST00000479499 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.81■■□□□ 1.72
LAMC1-204ENST00000479499 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.73■■□□□ 1.71
LAMC1-204ENST00000479499 NACADO15069 1562 aa25.62■■□□□ 1.69
LAMC1-204ENST00000479499 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.47■■□□□ 1.67
LAMC1-204ENST00000479499 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.35■■□□□ 1.65
LAMC1-204ENST00000479499 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.25■■□□□ 1.63
LAMC1-204ENST00000479499 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.24■■□□□ 1.63
LAMC1-204ENST00000479499 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.15■■□□□ 1.62
LAMC1-204ENST00000479499 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
LAMC1-204ENST00000479499 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.89■■□□□ 1.57
LAMC1-204ENST00000479499 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
LAMC1-204ENST00000479499 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.71■■□□□ 1.55
LAMC1-204ENST00000479499 SCRIBQ14160 1630 aa24.69■■□□□ 1.54
LAMC1-204ENST00000479499 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.57■■□□□ 1.52
LAMC1-204ENST00000479499 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.52■■□□□ 1.52
LAMC1-204ENST00000479499 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
LAMC1-204ENST00000479499 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.83■■□□□ 1.41
LAMC1-204ENST00000479499 NCAPD3P42695 1498 aa23.69■■□□□ 1.38
LAMC1-204ENST00000479499 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.62■■□□□ 1.37
LAMC1-204ENST00000479499 SMARCA4P51532 1647 aa23.54■■□□□ 1.36
LAMC1-204ENST00000479499 SMARCA2P51531 1590 aa23.49■■□□□ 1.35
LAMC1-204ENST00000479499 HMGXB3Q12766 1538 aa23.49■■□□□ 1.35
LAMC1-204ENST00000479499 CUX2O14529 1486 aa23.47■■□□□ 1.35
LAMC1-204ENST00000479499 ERCC6Q03468 1493 aa23.46■■□□□ 1.35
LAMC1-204ENST00000479499 NESP48681 1621 aa23.39■■□□□ 1.33
LAMC1-204ENST00000479499 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
LAMC1-204ENST00000479499 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
LAMC1-204ENST00000479499 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.31■■□□□ 1.32
LAMC1-204ENST00000479499 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.27■■□□□ 1.32
LAMC1-204ENST00000479499 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
LAMC1-204ENST00000479499 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.13■■□□□ 1.29
LAMC1-204ENST00000479499 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.05■■□□□ 1.28
LAMC1-204ENST00000479499 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.02■■□□□ 1.28
LAMC1-204ENST00000479499 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23■■□□□ 1.27
LAMC1-204ENST00000479499 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.96■■□□□ 1.27
LAMC1-204ENST00000479499 WIZO95785 1651 aa22.95■■□□□ 1.26
LAMC1-204ENST00000479499 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.83■■□□□ 1.25
LAMC1-204ENST00000479499 WDR62O43379 1518 aa22.78■■□□□ 1.24
LAMC1-204ENST00000479499 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
LAMC1-204ENST00000479499 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.71■■□□□ 1.23
LAMC1-204ENST00000479499 CFTRP13569 1480 aa22.69■■□□□ 1.22
LAMC1-204ENST00000479499 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.69■■□□□ 1.22
LAMC1-204ENST00000479499 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
LAMC1-204ENST00000479499 TRIM41Q8WV44 630 aa22.59■■□□□ 1.21
LAMC1-204ENST00000479499 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
LAMC1-204ENST00000479499 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.42■■□□□ 1.18
LAMC1-204ENST00000479499 OSCARQ8IYS5 282 aa22.38■■□□□ 1.17
LAMC1-204ENST00000479499 PRDM2Q13029 1718 aa22.36■■□□□ 1.17
LAMC1-204ENST00000479499 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
LAMC1-204ENST00000479499 TOPBP1Q92547 1522 aa22.26■■□□□ 1.15
LAMC1-204ENST00000479499 IFT140Q96RY7 1462 aa22.26■■□□□ 1.15
LAMC1-204ENST00000479499 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.16■■□□□ 1.14
LAMC1-204ENST00000479499 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.16■■□□□ 1.14
LAMC1-204ENST00000479499 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.16■■□□□ 1.14
LAMC1-204ENST00000479499 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.15■■□□□ 1.14
LAMC1-204ENST00000479499 ABCC8Q09428 1581 aa22.14■■□□□ 1.13
LAMC1-204ENST00000479499 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
LAMC1-204ENST00000479499 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
LAMC1-204ENST00000479499 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
LAMC1-204ENST00000479499 ARHGEF11O15085 1522 aa22.05■■□□□ 1.12
LAMC1-204ENST00000479499 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
LAMC1-204ENST00000479499 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.97■■□□□ 1.11
LAMC1-204ENST00000479499 CHD1O14646 1710 aa21.95■■□□□ 1.1
LAMC1-204ENST00000479499 SOGA1O94964 1423 aa21.91■■□□□ 1.1
LAMC1-204ENST00000479499 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
LAMC1-204ENST00000479499 FBLN2P98095 1184 aa21.89■■□□□ 1.09
LAMC1-204ENST00000479499 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.89■■□□□ 1.09
LAMC1-204ENST00000479499 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.88■■□□□ 1.09
LAMC1-204ENST00000479499 CUX1P39880 1505 aa21.86■■□□□ 1.09
LAMC1-204ENST00000479499 ARAP1Q96P48 1450 aa21.85■■□□□ 1.09
LAMC1-204ENST00000479499 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.82■■□□□ 1.08
LAMC1-204ENST00000479499 WDR97A6NE52 1622 aa21.77■■□□□ 1.08
LAMC1-204ENST00000479499 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.75■■□□□ 1.07
LAMC1-204ENST00000479499 GRIN2BQ13224 1484 aa21.73■■□□□ 1.07
LAMC1-204ENST00000479499 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
LAMC1-204ENST00000479499 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
LAMC1-204ENST00000479499 SYNJ2O15056 1496 aa21.67■■□□□ 1.06
LAMC1-204ENST00000479499 SYNJ1O43426 1573 aa21.66■■□□□ 1.06
LAMC1-204ENST00000479499 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.64■■□□□ 1.06
LAMC1-204ENST00000479499 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
LAMC1-204ENST00000479499 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
LAMC1-204ENST00000479499 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.62■■□□□ 1.05
LAMC1-204ENST00000479499 PBRM1Q86U86 1689 aa21.6■■□□□ 1.05
LAMC1-204ENST00000479499 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.59■■□□□ 1.05
LAMC1-204ENST00000479499 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
LAMC1-204ENST00000479499 GRIN2AQ12879 1464 aa21.46■■□□□ 1.03
LAMC1-204ENST00000479499 TOP2BQ02880 1626 aa21.44■■□□□ 1.02
LAMC1-204ENST00000479499 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.44■■□□□ 1.02
LAMC1-204ENST00000479499 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.44■■□□□ 1.02
LAMC1-204ENST00000479499 ADAMTS12P58397 1594 aa21.43■■□□□ 1.02
LAMC1-204ENST00000479499 NUP160Q12769 1436 aa21.41■■□□□ 1.02
LAMC1-204ENST00000479499 CEP170Q5SW79 1584 aa21.4■■□□□ 1.02
LAMC1-204ENST00000479499 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.36■■□□□ 1.01
LAMC1-204ENST00000479499 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.32■■□□□ 1
LAMC1-204ENST00000479499 SHROOM2Q13796 1616 aa21.31■■□□□ 1
LAMC1-204ENST00000479499 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
LAMC1-204ENST00000479499 JPH4Q96JJ6 628 aa21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.4 ms