RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479353.5

PTGER3-210, Transcript of prostaglandin E receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTGER3, Length 1,895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3-210ENST00000479353 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.78■■■■■ 5.08
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PTGER3-210ENST00000479353 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.38■■■■□ 3.74
PTGER3-210ENST00000479353 ABCC9O60706 1549 aa38.17■■■■□ 3.7
PTGER3-210ENST00000479353 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.06■■■■□ 3.68
PTGER3-210ENST00000479353 NACADO15069 1562 aa37.75■■■■□ 3.63
PTGER3-210ENST00000479353 SCRIBQ14160 1630 aa37.48■■■■□ 3.59
PTGER3-210ENST00000479353 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.34■■■■□ 3.57
PTGER3-210ENST00000479353 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
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PTGER3-210ENST00000479353 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.38■■■■□ 3.41
PTGER3-210ENST00000479353 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.35■■■■□ 3.41
PTGER3-210ENST00000479353 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.2■■■■□ 3.39
PTGER3-210ENST00000479353 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
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PTGER3-210ENST00000479353 WIZO95785 1651 aa35.95■■■■□ 3.35
PTGER3-210ENST00000479353 SMARCA4P51532 1647 aa35.93■■■■□ 3.34
PTGER3-210ENST00000479353 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.64■■■■□ 3.3
PTGER3-210ENST00000479353 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
PTGER3-210ENST00000479353 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.47■■■■□ 3.27
PTGER3-210ENST00000479353 SMARCA2P51531 1590 aa35.25■■■■□ 3.23
PTGER3-210ENST00000479353 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.22■■■■□ 3.23
PTGER3-210ENST00000479353 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
PTGER3-210ENST00000479353 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.16■■■■□ 3.22
PTGER3-210ENST00000479353 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.19
PTGER3-210ENST00000479353 HMGXB3Q12766 1538 aa34.84■■■■□ 3.17
PTGER3-210ENST00000479353 NCAPD3P42695 1498 aa34.84■■■■□ 3.17
PTGER3-210ENST00000479353 TRIM41Q8WV44 630 aa34.73■■■■□ 3.15
PTGER3-210ENST00000479353 ABCC8Q09428 1581 aa34.59■■■■□ 3.13
PTGER3-210ENST00000479353 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.57■■■■□ 3.13
PTGER3-210ENST00000479353 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.31■■■■□ 3.08
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PTGER3-210ENST00000479353 SYNJ1O43426 1573 aa34.18■■■■□ 3.06
PTGER3-210ENST00000479353 CFTRP13569 1480 aa34.17■■■■□ 3.06
PTGER3-210ENST00000479353 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
PTGER3-210ENST00000479353 PRDM2Q13029 1718 aa34.12■■■■□ 3.05
PTGER3-210ENST00000479353 TOP2BQ02880 1626 aa33.97■■■■□ 3.03
PTGER3-210ENST00000479353 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.96■■■■□ 3.03
PTGER3-210ENST00000479353 SOGA1O94964 1423 aa33.96■■■■□ 3.03
PTGER3-210ENST00000479353 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.94■■■■□ 3.02
PTGER3-210ENST00000479353 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.86■■■■□ 3.01
PTGER3-210ENST00000479353 EEA1Q15075 1411 aa33.84■■■■□ 3.01
PTGER3-210ENST00000479353 CUX1P39880 1505 aa33.83■■■■□ 3.01
PTGER3-210ENST00000479353 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.69■■■□□ 2.98
PTGER3-210ENST00000479353 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.67■■■□□ 2.98
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PTGER3-210ENST00000479353 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.63■■■□□ 2.97
PTGER3-210ENST00000479353 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.61■■■□□ 2.97
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PTGER3-210ENST00000479353 CEP162Q5TB80 1403 aa33.27■■■□□ 2.92
PTGER3-210ENST00000479353 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.27■■■□□ 2.92
PTGER3-210ENST00000479353 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.26■■■□□ 2.91
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PTGER3-210ENST00000479353 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.18■■■□□ 2.9
PTGER3-210ENST00000479353 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.18■■■□□ 2.9
PTGER3-210ENST00000479353 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.08■■■□□ 2.89
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PTGER3-210ENST00000479353 WDR97A6NE52 1622 aa33.05■■■□□ 2.88
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PTGER3-210ENST00000479353 PCGF6Q9BYE7 350 aa33■■■□□ 2.87
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PTGER3-210ENST00000479353 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.5■■■□□ 2.79
PTGER3-210ENST00000479353 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.45■■■□□ 2.78
PTGER3-210ENST00000479353 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.42■■■□□ 2.78
PTGER3-210ENST00000479353 ADAMTS12P58397 1594 aa32.38■■■□□ 2.77
PTGER3-210ENST00000479353 GRIN2BQ13224 1484 aa32.35■■■□□ 2.77
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