RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477735.1

PIK3CA-204, Transcript of phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene PIK3CA, Length 245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CA-204ENST00000477735 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.31■■■■■ 5.16
PIK3CA-204ENST00000477735 ABCC9O60706 1549 aa43.32■■■■■ 4.53
PIK3CA-204ENST00000477735 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.66■■■■■ 4.42
PIK3CA-204ENST00000477735 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.27■■■■■ 4.2
PIK3CA-204ENST00000477735 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.94■■■■■ 4.14
PIK3CA-204ENST00000477735 NACADO15069 1562 aa40.53■■■■■ 4.08
PIK3CA-204ENST00000477735 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.28■■■■■ 4.04
PIK3CA-204ENST00000477735 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.24■■■■■ 4.03
PIK3CA-204ENST00000477735 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.95■■■■□ 3.99
PIK3CA-204ENST00000477735 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.79■■■■□ 3.96
PIK3CA-204ENST00000477735 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.78■■■■□ 3.96
PIK3CA-204ENST00000477735 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.18■■■■□ 3.86
PIK3CA-204ENST00000477735 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.11■■■■□ 3.85
PIK3CA-204ENST00000477735 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.08■■■■□ 3.85
PIK3CA-204ENST00000477735 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.05■■■■□ 3.84
PIK3CA-204ENST00000477735 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.04■■■■□ 3.84
PIK3CA-204ENST00000477735 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.86■■■■□ 3.81
PIK3CA-204ENST00000477735 SCRIBQ14160 1630 aa38.84■■■■□ 3.81
PIK3CA-204ENST00000477735 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.35■■■■□ 3.73
PIK3CA-204ENST00000477735 CUX2O14529 1486 aa37.59■■■■□ 3.61
PIK3CA-204ENST00000477735 NCAPD3P42695 1498 aa37.46■■■■□ 3.59
PIK3CA-204ENST00000477735 ERCC6Q03468 1493 aa37.44■■■■□ 3.58
PIK3CA-204ENST00000477735 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.25■■■■□ 3.55
PIK3CA-204ENST00000477735 SMARCA2P51531 1590 aa37.08■■■■□ 3.53
PIK3CA-204ENST00000477735 HMGXB3Q12766 1538 aa37.07■■■■□ 3.53
PIK3CA-204ENST00000477735 NESP48681 1621 aa37.04■■■■□ 3.52
PIK3CA-204ENST00000477735 SMARCA4P51532 1647 aa37■■■■□ 3.51
PIK3CA-204ENST00000477735 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.49
PIK3CA-204ENST00000477735 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
PIK3CA-204ENST00000477735 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
PIK3CA-204ENST00000477735 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.67■■■■□ 3.46
PIK3CA-204ENST00000477735 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.66■■■■□ 3.46
PIK3CA-204ENST00000477735 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.52■■■■□ 3.44
PIK3CA-204ENST00000477735 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.48■■■■□ 3.43
PIK3CA-204ENST00000477735 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.44■■■■□ 3.42
PIK3CA-204ENST00000477735 TRIM41Q8WV44 630 aa36.38■■■■□ 3.41
PIK3CA-204ENST00000477735 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.3■■■■□ 3.4
PIK3CA-204ENST00000477735 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.22■■■■□ 3.39
PIK3CA-204ENST00000477735 WDR62O43379 1518 aa36.13■■■■□ 3.38
PIK3CA-204ENST00000477735 WIZO95785 1651 aa35.94■■■■□ 3.34
PIK3CA-204ENST00000477735 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.94■■■■□ 3.34
PIK3CA-204ENST00000477735 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.86■■■■□ 3.33
PIK3CA-204ENST00000477735 OSCARQ8IYS5 282 aa35.83■■■■□ 3.33
PIK3CA-204ENST00000477735 CFTRP13569 1480 aa35.74■■■■□ 3.31
PIK3CA-204ENST00000477735 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
PIK3CA-204ENST00000477735 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
PIK3CA-204ENST00000477735 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
PIK3CA-204ENST00000477735 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.35■■■■□ 3.25
PIK3CA-204ENST00000477735 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.35■■■■□ 3.25
PIK3CA-204ENST00000477735 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.35■■■■□ 3.25
PIK3CA-204ENST00000477735 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
PIK3CA-204ENST00000477735 IFT140Q96RY7 1462 aa35.26■■■■□ 3.23
PIK3CA-204ENST00000477735 PRDM2Q13029 1718 aa35.2■■■■□ 3.23
PIK3CA-204ENST00000477735 ARHGEF11O15085 1522 aa35.2■■■■□ 3.23
PIK3CA-204ENST00000477735 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.1■■■■□ 3.21
PIK3CA-204ENST00000477735 TOPBP1Q92547 1522 aa35.1■■■■□ 3.21
PIK3CA-204ENST00000477735 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.03■■■■□ 3.2
PIK3CA-204ENST00000477735 ABCC8Q09428 1581 aa35■■■■□ 3.19
PIK3CA-204ENST00000477735 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
PIK3CA-204ENST00000477735 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.9■■■■□ 3.18
PIK3CA-204ENST00000477735 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.89■■■■□ 3.18
PIK3CA-204ENST00000477735 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
PIK3CA-204ENST00000477735 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
PIK3CA-204ENST00000477735 CHD1O14646 1710 aa34.82■■■■□ 3.16
PIK3CA-204ENST00000477735 ARAP1Q96P48 1450 aa34.82■■■■□ 3.16
PIK3CA-204ENST00000477735 FBLN2P98095 1184 aa34.79■■■■□ 3.16
PIK3CA-204ENST00000477735 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
PIK3CA-204ENST00000477735 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.6■■■■□ 3.13
PIK3CA-204ENST00000477735 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
PIK3CA-204ENST00000477735 SOGA1O94964 1423 aa34.56■■■■□ 3.12
PIK3CA-204ENST00000477735 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.48■■■■□ 3.11
PIK3CA-204ENST00000477735 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.46■■■■□ 3.11
PIK3CA-204ENST00000477735 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
PIK3CA-204ENST00000477735 WDR97A6NE52 1622 aa34.41■■■■□ 3.1
PIK3CA-204ENST00000477735 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.39■■■■□ 3.1
PIK3CA-204ENST00000477735 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
PIK3CA-204ENST00000477735 SYNJ1O43426 1573 aa34.37■■■■□ 3.09
PIK3CA-204ENST00000477735 GRIN2BQ13224 1484 aa34.32■■■■□ 3.08
PIK3CA-204ENST00000477735 CUX1P39880 1505 aa34.28■■■■□ 3.08
PIK3CA-204ENST00000477735 SYNJ2O15056 1496 aa34.27■■■■□ 3.08
PIK3CA-204ENST00000477735 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
PIK3CA-204ENST00000477735 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.16■■■■□ 3.06
PIK3CA-204ENST00000477735 PBRM1Q86U86 1689 aa34.06■■■■□ 3.04
PIK3CA-204ENST00000477735 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.98■■■■□ 3.03
PIK3CA-204ENST00000477735 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.94■■■■□ 3.02
PIK3CA-204ENST00000477735 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.89■■■■□ 3.02
PIK3CA-204ENST00000477735 GRIN2AQ12879 1464 aa33.87■■■■□ 3.01
PIK3CA-204ENST00000477735 NUP160Q12769 1436 aa33.8■■■■□ 3
PIK3CA-204ENST00000477735 CEP170Q5SW79 1584 aa33.78■■■■□ 3
PIK3CA-204ENST00000477735 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.74■■■□□ 2.99
PIK3CA-204ENST00000477735 ADAMTS12P58397 1594 aa33.73■■■□□ 2.99
PIK3CA-204ENST00000477735 SHROOM2Q13796 1616 aa33.68■■■□□ 2.98
PIK3CA-204ENST00000477735 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.67■■■□□ 2.98
PIK3CA-204ENST00000477735 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.53■■■□□ 2.96
PIK3CA-204ENST00000477735 TOP2BQ02880 1626 aa33.53■■■□□ 2.96
PIK3CA-204ENST00000477735 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.53■■■□□ 2.96
PIK3CA-204ENST00000477735 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
PIK3CA-204ENST00000477735 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.52■■■□□ 2.96
PIK3CA-204ENST00000477735 JPH4Q96JJ6 628 aa33.49■■■□□ 2.95
PIK3CA-204ENST00000477735 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.46■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms