RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477486.1

RBMS1-211, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene RBMS1, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-211ENST00000477486 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.32■■■■■ 6.29
RBMS1-211ENST00000477486 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.55■■■■■ 5.36
RBMS1-211ENST00000477486 ABCC9O60706 1549 aa48.43■■■■■ 5.34
RBMS1-211ENST00000477486 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.17■■■■■ 4.98
RBMS1-211ENST00000477486 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.09■■■■■ 4.97
RBMS1-211ENST00000477486 NACADO15069 1562 aa45.89■■■■■ 4.94
RBMS1-211ENST00000477486 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.26■■■■■ 4.84
RBMS1-211ENST00000477486 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.23■■■■■ 4.83
RBMS1-211ENST00000477486 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.16■■■■■ 4.82
RBMS1-211ENST00000477486 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.04■■■■■ 4.8
RBMS1-211ENST00000477486 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.03■■■■■ 4.8
RBMS1-211ENST00000477486 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.8■■■■■ 4.76
RBMS1-211ENST00000477486 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.71■■■■■ 4.75
RBMS1-211ENST00000477486 SCRIBQ14160 1630 aa44.37■■■■■ 4.69
RBMS1-211ENST00000477486 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.13■■■■■ 4.65
RBMS1-211ENST00000477486 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.7■■■■■ 4.59
RBMS1-211ENST00000477486 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.65■■■■■ 4.58
RBMS1-211ENST00000477486 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.57■■■■■ 4.57
RBMS1-211ENST00000477486 NCAPD3P42695 1498 aa42.36■■■■■ 4.37
RBMS1-211ENST00000477486 SMARCA4P51532 1647 aa42.29■■■■■ 4.36
RBMS1-211ENST00000477486 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.29■■■■■ 4.36
RBMS1-211ENST00000477486 SMARCA2P51531 1590 aa42.2■■■■■ 4.35
RBMS1-211ENST00000477486 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.16■■■■■ 4.34
RBMS1-211ENST00000477486 HMGXB3Q12766 1538 aa42.03■■■■■ 4.32
RBMS1-211ENST00000477486 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
RBMS1-211ENST00000477486 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.87■■■■■ 4.29
RBMS1-211ENST00000477486 ERCC6Q03468 1493 aa41.85■■■■■ 4.29
RBMS1-211ENST00000477486 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.81■■■■■ 4.28
RBMS1-211ENST00000477486 NESP48681 1621 aa41.65■■■■■ 4.26
RBMS1-211ENST00000477486 CUX2O14529 1486 aa41.54■■■■■ 4.24
RBMS1-211ENST00000477486 WIZO95785 1651 aa41.4■■■■■ 4.22
RBMS1-211ENST00000477486 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.37■■■■■ 4.21
RBMS1-211ENST00000477486 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.29■■■■■ 4.2
RBMS1-211ENST00000477486 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.2■■■■■ 4.19
RBMS1-211ENST00000477486 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.15■■■■■ 4.18
RBMS1-211ENST00000477486 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
RBMS1-211ENST00000477486 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.08■■■■■ 4.17
RBMS1-211ENST00000477486 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
RBMS1-211ENST00000477486 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
RBMS1-211ENST00000477486 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.77■■■■■ 4.12
RBMS1-211ENST00000477486 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.7■■■■■ 4.11
RBMS1-211ENST00000477486 CFTRP13569 1480 aa40.69■■■■■ 4.1
RBMS1-211ENST00000477486 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.68■■■■■ 4.1
RBMS1-211ENST00000477486 WDR62O43379 1518 aa40.6■■■■■ 4.09
RBMS1-211ENST00000477486 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.45■■■■■ 4.07
RBMS1-211ENST00000477486 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
RBMS1-211ENST00000477486 PRDM2Q13029 1718 aa40.25■■■■■ 4.03
RBMS1-211ENST00000477486 TOPBP1Q92547 1522 aa39.91■■■■□ 3.98
RBMS1-211ENST00000477486 ABCC8Q09428 1581 aa39.89■■■■□ 3.98
RBMS1-211ENST00000477486 OSCARQ8IYS5 282 aa39.88■■■■□ 3.97
RBMS1-211ENST00000477486 IFT140Q96RY7 1462 aa39.87■■■■□ 3.97
RBMS1-211ENST00000477486 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
RBMS1-211ENST00000477486 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.77■■■■□ 3.96
RBMS1-211ENST00000477486 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
RBMS1-211ENST00000477486 TRIM41Q8WV44 630 aa39.75■■■■□ 3.95
RBMS1-211ENST00000477486 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.92
RBMS1-211ENST00000477486 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.92
RBMS1-211ENST00000477486 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.49■■■■□ 3.91
RBMS1-211ENST00000477486 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
RBMS1-211ENST00000477486 SOGA1O94964 1423 aa39.44■■■■□ 3.9
RBMS1-211ENST00000477486 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.42■■■■□ 3.9
RBMS1-211ENST00000477486 FBLN2P98095 1184 aa39.36■■■■□ 3.89
RBMS1-211ENST00000477486 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.34■■■■□ 3.89
RBMS1-211ENST00000477486 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
RBMS1-211ENST00000477486 CUX1P39880 1505 aa39.31■■■■□ 3.88
RBMS1-211ENST00000477486 CHD1O14646 1710 aa39.19■■■■□ 3.86
RBMS1-211ENST00000477486 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.16■■■■□ 3.86
RBMS1-211ENST00000477486 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.16■■■■□ 3.86
RBMS1-211ENST00000477486 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.16■■■■□ 3.86
RBMS1-211ENST00000477486 WDR97A6NE52 1622 aa39.07■■■■□ 3.85
RBMS1-211ENST00000477486 ARHGEF11O15085 1522 aa39.07■■■■□ 3.84
RBMS1-211ENST00000477486 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.06■■■■□ 3.84
RBMS1-211ENST00000477486 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.05■■■■□ 3.84
RBMS1-211ENST00000477486 GRIN2BQ13224 1484 aa39.01■■■■□ 3.84
RBMS1-211ENST00000477486 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.96■■■■□ 3.83
RBMS1-211ENST00000477486 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.95■■■■□ 3.83
RBMS1-211ENST00000477486 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.92■■■■□ 3.82
RBMS1-211ENST00000477486 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.87■■■■□ 3.81
RBMS1-211ENST00000477486 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.87■■■■□ 3.81
RBMS1-211ENST00000477486 SYNJ2O15056 1496 aa38.83■■■■□ 3.81
RBMS1-211ENST00000477486 PBRM1Q86U86 1689 aa38.82■■■■□ 3.81
RBMS1-211ENST00000477486 SYNJ1O43426 1573 aa38.79■■■■□ 3.8
RBMS1-211ENST00000477486 TOP2BQ02880 1626 aa38.75■■■■□ 3.79
RBMS1-211ENST00000477486 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.74■■■■□ 3.79
RBMS1-211ENST00000477486 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.73■■■■□ 3.79
RBMS1-211ENST00000477486 ARAP1Q96P48 1450 aa38.69■■■■□ 3.78
RBMS1-211ENST00000477486 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.68■■■■□ 3.78
RBMS1-211ENST00000477486 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.5■■■■□ 3.75
RBMS1-211ENST00000477486 GRIN2AQ12879 1464 aa38.48■■■■□ 3.75
RBMS1-211ENST00000477486 ADAMTS12P58397 1594 aa38.44■■■■□ 3.74
RBMS1-211ENST00000477486 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.44■■■■□ 3.74
RBMS1-211ENST00000477486 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.39■■■■□ 3.74
RBMS1-211ENST00000477486 CEP170Q5SW79 1584 aa38.3■■■■□ 3.72
RBMS1-211ENST00000477486 NUP160Q12769 1436 aa38.29■■■■□ 3.72
RBMS1-211ENST00000477486 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.15■■■■□ 3.7
RBMS1-211ENST00000477486 KIF27Q86VH2 1401 aa38.12■■■■□ 3.69
RBMS1-211ENST00000477486 JPH4Q96JJ6 628 aa38.08■■■■□ 3.69
RBMS1-211ENST00000477486 SHROOM2Q13796 1616 aa38.05■■■■□ 3.68
RBMS1-211ENST00000477486 IGF1RP08069 1367 aa38.04■■■■□ 3.68
RBMS1-211ENST00000477486 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.03■■■■□ 3.68
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