RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476675.5

PRKCE-208, Transcript of protein kinase C epsilon, humanhuman

TSL 4

Gene PRKCE, Length 570 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCE-208ENST00000476675 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.61■■■■■ 5.53
PRKCE-208ENST00000476675 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.21■■■■■ 4.67
PRKCE-208ENST00000476675 ABCC9O60706 1549 aa43.75■■■■■ 4.59
PRKCE-208ENST00000476675 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.79■■■■■ 4.28
PRKCE-208ENST00000476675 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.65■■■■■ 4.26
PRKCE-208ENST00000476675 NACADO15069 1562 aa41.63■■■■■ 4.26
PRKCE-208ENST00000476675 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
PRKCE-208ENST00000476675 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.22■■■■■ 4.19
PRKCE-208ENST00000476675 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.95■■■■■ 4.15
PRKCE-208ENST00000476675 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.94■■■■■ 4.14
PRKCE-208ENST00000476675 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.85■■■■■ 4.13
PRKCE-208ENST00000476675 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.66■■■■■ 4.1
PRKCE-208ENST00000476675 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.55■■■■■ 4.08
PRKCE-208ENST00000476675 SCRIBQ14160 1630 aa40.45■■■■■ 4.07
PRKCE-208ENST00000476675 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.99■■■■□ 3.99
PRKCE-208ENST00000476675 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.92
PRKCE-208ENST00000476675 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.51■■■■□ 3.92
PRKCE-208ENST00000476675 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.3■■■■□ 3.88
PRKCE-208ENST00000476675 SMARCA4P51532 1647 aa38.6■■■■□ 3.77
PRKCE-208ENST00000476675 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.47■■■■□ 3.75
PRKCE-208ENST00000476675 NCAPD3P42695 1498 aa38.45■■■■□ 3.75
PRKCE-208ENST00000476675 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.43■■■■□ 3.74
PRKCE-208ENST00000476675 SMARCA2P51531 1590 aa38.33■■■■□ 3.73
PRKCE-208ENST00000476675 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.31■■■■□ 3.72
PRKCE-208ENST00000476675 HMGXB3Q12766 1538 aa38.22■■■■□ 3.71
PRKCE-208ENST00000476675 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.15■■■■□ 3.7
PRKCE-208ENST00000476675 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.11■■■■□ 3.69
PRKCE-208ENST00000476675 WIZO95785 1651 aa37.88■■■■□ 3.65
PRKCE-208ENST00000476675 NESP48681 1621 aa37.79■■■■□ 3.64
PRKCE-208ENST00000476675 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.7■■■■□ 3.62
PRKCE-208ENST00000476675 ERCC6Q03468 1493 aa37.65■■■■□ 3.62
PRKCE-208ENST00000476675 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.47■■■■□ 3.59
PRKCE-208ENST00000476675 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
PRKCE-208ENST00000476675 CUX2O14529 1486 aa37.33■■■■□ 3.57
PRKCE-208ENST00000476675 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.31■■■■□ 3.56
PRKCE-208ENST00000476675 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.28■■■■□ 3.56
PRKCE-208ENST00000476675 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
PRKCE-208ENST00000476675 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.22■■■■□ 3.55
PRKCE-208ENST00000476675 CFTRP13569 1480 aa37.03■■■■□ 3.52
PRKCE-208ENST00000476675 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.98■■■■□ 3.51
PRKCE-208ENST00000476675 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.93■■■■□ 3.5
PRKCE-208ENST00000476675 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.93■■■■□ 3.5
PRKCE-208ENST00000476675 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.89■■■■□ 3.5
PRKCE-208ENST00000476675 WDR62O43379 1518 aa36.82■■■■□ 3.48
PRKCE-208ENST00000476675 PRDM2Q13029 1718 aa36.7■■■■□ 3.47
PRKCE-208ENST00000476675 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.66■■■■□ 3.46
PRKCE-208ENST00000476675 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
PRKCE-208ENST00000476675 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.44
PRKCE-208ENST00000476675 TOPBP1Q92547 1522 aa36.31■■■■□ 3.4
PRKCE-208ENST00000476675 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.21■■■■□ 3.39
PRKCE-208ENST00000476675 ABCC8Q09428 1581 aa36.14■■■■□ 3.38
PRKCE-208ENST00000476675 IFT140Q96RY7 1462 aa36.11■■■■□ 3.37
PRKCE-208ENST00000476675 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
PRKCE-208ENST00000476675 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
PRKCE-208ENST00000476675 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
PRKCE-208ENST00000476675 CUX1P39880 1505 aa35.95■■■■□ 3.35
PRKCE-208ENST00000476675 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
PRKCE-208ENST00000476675 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.89■■■■□ 3.34
PRKCE-208ENST00000476675 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.86■■■■□ 3.33
PRKCE-208ENST00000476675 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.83■■■■□ 3.33
PRKCE-208ENST00000476675 SOGA1O94964 1423 aa35.8■■■■□ 3.32
PRKCE-208ENST00000476675 OSCARQ8IYS5 282 aa35.72■■■■□ 3.31
PRKCE-208ENST00000476675 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
PRKCE-208ENST00000476675 WDR97A6NE52 1622 aa35.57■■■■□ 3.29
PRKCE-208ENST00000476675 CHD1O14646 1710 aa35.53■■■■□ 3.28
PRKCE-208ENST00000476675 SYNJ1O43426 1573 aa35.53■■■■□ 3.28
PRKCE-208ENST00000476675 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.51■■■■□ 3.28
PRKCE-208ENST00000476675 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.48■■■■□ 3.27
PRKCE-208ENST00000476675 TOP2BQ02880 1626 aa35.48■■■■□ 3.27
PRKCE-208ENST00000476675 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.48■■■■□ 3.27
PRKCE-208ENST00000476675 FBLN2P98095 1184 aa35.44■■■■□ 3.26
PRKCE-208ENST00000476675 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.43■■■■□ 3.26
PRKCE-208ENST00000476675 GRIN2BQ13224 1484 aa35.41■■■■□ 3.26
PRKCE-208ENST00000476675 TRIM41Q8WV44 630 aa35.39■■■■□ 3.26
PRKCE-208ENST00000476675 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.38■■■■□ 3.25
PRKCE-208ENST00000476675 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.37■■■■□ 3.25
PRKCE-208ENST00000476675 PBRM1Q86U86 1689 aa35.36■■■■□ 3.25
PRKCE-208ENST00000476675 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
PRKCE-208ENST00000476675 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.29■■■■□ 3.24
PRKCE-208ENST00000476675 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.29■■■■□ 3.24
PRKCE-208ENST00000476675 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.29■■■■□ 3.24
PRKCE-208ENST00000476675 ARHGEF11O15085 1522 aa35.23■■■■□ 3.23
PRKCE-208ENST00000476675 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
PRKCE-208ENST00000476675 SYNJ2O15056 1496 aa35.22■■■■□ 3.23
PRKCE-208ENST00000476675 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.11■■■■□ 3.21
PRKCE-208ENST00000476675 ADAMTS12P58397 1594 aa35.07■■■■□ 3.2
PRKCE-208ENST00000476675 GRIN2AQ12879 1464 aa34.98■■■■□ 3.19
PRKCE-208ENST00000476675 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.98■■■■□ 3.19
PRKCE-208ENST00000476675 ARAP1Q96P48 1450 aa34.96■■■■□ 3.19
PRKCE-208ENST00000476675 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.93■■■■□ 3.18
PRKCE-208ENST00000476675 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.92■■■■□ 3.18
PRKCE-208ENST00000476675 CEP170Q5SW79 1584 aa34.87■■■■□ 3.17
PRKCE-208ENST00000476675 NUP160Q12769 1436 aa34.83■■■■□ 3.17
PRKCE-208ENST00000476675 KIF27Q86VH2 1401 aa34.76■■■■□ 3.16
PRKCE-208ENST00000476675 IGF1RP08069 1367 aa34.72■■■■□ 3.15
PRKCE-208ENST00000476675 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.71■■■■□ 3.15
PRKCE-208ENST00000476675 SHROOM2Q13796 1616 aa34.62■■■■□ 3.13
PRKCE-208ENST00000476675 CUL7Q14999 1698 aa34.59■■■■□ 3.13
PRKCE-208ENST00000476675 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.56■■■■□ 3.12
PRKCE-208ENST00000476675 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.49■■■■□ 3.11
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