RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476355.5

ETV1-218, Transcript of ETS variant 1, humanhuman

TSL 3

Gene ETV1, Length 846 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1-218ENST00000476355 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.39■■■□□ 2.46
ETV1-218ENST00000476355 ABCC9O60706 1549 aa27.59■■■□□ 2.01
ETV1-218ENST00000476355 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.2■■□□□ 1.95
ETV1-218ENST00000476355 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.19■■□□□ 1.78
ETV1-218ENST00000476355 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.12■■□□□ 1.77
ETV1-218ENST00000476355 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.98■■□□□ 1.75
ETV1-218ENST00000476355 NACADO15069 1562 aa25.92■■□□□ 1.74
ETV1-218ENST00000476355 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.78■■□□□ 1.72
ETV1-218ENST00000476355 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.52■■□□□ 1.68
ETV1-218ENST00000476355 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.31■■□□□ 1.64
ETV1-218ENST00000476355 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.29■■□□□ 1.64
ETV1-218ENST00000476355 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.09■■□□□ 1.61
ETV1-218ENST00000476355 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
ETV1-218ENST00000476355 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.03■■□□□ 1.6
ETV1-218ENST00000476355 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.91■■□□□ 1.58
ETV1-218ENST00000476355 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.83■■□□□ 1.57
ETV1-218ENST00000476355 SCRIBQ14160 1630 aa24.81■■□□□ 1.56
ETV1-218ENST00000476355 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ETV1-218ENST00000476355 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
ETV1-218ENST00000476355 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.29■■□□□ 1.48
ETV1-218ENST00000476355 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.21■■□□□ 1.47
ETV1-218ENST00000476355 NCAPD3P42695 1498 aa24.01■■□□□ 1.43
ETV1-218ENST00000476355 CUX2O14529 1486 aa23.89■■□□□ 1.42
ETV1-218ENST00000476355 ERCC6Q03468 1493 aa23.88■■□□□ 1.41
ETV1-218ENST00000476355 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.86■■□□□ 1.41
ETV1-218ENST00000476355 SMARCA2P51531 1590 aa23.75■■□□□ 1.39
ETV1-218ENST00000476355 HMGXB3Q12766 1538 aa23.69■■□□□ 1.38
ETV1-218ENST00000476355 SMARCA4P51532 1647 aa23.66■■□□□ 1.38
ETV1-218ENST00000476355 NESP48681 1621 aa23.61■■□□□ 1.37
ETV1-218ENST00000476355 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
ETV1-218ENST00000476355 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
ETV1-218ENST00000476355 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.46■■□□□ 1.35
ETV1-218ENST00000476355 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.42■■□□□ 1.34
ETV1-218ENST00000476355 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.4■■□□□ 1.34
ETV1-218ENST00000476355 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.38■■□□□ 1.33
ETV1-218ENST00000476355 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.31■■□□□ 1.32
ETV1-218ENST00000476355 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
ETV1-218ENST00000476355 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.13■■□□□ 1.29
ETV1-218ENST00000476355 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.12■■□□□ 1.29
ETV1-218ENST00000476355 TRIM41Q8WV44 630 aa23.1■■□□□ 1.29
ETV1-218ENST00000476355 WIZO95785 1651 aa23.01■■□□□ 1.27
ETV1-218ENST00000476355 WDR62O43379 1518 aa23.01■■□□□ 1.27
ETV1-218ENST00000476355 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.98■■□□□ 1.27
ETV1-218ENST00000476355 OSCARQ8IYS5 282 aa22.96■■□□□ 1.27
ETV1-218ENST00000476355 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.96■■□□□ 1.27
ETV1-218ENST00000476355 CFTRP13569 1480 aa22.92■■□□□ 1.26
ETV1-218ENST00000476355 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
ETV1-218ENST00000476355 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
ETV1-218ENST00000476355 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
ETV1-218ENST00000476355 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.59■■□□□ 1.21
ETV1-218ENST00000476355 IFT140Q96RY7 1462 aa22.58■■□□□ 1.2
ETV1-218ENST00000476355 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
ETV1-218ENST00000476355 ABCC8Q09428 1581 aa22.5■■□□□ 1.19
ETV1-218ENST00000476355 TOPBP1Q92547 1522 aa22.47■■□□□ 1.19
ETV1-218ENST00000476355 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.4■■□□□ 1.18
ETV1-218ENST00000476355 PRDM2Q13029 1718 aa22.38■■□□□ 1.17
ETV1-218ENST00000476355 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.38■■□□□ 1.17
ETV1-218ENST00000476355 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.38■■□□□ 1.17
ETV1-218ENST00000476355 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.38■■□□□ 1.17
ETV1-218ENST00000476355 FBLN2P98095 1184 aa22.36■■□□□ 1.17
ETV1-218ENST00000476355 ARHGEF11O15085 1522 aa22.36■■□□□ 1.17
ETV1-218ENST00000476355 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
ETV1-218ENST00000476355 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.33■■□□□ 1.16
ETV1-218ENST00000476355 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ETV1-218ENST00000476355 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
ETV1-218ENST00000476355 SOGA1O94964 1423 aa22.23■■□□□ 1.15
ETV1-218ENST00000476355 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ETV1-218ENST00000476355 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
ETV1-218ENST00000476355 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
ETV1-218ENST00000476355 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ETV1-218ENST00000476355 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.17■■□□□ 1.14
ETV1-218ENST00000476355 ARAP1Q96P48 1450 aa22.11■■□□□ 1.13
ETV1-218ENST00000476355 CHD1O14646 1710 aa22.08■■□□□ 1.12
ETV1-218ENST00000476355 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.05■■□□□ 1.12
ETV1-218ENST00000476355 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.03■■□□□ 1.12
ETV1-218ENST00000476355 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
ETV1-218ENST00000476355 GRIN2BQ13224 1484 aa22.02■■□□□ 1.12
ETV1-218ENST00000476355 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
ETV1-218ENST00000476355 WDR97A6NE52 1622 aa21.99■■□□□ 1.11
ETV1-218ENST00000476355 CUX1P39880 1505 aa21.96■■□□□ 1.11
ETV1-218ENST00000476355 SYNJ2O15056 1496 aa21.95■■□□□ 1.1
ETV1-218ENST00000476355 SYNJ1O43426 1573 aa21.94■■□□□ 1.1
ETV1-218ENST00000476355 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.92■■□□□ 1.1
ETV1-218ENST00000476355 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.9■■□□□ 1.1
ETV1-218ENST00000476355 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.81■■□□□ 1.08
ETV1-218ENST00000476355 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
ETV1-218ENST00000476355 GRIN2AQ12879 1464 aa21.68■■□□□ 1.06
ETV1-218ENST00000476355 PBRM1Q86U86 1689 aa21.66■■□□□ 1.06
ETV1-218ENST00000476355 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.66■■□□□ 1.06
ETV1-218ENST00000476355 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.64■■□□□ 1.06
ETV1-218ENST00000476355 NUP160Q12769 1436 aa21.64■■□□□ 1.06
ETV1-218ENST00000476355 JPH4Q96JJ6 628 aa21.58■■□□□ 1.05
ETV1-218ENST00000476355 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.56■■□□□ 1.04
ETV1-218ENST00000476355 CEP170Q5SW79 1584 aa21.55■■□□□ 1.04
ETV1-218ENST00000476355 TOP2BQ02880 1626 aa21.54■■□□□ 1.04
ETV1-218ENST00000476355 ADAMTS12P58397 1594 aa21.53■■□□□ 1.04
ETV1-218ENST00000476355 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.52■■□□□ 1.04
ETV1-218ENST00000476355 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ETV1-218ENST00000476355 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
ETV1-218ENST00000476355 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.47■■□□□ 1.03
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