RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476084.1

PDXK-214, Transcript of pyridoxal kinase, humanhuman

TSL 3

Gene PDXK, Length 602 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXK-214ENST00000476084 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.12■■■■■ 6.57
PDXK-214ENST00000476084 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.29■■■■■ 5.64
PDXK-214ENST00000476084 ABCC9O60706 1549 aa50■■■■■ 5.59
PDXK-214ENST00000476084 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.77■■■■■ 5.24
PDXK-214ENST00000476084 NACADO15069 1562 aa47.52■■■■■ 5.2
PDXK-214ENST00000476084 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.21■■■■■ 5.15
PDXK-214ENST00000476084 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.99■■■■■ 5.11
PDXK-214ENST00000476084 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.71■■■■■ 5.07
PDXK-214ENST00000476084 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.63■■■■■ 5.06
PDXK-214ENST00000476084 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.57■■■■■ 5.05
PDXK-214ENST00000476084 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.55■■■■■ 5.04
PDXK-214ENST00000476084 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.44■■■■■ 5.02
PDXK-214ENST00000476084 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.32■■■■■ 5.01
PDXK-214ENST00000476084 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.85■■■■■ 4.93
PDXK-214ENST00000476084 SCRIBQ14160 1630 aa45.74■■■■■ 4.91
PDXK-214ENST00000476084 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.22■■■■■ 4.83
PDXK-214ENST00000476084 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.18■■■■■ 4.82
PDXK-214ENST00000476084 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.06■■■■■ 4.8
PDXK-214ENST00000476084 NCAPD3P42695 1498 aa43.86■■■■■ 4.61
PDXK-214ENST00000476084 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.72■■■■■ 4.59
PDXK-214ENST00000476084 SMARCA4P51532 1647 aa43.71■■■■■ 4.59
PDXK-214ENST00000476084 SMARCA2P51531 1590 aa43.64■■■■■ 4.58
PDXK-214ENST00000476084 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.56■■■■■ 4.56
PDXK-214ENST00000476084 HMGXB3Q12766 1538 aa43.54■■■■■ 4.56
PDXK-214ENST00000476084 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.34■■■■■ 4.53
PDXK-214ENST00000476084 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
PDXK-214ENST00000476084 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.2■■■■■ 4.51
PDXK-214ENST00000476084 ERCC6Q03468 1493 aa43.19■■■■■ 4.51
PDXK-214ENST00000476084 CUX2O14529 1486 aa43.11■■■■■ 4.49
PDXK-214ENST00000476084 NESP48681 1621 aa43■■■■■ 4.47
PDXK-214ENST00000476084 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.83■■■■■ 4.45
PDXK-214ENST00000476084 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.83■■■■■ 4.45
PDXK-214ENST00000476084 WIZO95785 1651 aa42.68■■■■■ 4.42
PDXK-214ENST00000476084 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.6■■■■■ 4.41
PDXK-214ENST00000476084 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
PDXK-214ENST00000476084 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.52■■■■■ 4.4
PDXK-214ENST00000476084 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.47■■■■■ 4.39
PDXK-214ENST00000476084 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
PDXK-214ENST00000476084 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
PDXK-214ENST00000476084 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.17■■■■■ 4.34
PDXK-214ENST00000476084 CFTRP13569 1480 aa42.08■■■■■ 4.33
PDXK-214ENST00000476084 WDR62O43379 1518 aa42.06■■■■■ 4.32
PDXK-214ENST00000476084 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.04■■■■■ 4.32
PDXK-214ENST00000476084 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.01■■■■■ 4.32
PDXK-214ENST00000476084 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.72■■■■■ 4.27
PDXK-214ENST00000476084 PRDM2Q13029 1718 aa41.67■■■■■ 4.26
PDXK-214ENST00000476084 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
PDXK-214ENST00000476084 ABCC8Q09428 1581 aa41.25■■■■■ 4.19
PDXK-214ENST00000476084 TOPBP1Q92547 1522 aa41.23■■■■■ 4.19
PDXK-214ENST00000476084 IFT140Q96RY7 1462 aa41.22■■■■■ 4.19
PDXK-214ENST00000476084 OSCARQ8IYS5 282 aa41.17■■■■■ 4.18
PDXK-214ENST00000476084 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.12■■■■■ 4.17
PDXK-214ENST00000476084 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
PDXK-214ENST00000476084 TRIM41Q8WV44 630 aa40.95■■■■■ 4.15
PDXK-214ENST00000476084 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
PDXK-214ENST00000476084 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
PDXK-214ENST00000476084 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.12
PDXK-214ENST00000476084 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.73■■■■■ 4.11
PDXK-214ENST00000476084 SOGA1O94964 1423 aa40.67■■■■■ 4.1
PDXK-214ENST00000476084 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.64■■■■■ 4.1
PDXK-214ENST00000476084 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
PDXK-214ENST00000476084 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.58■■■■■ 4.09
PDXK-214ENST00000476084 CUX1P39880 1505 aa40.58■■■■■ 4.09
PDXK-214ENST00000476084 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.55■■■■■ 4.08
PDXK-214ENST00000476084 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.55■■■■■ 4.08
PDXK-214ENST00000476084 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.55■■■■■ 4.08
PDXK-214ENST00000476084 WDR97A6NE52 1622 aa40.54■■■■■ 4.08
PDXK-214ENST00000476084 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
PDXK-214ENST00000476084 CHD1O14646 1710 aa40.5■■■■■ 4.07
PDXK-214ENST00000476084 ARHGEF11O15085 1522 aa40.45■■■■■ 4.07
PDXK-214ENST00000476084 FBLN2P98095 1184 aa40.42■■■■■ 4.06
PDXK-214ENST00000476084 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.33■■■■■ 4.05
PDXK-214ENST00000476084 GRIN2BQ13224 1484 aa40.3■■■■■ 4.04
PDXK-214ENST00000476084 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
PDXK-214ENST00000476084 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
PDXK-214ENST00000476084 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.19■■■■■ 4.02
PDXK-214ENST00000476084 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.17■■■■■ 4.02
PDXK-214ENST00000476084 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.14■■■■■ 4.02
PDXK-214ENST00000476084 SYNJ2O15056 1496 aa40.13■■■■■ 4.02
PDXK-214ENST00000476084 SYNJ1O43426 1573 aa40.11■■■■■ 4.01
PDXK-214ENST00000476084 PBRM1Q86U86 1689 aa40.11■■■■■ 4.01
PDXK-214ENST00000476084 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.09■■■■■ 4.01
PDXK-214ENST00000476084 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.08■■■■■ 4.01
PDXK-214ENST00000476084 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.07■■■■■ 4
PDXK-214ENST00000476084 ARAP1Q96P48 1450 aa40.06■■■■■ 4
PDXK-214ENST00000476084 TOP2BQ02880 1626 aa40.02■■■■■ 4
PDXK-214ENST00000476084 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.02■■■■■ 4
PDXK-214ENST00000476084 GRIN2AQ12879 1464 aa39.75■■■■□ 3.95
PDXK-214ENST00000476084 ADAMTS12P58397 1594 aa39.75■■■■□ 3.95
PDXK-214ENST00000476084 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.7■■■■□ 3.95
PDXK-214ENST00000476084 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.69■■■■□ 3.94
PDXK-214ENST00000476084 NUP160Q12769 1436 aa39.64■■■■□ 3.94
PDXK-214ENST00000476084 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
PDXK-214ENST00000476084 CEP170Q5SW79 1584 aa39.58■■■■□ 3.93
PDXK-214ENST00000476084 SHROOM2Q13796 1616 aa39.43■■■■□ 3.9
PDXK-214ENST00000476084 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.42■■■■□ 3.9
PDXK-214ENST00000476084 KIF27Q86VH2 1401 aa39.26■■■■□ 3.88
PDXK-214ENST00000476084 JPH4Q96JJ6 628 aa39.25■■■■□ 3.87
PDXK-214ENST00000476084 IGF1RP08069 1367 aa39.22■■■■□ 3.87
PDXK-214ENST00000476084 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.21■■■■□ 3.87
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