RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475797.1

HFE2-204, Transcript of Hemojuvelin, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HFE2, Length 1,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFE2-204ENST00000475797 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.78■■■■■ 4.28
HFE2-204ENST00000475797 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.08■■■■□ 3.53
HFE2-204ENST00000475797 ABCC9O60706 1549 aa36.8■■■■□ 3.48
HFE2-204ENST00000475797 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.36■■■■□ 3.25
HFE2-204ENST00000475797 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.18■■■■□ 3.22
HFE2-204ENST00000475797 NACADO15069 1562 aa35.07■■■■□ 3.2
HFE2-204ENST00000475797 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.75■■■■□ 3.15
HFE2-204ENST00000475797 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
HFE2-204ENST00000475797 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.5■■■■□ 3.11
HFE2-204ENST00000475797 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.48■■■■□ 3.11
HFE2-204ENST00000475797 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.1■■■■□ 3.05
HFE2-204ENST00000475797 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.09■■■■□ 3.05
HFE2-204ENST00000475797 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.04■■■■□ 3.04
HFE2-204ENST00000475797 SCRIBQ14160 1630 aa33.95■■■■□ 3.02
HFE2-204ENST00000475797 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.71■■■□□ 2.99
HFE2-204ENST00000475797 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
HFE2-204ENST00000475797 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.15■■■□□ 2.9
HFE2-204ENST00000475797 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.1■■■□□ 2.89
HFE2-204ENST00000475797 NCAPD3P42695 1498 aa32.44■■■□□ 2.78
HFE2-204ENST00000475797 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.41■■■□□ 2.78
HFE2-204ENST00000475797 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
HFE2-204ENST00000475797 SMARCA4P51532 1647 aa32.4■■■□□ 2.78
HFE2-204ENST00000475797 SMARCA2P51531 1590 aa32.31■■■□□ 2.76
HFE2-204ENST00000475797 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.2■■■□□ 2.74
HFE2-204ENST00000475797 HMGXB3Q12766 1538 aa32.14■■■□□ 2.74
HFE2-204ENST00000475797 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
HFE2-204ENST00000475797 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.07■■■□□ 2.72
HFE2-204ENST00000475797 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
HFE2-204ENST00000475797 ERCC6Q03468 1493 aa31.78■■■□□ 2.68
HFE2-204ENST00000475797 WIZO95785 1651 aa31.76■■■□□ 2.68
HFE2-204ENST00000475797 NESP48681 1621 aa31.71■■■□□ 2.67
HFE2-204ENST00000475797 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.54■■■□□ 2.64
HFE2-204ENST00000475797 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.53■■■□□ 2.64
HFE2-204ENST00000475797 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.49■■■□□ 2.63
HFE2-204ENST00000475797 CUX2O14529 1486 aa31.45■■■□□ 2.63
HFE2-204ENST00000475797 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
HFE2-204ENST00000475797 CFTRP13569 1480 aa31.23■■■□□ 2.59
HFE2-204ENST00000475797 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.17■■■□□ 2.58
HFE2-204ENST00000475797 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
HFE2-204ENST00000475797 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.15■■■□□ 2.58
HFE2-204ENST00000475797 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.12■■■□□ 2.57
HFE2-204ENST00000475797 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.1■■■□□ 2.57
HFE2-204ENST00000475797 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.1■■■□□ 2.57
HFE2-204ENST00000475797 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
HFE2-204ENST00000475797 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.93■■■□□ 2.54
HFE2-204ENST00000475797 WDR62O43379 1518 aa30.93■■■□□ 2.54
HFE2-204ENST00000475797 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
HFE2-204ENST00000475797 PRDM2Q13029 1718 aa30.63■■■□□ 2.49
HFE2-204ENST00000475797 ABCC8Q09428 1581 aa30.58■■■□□ 2.49
HFE2-204ENST00000475797 TOPBP1Q92547 1522 aa30.56■■■□□ 2.48
HFE2-204ENST00000475797 IFT140Q96RY7 1462 aa30.47■■■□□ 2.47
HFE2-204ENST00000475797 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.45■■■□□ 2.47
HFE2-204ENST00000475797 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
HFE2-204ENST00000475797 OSCARQ8IYS5 282 aa30.29■■■□□ 2.44
HFE2-204ENST00000475797 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
HFE2-204ENST00000475797 SOGA1O94964 1423 aa30.27■■■□□ 2.44
HFE2-204ENST00000475797 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.22■■■□□ 2.43
HFE2-204ENST00000475797 CUX1P39880 1505 aa30.2■■■□□ 2.43
HFE2-204ENST00000475797 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.2■■■□□ 2.43
HFE2-204ENST00000475797 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.19■■■□□ 2.42
HFE2-204ENST00000475797 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
HFE2-204ENST00000475797 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
HFE2-204ENST00000475797 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
HFE2-204ENST00000475797 FBLN2P98095 1184 aa30.05■■■□□ 2.4
HFE2-204ENST00000475797 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.02■■■□□ 2.4
HFE2-204ENST00000475797 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
HFE2-204ENST00000475797 TRIM41Q8WV44 630 aa29.9■■■□□ 2.38
HFE2-204ENST00000475797 GRIN2BQ13224 1484 aa29.89■■■□□ 2.38
HFE2-204ENST00000475797 WDR97A6NE52 1622 aa29.89■■■□□ 2.38
HFE2-204ENST00000475797 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.87■■■□□ 2.37
HFE2-204ENST00000475797 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.87■■■□□ 2.37
HFE2-204ENST00000475797 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.86■■■□□ 2.37
HFE2-204ENST00000475797 TOP2BQ02880 1626 aa29.83■■■□□ 2.37
HFE2-204ENST00000475797 SYNJ1O43426 1573 aa29.81■■■□□ 2.36
HFE2-204ENST00000475797 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
HFE2-204ENST00000475797 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.76■■■□□ 2.36
HFE2-204ENST00000475797 SYNJ2O15056 1496 aa29.71■■■□□ 2.35
HFE2-204ENST00000475797 CHD1O14646 1710 aa29.68■■■□□ 2.34
HFE2-204ENST00000475797 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.66■■■□□ 2.34
HFE2-204ENST00000475797 ARHGEF11O15085 1522 aa29.6■■■□□ 2.33
HFE2-204ENST00000475797 PBRM1Q86U86 1689 aa29.57■■■□□ 2.32
HFE2-204ENST00000475797 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.57■■■□□ 2.32
HFE2-204ENST00000475797 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.57■■■□□ 2.32
HFE2-204ENST00000475797 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.57■■■□□ 2.32
HFE2-204ENST00000475797 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.56■■■□□ 2.32
HFE2-204ENST00000475797 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.52■■■□□ 2.32
HFE2-204ENST00000475797 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.48■■■□□ 2.31
HFE2-204ENST00000475797 GRIN2AQ12879 1464 aa29.46■■■□□ 2.31
HFE2-204ENST00000475797 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.45■■■□□ 2.31
HFE2-204ENST00000475797 KIF27Q86VH2 1401 aa29.44■■■□□ 2.3
HFE2-204ENST00000475797 ADAMTS12P58397 1594 aa29.43■■■□□ 2.3
HFE2-204ENST00000475797 IGF1RP08069 1367 aa29.36■■■□□ 2.29
HFE2-204ENST00000475797 ARAP1Q96P48 1450 aa29.34■■■□□ 2.29
HFE2-204ENST00000475797 NUP160Q12769 1436 aa29.34■■■□□ 2.29
HFE2-204ENST00000475797 CEP170Q5SW79 1584 aa29.26■■■□□ 2.27
HFE2-204ENST00000475797 JPH4Q96JJ6 628 aa29.21■■■□□ 2.27
HFE2-204ENST00000475797 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.2■■■□□ 2.26
HFE2-204ENST00000475797 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
HFE2-204ENST00000475797 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
HFE2-204ENST00000475797 CUL7Q14999 1698 aa29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.8 ms