RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475689.1

NBEAL2-208, Transcript of neurobeachin like 2, human

TSL 2

Gene NBEAL2, Length 677 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NBEAL2-208	ENST00000475689	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		46.23	■■■■■ 4.99
NBEAL2-208	ENST00000475689	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		41.33	■■■■■ 4.21
NBEAL2-208	ENST00000475689	ABCC9	O60706	1549 aa		40.77	■■■■■ 4.12
NBEAL2-208	ENST00000475689	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		39.1	■■■■□ 3.85
NBEAL2-208	ENST00000475689	NACAD	O15069	1562 aa		38.92	■■■■□ 3.82
NBEAL2-208	ENST00000475689	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		38.89	■■■■□ 3.82
NBEAL2-208	ENST00000475689	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		38.51	■■■■□ 3.76
NBEAL2-208	ENST00000475689	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	38.44	■■■■□ 3.74
NBEAL2-208	ENST00000475689	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		38.22	■■■■□ 3.71
NBEAL2-208	ENST00000475689	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		38.15	■■■■□ 3.7
NBEAL2-208	ENST00000475689	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	37.99	■■■■□ 3.67
NBEAL2-208	ENST00000475689	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		37.79	■■■■□ 3.64
NBEAL2-208	ENST00000475689	SCRIB	Q14160	1630 aa		37.7	■■■■□ 3.63
NBEAL2-208	ENST00000475689	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		37.56	■■■■□ 3.6
NBEAL2-208	ENST00000475689	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		37.47	■■■■□ 3.59
NBEAL2-208	ENST00000475689	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	36.9	■■■■□ 3.5
NBEAL2-208	ENST00000475689	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		36.85	■■■■□ 3.49
NBEAL2-208	ENST00000475689	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		36.67	■■■■□ 3.46
NBEAL2-208	ENST00000475689	SMARCA4	P51532	1647 aa		35.99	■■■■□ 3.35
NBEAL2-208	ENST00000475689	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	35.92	■■■■□ 3.34
NBEAL2-208	ENST00000475689	SMARCA2	P51531	1590 aa		35.86	■■■■□ 3.33
NBEAL2-208	ENST00000475689	NCAPD3	P42695	1498 aa		35.86	■■■■□ 3.33
NBEAL2-208	ENST00000475689	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		35.84	■■■■□ 3.33
NBEAL2-208	ENST00000475689	HMGXB3	Q12766	1538 aa		35.72	■■■■□ 3.31
NBEAL2-208	ENST00000475689	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	35.61	■■■■□ 3.29
NBEAL2-208	ENST00000475689	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		35.61	■■■■□ 3.29
NBEAL2-208	ENST00000475689	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		35.59	■■■■□ 3.29
NBEAL2-208	ENST00000475689	ERCC6	Q03468	1493 aa		35.27	■■■■□ 3.24
NBEAL2-208	ENST00000475689	WIZ	O95785	1651 aa		35.24	■■■■□ 3.23
NBEAL2-208	ENST00000475689	NES	P48681	1621 aa		35.12	■■■■□ 3.21
NBEAL2-208	ENST00000475689	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	35.06	■■■■□ 3.2
NBEAL2-208	ENST00000475689	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		35.05	■■■■□ 3.2
NBEAL2-208	ENST00000475689	CUX2	O14529	1486 aa		34.94	■■■■□ 3.18
NBEAL2-208	ENST00000475689	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	34.87	■■■■□ 3.17
NBEAL2-208	ENST00000475689	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		34.84	■■■■□ 3.17
NBEAL2-208	ENST00000475689	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		34.82	■■■■□ 3.16
NBEAL2-208	ENST00000475689	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		34.76	■■■■□ 3.16
NBEAL2-208	ENST00000475689	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	34.7	■■■■□ 3.14
NBEAL2-208	ENST00000475689	CFTR	P13569	1480 aa		34.52	■■■■□ 3.12
NBEAL2-208	ENST00000475689	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		34.5	■■■■□ 3.11
NBEAL2-208	ENST00000475689	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		34.49	■■■■□ 3.11
NBEAL2-208	ENST00000475689	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		34.46	■■■■□ 3.11
NBEAL2-208	ENST00000475689	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		34.4	■■■■□ 3.1
NBEAL2-208	ENST00000475689	PRDM2	Q13029	1718 aa		34.35	■■■■□ 3.09
NBEAL2-208	ENST00000475689	WDR62	O43379	1518 aa		34.35	■■■■□ 3.09
NBEAL2-208	ENST00000475689	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		34.19	■■■■□ 3.06
NBEAL2-208	ENST00000475689	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	34.09	■■■■□ 3.05
NBEAL2-208	ENST00000475689	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	34.03	■■■■□ 3.04
NBEAL2-208	ENST00000475689	ABCC8	Q09428	1581 aa		33.88	■■■■□ 3.01
NBEAL2-208	ENST00000475689	TOPBP1	Q92547	1522 aa		33.85	■■■■□ 3.01
NBEAL2-208	ENST00000475689	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		33.81	■■■■□ 3
NBEAL2-208	ENST00000475689	IFT140	Q96RY7	1462 aa		33.76	■■■□□ 2.99
NBEAL2-208	ENST00000475689	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	33.58	■■■□□ 2.97
NBEAL2-208	ENST00000475689	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	33.54	■■■□□ 2.96
NBEAL2-208	ENST00000475689	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	33.51	■■■□□ 2.95
NBEAL2-208	ENST00000475689	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	33.49	■■■□□ 2.95
NBEAL2-208	ENST00000475689	CUX1	P39880	1505 aa		33.44	■■■□□ 2.94
NBEAL2-208	ENST00000475689	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		33.43	■■■□□ 2.94
NBEAL2-208	ENST00000475689	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		33.41	■■■□□ 2.94
NBEAL2-208	ENST00000475689	SOGA1	O94964	1423 aa		33.41	■■■□□ 2.94
NBEAL2-208	ENST00000475689	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		33.38	■■■□□ 2.93
NBEAL2-208	ENST00000475689	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	33.36	■■■□□ 2.93	1e-7	■■■■■ 28.3
NBEAL2-208	ENST00000475689	WDR97	A6NE52	1622 aa		33.28	■■■□□ 2.92
NBEAL2-208	ENST00000475689	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
NBEAL2-208	ENST00000475689	CHD1	O14646	1710 aa		33.16	■■■□□ 2.9
NBEAL2-208	ENST00000475689	FBLN2	P98095	1184 aa		33.15	■■■□□ 2.9
NBEAL2-208	ENST00000475689	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	33.15	■■■□□ 2.9
NBEAL2-208	ENST00000475689	TOP2B	Q02880	1626 aa		33.1	■■■□□ 2.89
NBEAL2-208	ENST00000475689	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		33.1	■■■□□ 2.89
NBEAL2-208	ENST00000475689	GRIN2B	Q13224	1484 aa		33.09	■■■□□ 2.89
NBEAL2-208	ENST00000475689	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		33.09	■■■□□ 2.89
NBEAL2-208	ENST00000475689	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		33.07	■■■□□ 2.88
NBEAL2-208	ENST00000475689	TRIM41	Q8WV44	630 aa		33.05	■■■□□ 2.88
NBEAL2-208	ENST00000475689	SYNJ1	O43426	1573 aa		33.04	■■■□□ 2.88
NBEAL2-208	ENST00000475689	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
NBEAL2-208	ENST00000475689	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		33.03	■■■□□ 2.88
NBEAL2-208	ENST00000475689	PBRM1	Q86U86	1689 aa		33.03	■■■□□ 2.88
NBEAL2-208	ENST00000475689	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		32.97	■■■□□ 2.87
NBEAL2-208	ENST00000475689	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
NBEAL2-208	ENST00000475689	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		32.92	■■■□□ 2.86
NBEAL2-208	ENST00000475689	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		32.92	■■■□□ 2.86
NBEAL2-208	ENST00000475689	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		32.92	■■■□□ 2.86
NBEAL2-208	ENST00000475689	SYNJ2	O15056	1496 aa		32.91	■■■□□ 2.86
NBEAL2-208	ENST00000475689	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.87	■■■□□ 2.85
NBEAL2-208	ENST00000475689	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		32.72	■■■□□ 2.83
NBEAL2-208	ENST00000475689	ADAMTS12	P58397	1594 aa		32.71	■■■□□ 2.83
NBEAL2-208	ENST00000475689	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		32.69	■■■□□ 2.82
NBEAL2-208	ENST00000475689	GRIN2A	Q12879	1464 aa		32.65	■■■□□ 2.82
NBEAL2-208	ENST00000475689	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		32.63	■■■□□ 2.81
NBEAL2-208	ENST00000475689	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		32.6	■■■□□ 2.81
NBEAL2-208	ENST00000475689	ARAP1	Q96P48	1450 aa		32.56	■■■□□ 2.8
NBEAL2-208	ENST00000475689	KIF27	Q86VH2	1401 aa		32.51	■■■□□ 2.79
NBEAL2-208	ENST00000475689	CEP170	Q5SW79	1584 aa		32.48	■■■□□ 2.79
NBEAL2-208	ENST00000475689	NUP160	Q12769	1436 aa		32.47	■■■□□ 2.79
NBEAL2-208	ENST00000475689	CUL7	Q14999	1698 aa		32.38	■■■□□ 2.77
NBEAL2-208	ENST00000475689	IGF1R	P08069	1367 aa		32.31	■■■□□ 2.76
NBEAL2-208	ENST00000475689	SHROOM2	Q13796	1616 aa		32.28	■■■□□ 2.76
NBEAL2-208	ENST00000475689	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		32.24	■■■□□ 2.75
NBEAL2-208	ENST00000475689	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		32.21	■■■□□ 2.75
NBEAL2-208	ENST00000475689	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		32.18	■■■□□ 2.74

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