RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474840.5

MCRIP2-202, Transcript of MAPK regulated corepressor interacting protein 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MCRIP2, Length 702 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP2-202ENST00000474840 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.26■■■■■ 8.04
MCRIP2-202ENST00000474840 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.09■■■■■ 6.89
MCRIP2-202ENST00000474840 ABCC9O60706 1549 aa57.08■■■■■ 6.73
MCRIP2-202ENST00000474840 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.76■■■■■ 6.36
MCRIP2-202ENST00000474840 NACADO15069 1562 aa54.65■■■■■ 6.34
MCRIP2-202ENST00000474840 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.54■■■■■ 6.32
MCRIP2-202ENST00000474840 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.32■■■■■ 6.29
MCRIP2-202ENST00000474840 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.26■■■■■ 6.28
MCRIP2-202ENST00000474840 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.96■■■■■ 6.23
MCRIP2-202ENST00000474840 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.63■■■■■ 6.18
MCRIP2-202ENST00000474840 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.31■■■■■ 6.12
MCRIP2-202ENST00000474840 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.23■■■■■ 6.11
MCRIP2-202ENST00000474840 SCRIBQ14160 1630 aa53.01■■■■■ 6.08
MCRIP2-202ENST00000474840 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.69■■■■■ 6.03
MCRIP2-202ENST00000474840 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.5■■■■■ 5.99
MCRIP2-202ENST00000474840 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.78■■■■■ 5.88
MCRIP2-202ENST00000474840 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.63■■■■■ 5.86
MCRIP2-202ENST00000474840 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.29■■■■■ 5.8
MCRIP2-202ENST00000474840 SMARCA4P51532 1647 aa50.69■■■■■ 5.7
MCRIP2-202ENST00000474840 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.55■■■■■ 5.68
MCRIP2-202ENST00000474840 NCAPD3P42695 1498 aa50.47■■■■■ 5.67
MCRIP2-202ENST00000474840 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.47■■■■■ 5.67
MCRIP2-202ENST00000474840 SMARCA2P51531 1590 aa50.34■■■■■ 5.65
MCRIP2-202ENST00000474840 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.33■■■■■ 5.65
MCRIP2-202ENST00000474840 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.2■■■■■ 5.63
MCRIP2-202ENST00000474840 HMGXB3Q12766 1538 aa50.17■■■■■ 5.62
MCRIP2-202ENST00000474840 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50■■■■■ 5.59
MCRIP2-202ENST00000474840 WIZO95785 1651 aa49.77■■■■■ 5.56
MCRIP2-202ENST00000474840 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.66■■■■■ 5.54
MCRIP2-202ENST00000474840 NESP48681 1621 aa49.38■■■■■ 5.49
MCRIP2-202ENST00000474840 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.19■■■■■ 5.46
MCRIP2-202ENST00000474840 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.14■■■■■ 5.46
MCRIP2-202ENST00000474840 ERCC6Q03468 1493 aa49.12■■■■■ 5.45
MCRIP2-202ENST00000474840 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.96■■■■■ 5.43
MCRIP2-202ENST00000474840 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.78■■■■■ 5.4
MCRIP2-202ENST00000474840 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.76■■■■■ 5.4
MCRIP2-202ENST00000474840 CUX2O14529 1486 aa48.72■■■■■ 5.39
MCRIP2-202ENST00000474840 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.65■■■■■ 5.38
MCRIP2-202ENST00000474840 CFTRP13569 1480 aa48.65■■■■■ 5.38
MCRIP2-202ENST00000474840 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.64■■■■■ 5.38
MCRIP2-202ENST00000474840 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.41■■■■■ 5.34
MCRIP2-202ENST00000474840 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.34■■■■■ 5.33
MCRIP2-202ENST00000474840 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.33■■■■■ 5.33
MCRIP2-202ENST00000474840 PRDM2Q13029 1718 aa48.25■■■■■ 5.31
MCRIP2-202ENST00000474840 WDR62O43379 1518 aa48.22■■■■■ 5.31
MCRIP2-202ENST00000474840 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.17■■■■■ 5.3
MCRIP2-202ENST00000474840 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.98■■■■■ 5.27
MCRIP2-202ENST00000474840 TOPBP1Q92547 1522 aa47.63■■■■■ 5.22
MCRIP2-202ENST00000474840 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.54■■■■■ 5.2
MCRIP2-202ENST00000474840 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.53■■■■■ 5.2
MCRIP2-202ENST00000474840 ABCC8Q09428 1581 aa47.53■■■■■ 5.2
MCRIP2-202ENST00000474840 IFT140Q96RY7 1462 aa47.33■■■■■ 5.17
MCRIP2-202ENST00000474840 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.22■■■■■ 5.15
MCRIP2-202ENST00000474840 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.21■■■■■ 5.15
MCRIP2-202ENST00000474840 CUX1P39880 1505 aa47.21■■■■■ 5.15
MCRIP2-202ENST00000474840 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.16■■■■■ 5.14
MCRIP2-202ENST00000474840 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.07■■■■■ 5.13
MCRIP2-202ENST00000474840 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.03■■■■■ 5.12
MCRIP2-202ENST00000474840 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.99■■■■■ 5.11
MCRIP2-202ENST00000474840 SOGA1O94964 1423 aa46.98■■■■■ 5.11
MCRIP2-202ENST00000474840 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.91■■■■■ 5.12e-6■■■■□ 23.2
MCRIP2-202ENST00000474840 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.78■■■■■ 5.08
MCRIP2-202ENST00000474840 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.78■■■■■ 5.08
MCRIP2-202ENST00000474840 SYNJ1O43426 1573 aa46.73■■■■■ 5.07
MCRIP2-202ENST00000474840 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.73■■■■■ 5.07
MCRIP2-202ENST00000474840 WDR97A6NE52 1622 aa46.72■■■■■ 5.07
MCRIP2-202ENST00000474840 TOP2BQ02880 1626 aa46.72■■■■■ 5.07
MCRIP2-202ENST00000474840 OSCARQ8IYS5 282 aa46.65■■■■■ 5.06
MCRIP2-202ENST00000474840 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.59■■■■■ 5.05
MCRIP2-202ENST00000474840 CHD1O14646 1710 aa46.46■■■■■ 5.03
MCRIP2-202ENST00000474840 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.45■■■■■ 5.03
MCRIP2-202ENST00000474840 GRIN2BQ13224 1484 aa46.44■■■■■ 5.03
MCRIP2-202ENST00000474840 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.44■■■■■ 5.02
MCRIP2-202ENST00000474840 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.44■■■■■ 5.02
MCRIP2-202ENST00000474840 PBRM1Q86U86 1689 aa46.38■■■■■ 5.02
MCRIP2-202ENST00000474840 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.34■■■■■ 5.01
MCRIP2-202ENST00000474840 FBLN2P98095 1184 aa46.3■■■■■ 5
MCRIP2-202ENST00000474840 SYNJ2O15056 1496 aa46.18■■■■■ 4.98
MCRIP2-202ENST00000474840 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.13■■■■■ 4.98
MCRIP2-202ENST00000474840 ADAMTS12P58397 1594 aa46.01■■■■■ 4.96
MCRIP2-202ENST00000474840 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46■■■■■ 4.95
MCRIP2-202ENST00000474840 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.99■■■■■ 4.95
MCRIP2-202ENST00000474840 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.99■■■■■ 4.95
MCRIP2-202ENST00000474840 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.99■■■■■ 4.95
MCRIP2-202ENST00000474840 ARHGEF11O15085 1522 aa45.96■■■■■ 4.95
MCRIP2-202ENST00000474840 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.96■■■■■ 4.95
MCRIP2-202ENST00000474840 GRIN2AQ12879 1464 aa45.88■■■■■ 4.94
MCRIP2-202ENST00000474840 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.88■■■■■ 4.94
MCRIP2-202ENST00000474840 TRIM41Q8WV44 630 aa45.83■■■■■ 4.93
MCRIP2-202ENST00000474840 KIF27Q86VH2 1401 aa45.78■■■■■ 4.92
MCRIP2-202ENST00000474840 NUP160Q12769 1436 aa45.7■■■■■ 4.91
MCRIP2-202ENST00000474840 CEP170Q5SW79 1584 aa45.7■■■■■ 4.91
MCRIP2-202ENST00000474840 IGF1RP08069 1367 aa45.7■■■■■ 4.91
MCRIP2-202ENST00000474840 ARAP1Q96P48 1450 aa45.59■■■■■ 4.89
MCRIP2-202ENST00000474840 CUL7Q14999 1698 aa45.53■■■■■ 4.88
MCRIP2-202ENST00000474840 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.51■■■■■ 4.88
MCRIP2-202ENST00000474840 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.44■■■■■ 4.86
MCRIP2-202ENST00000474840 SHROOM2Q13796 1616 aa45.4■■■■■ 4.86
MCRIP2-202ENST00000474840 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.37■■■■■ 4.85
MCRIP2-202ENST00000474840 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.37■■■■■ 4.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms