RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472645.1

TIMM17B-206, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17B, humanhuman

TSL 3

Gene TIMM17B, Length 804 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17B-206ENST00000472645 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.46■■■■■ 4.07
TIMM17B-206ENST00000472645 ABCC9O60706 1549 aa36.98■■■■□ 3.51
TIMM17B-206ENST00000472645 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.31■■■■□ 3.4
TIMM17B-206ENST00000472645 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.31■■■■□ 3.24
TIMM17B-206ENST00000472645 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.88■■■■□ 3.17
TIMM17B-206ENST00000472645 NACADO15069 1562 aa34.57■■■■□ 3.12
TIMM17B-206ENST00000472645 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.5■■■■□ 3.11
TIMM17B-206ENST00000472645 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.49■■■■□ 3.11
TIMM17B-206ENST00000472645 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.98■■■■□ 3.03
TIMM17B-206ENST00000472645 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.97■■■■□ 3.03
TIMM17B-206ENST00000472645 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.96■■■■□ 3.03
TIMM17B-206ENST00000472645 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
TIMM17B-206ENST00000472645 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.37■■■□□ 2.93
TIMM17B-206ENST00000472645 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.36■■■□□ 2.93
TIMM17B-206ENST00000472645 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.36■■■□□ 2.93
TIMM17B-206ENST00000472645 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.31■■■□□ 2.92
TIMM17B-206ENST00000472645 SCRIBQ14160 1630 aa33.14■■■□□ 2.9
TIMM17B-206ENST00000472645 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.13■■■□□ 2.89
TIMM17B-206ENST00000472645 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.71■■■□□ 2.83
TIMM17B-206ENST00000472645 NCAPD3P42695 1498 aa32.03■■■□□ 2.72
TIMM17B-206ENST00000472645 CUX2O14529 1486 aa32.01■■■□□ 2.71
TIMM17B-206ENST00000472645 ERCC6Q03468 1493 aa31.9■■■□□ 2.7
TIMM17B-206ENST00000472645 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.84■■■□□ 2.69
TIMM17B-206ENST00000472645 NESP48681 1621 aa31.64■■■□□ 2.66
TIMM17B-206ENST00000472645 SMARCA2P51531 1590 aa31.62■■■□□ 2.65
TIMM17B-206ENST00000472645 HMGXB3Q12766 1538 aa31.61■■■□□ 2.65
TIMM17B-206ENST00000472645 SMARCA4P51532 1647 aa31.57■■■□□ 2.64
TIMM17B-206ENST00000472645 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
TIMM17B-206ENST00000472645 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
TIMM17B-206ENST00000472645 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.3■■■□□ 2.6
TIMM17B-206ENST00000472645 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
TIMM17B-206ENST00000472645 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.24■■■□□ 2.59
TIMM17B-206ENST00000472645 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.19■■■□□ 2.58
TIMM17B-206ENST00000472645 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.18■■■□□ 2.58
TIMM17B-206ENST00000472645 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.05■■■□□ 2.56
TIMM17B-206ENST00000472645 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.04■■■□□ 2.56
TIMM17B-206ENST00000472645 TRIM41Q8WV44 630 aa31.03■■■□□ 2.56
TIMM17B-206ENST00000472645 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.89■■■□□ 2.54
TIMM17B-206ENST00000472645 WDR62O43379 1518 aa30.81■■■□□ 2.52
TIMM17B-206ENST00000472645 WIZO95785 1651 aa30.71■■■□□ 2.51
TIMM17B-206ENST00000472645 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.65■■■□□ 2.5
TIMM17B-206ENST00000472645 OSCARQ8IYS5 282 aa30.63■■■□□ 2.49
TIMM17B-206ENST00000472645 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.63■■■□□ 2.49
TIMM17B-206ENST00000472645 CFTRP13569 1480 aa30.57■■■□□ 2.48
TIMM17B-206ENST00000472645 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
TIMM17B-206ENST00000472645 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
TIMM17B-206ENST00000472645 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
TIMM17B-206ENST00000472645 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
TIMM17B-206ENST00000472645 IFT140Q96RY7 1462 aa30.1■■■□□ 2.41
TIMM17B-206ENST00000472645 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.08■■■□□ 2.41
TIMM17B-206ENST00000472645 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.08■■■□□ 2.41
TIMM17B-206ENST00000472645 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.08■■■□□ 2.41
TIMM17B-206ENST00000472645 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.07■■■□□ 2.4
TIMM17B-206ENST00000472645 ARHGEF11O15085 1522 aa29.99■■■□□ 2.39
TIMM17B-206ENST00000472645 TOPBP1Q92547 1522 aa29.98■■■□□ 2.39
TIMM17B-206ENST00000472645 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.95■■■□□ 2.39
TIMM17B-206ENST00000472645 PRDM2Q13029 1718 aa29.9■■■□□ 2.38
TIMM17B-206ENST00000472645 ABCC8Q09428 1581 aa29.87■■■□□ 2.37
TIMM17B-206ENST00000472645 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.86■■■□□ 2.37
TIMM17B-206ENST00000472645 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
TIMM17B-206ENST00000472645 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.77■■■□□ 2.36
TIMM17B-206ENST00000472645 FBLN2P98095 1184 aa29.76■■■□□ 2.35
TIMM17B-206ENST00000472645 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
TIMM17B-206ENST00000472645 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
TIMM17B-206ENST00000472645 ARAP1Q96P48 1450 aa29.69■■■□□ 2.34
TIMM17B-206ENST00000472645 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
TIMM17B-206ENST00000472645 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
TIMM17B-206ENST00000472645 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.61■■■□□ 2.33
TIMM17B-206ENST00000472645 CHD1O14646 1710 aa29.61■■■□□ 2.33
TIMM17B-206ENST00000472645 SOGA1O94964 1423 aa29.58■■■□□ 2.33
TIMM17B-206ENST00000472645 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
TIMM17B-206ENST00000472645 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.43■■■□□ 2.3
TIMM17B-206ENST00000472645 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.39■■■□□ 2.3
TIMM17B-206ENST00000472645 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.38■■■□□ 2.29
TIMM17B-206ENST00000472645 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
TIMM17B-206ENST00000472645 GRIN2BQ13224 1484 aa29.31■■■□□ 2.28
TIMM17B-206ENST00000472645 CUX1P39880 1505 aa29.3■■■□□ 2.28
TIMM17B-206ENST00000472645 WDR97A6NE52 1622 aa29.3■■■□□ 2.28
TIMM17B-206ENST00000472645 SYNJ1O43426 1573 aa29.26■■■□□ 2.28
TIMM17B-206ENST00000472645 SYNJ2O15056 1496 aa29.26■■■□□ 2.27
TIMM17B-206ENST00000472645 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
TIMM17B-206ENST00000472645 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.16■■■□□ 2.26
TIMM17B-206ENST00000472645 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.04■■■□□ 2.24
TIMM17B-206ENST00000472645 PBRM1Q86U86 1689 aa28.97■■■□□ 2.23
TIMM17B-206ENST00000472645 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.95■■■□□ 2.23
TIMM17B-206ENST00000472645 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.94■■■□□ 2.22
TIMM17B-206ENST00000472645 GRIN2AQ12879 1464 aa28.91■■■□□ 2.22
TIMM17B-206ENST00000472645 NUP160Q12769 1436 aa28.88■■■□□ 2.21
TIMM17B-206ENST00000472645 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.86■■■□□ 2.21
TIMM17B-206ENST00000472645 CEP170Q5SW79 1584 aa28.82■■■□□ 2.2
TIMM17B-206ENST00000472645 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
TIMM17B-206ENST00000472645 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.77■■■□□ 2.2
TIMM17B-206ENST00000472645 ADAMTS12P58397 1594 aa28.76■■■□□ 2.19
TIMM17B-206ENST00000472645 SHROOM2Q13796 1616 aa28.7■■■□□ 2.19
TIMM17B-206ENST00000472645 JPH4Q96JJ6 628 aa28.69■■■□□ 2.18
TIMM17B-206ENST00000472645 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
TIMM17B-206ENST00000472645 TOP2BQ02880 1626 aa28.65■■■□□ 2.18
TIMM17B-206ENST00000472645 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.63■■■□□ 2.17
TIMM17B-206ENST00000472645 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.6■■■□□ 2.17
TIMM17B-206ENST00000472645 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.56■■■□□ 2.16
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