RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469009.5

FBXO18-207, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 5

Gene FBXO18, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-207ENST00000469009 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.22■■■□□ 2.43
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FBXO18-207ENST00000469009 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.04■■□□□ 1.92
FBXO18-207ENST00000469009 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.79■■□□□ 1.72
FBXO18-207ENST00000469009 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.65■■□□□ 1.7
FBXO18-207ENST00000469009 NACADO15069 1562 aa25.57■■□□□ 1.68
FBXO18-207ENST00000469009 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.44■■□□□ 1.66
FBXO18-207ENST00000469009 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.24■■□□□ 1.63
FBXO18-207ENST00000469009 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.24■■□□□ 1.63
FBXO18-207ENST00000469009 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
FBXO18-207ENST00000469009 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.1■■□□□ 1.61
FBXO18-207ENST00000469009 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
FBXO18-207ENST00000469009 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.95■■□□□ 1.58
FBXO18-207ENST00000469009 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.75■■□□□ 1.55
FBXO18-207ENST00000469009 SCRIBQ14160 1630 aa24.64■■□□□ 1.54
FBXO18-207ENST00000469009 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.57■■□□□ 1.52
FBXO18-207ENST00000469009 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.51■■□□□ 1.51
FBXO18-207ENST00000469009 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
FBXO18-207ENST00000469009 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.7■■□□□ 1.38
FBXO18-207ENST00000469009 NCAPD3P42695 1498 aa23.64■■□□□ 1.38
FBXO18-207ENST00000469009 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.58■■□□□ 1.37
FBXO18-207ENST00000469009 CUX2O14529 1486 aa23.54■■□□□ 1.36
FBXO18-207ENST00000469009 SMARCA4P51532 1647 aa23.52■■□□□ 1.36
FBXO18-207ENST00000469009 ERCC6Q03468 1493 aa23.46■■□□□ 1.35
FBXO18-207ENST00000469009 SMARCA2P51531 1590 aa23.45■■□□□ 1.34
FBXO18-207ENST00000469009 HMGXB3Q12766 1538 aa23.44■■□□□ 1.34
FBXO18-207ENST00000469009 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
FBXO18-207ENST00000469009 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.31■■□□□ 1.32
FBXO18-207ENST00000469009 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.31■■□□□ 1.32
FBXO18-207ENST00000469009 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
FBXO18-207ENST00000469009 NESP48681 1621 aa23.3■■□□□ 1.32
FBXO18-207ENST00000469009 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
FBXO18-207ENST00000469009 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.11■■□□□ 1.29
FBXO18-207ENST00000469009 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.01■■□□□ 1.27
FBXO18-207ENST00000469009 WIZO95785 1651 aa22.97■■□□□ 1.27
FBXO18-207ENST00000469009 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.94■■□□□ 1.26
FBXO18-207ENST00000469009 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.91■■□□□ 1.26
FBXO18-207ENST00000469009 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
FBXO18-207ENST00000469009 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.8■■□□□ 1.24
FBXO18-207ENST00000469009 WDR62O43379 1518 aa22.79■■□□□ 1.24
FBXO18-207ENST00000469009 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
FBXO18-207ENST00000469009 CFTRP13569 1480 aa22.67■■□□□ 1.22
FBXO18-207ENST00000469009 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.66■■□□□ 1.22
FBXO18-207ENST00000469009 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.64■■□□□ 1.21
FBXO18-207ENST00000469009 TRIM41Q8WV44 630 aa22.53■■□□□ 1.2
FBXO18-207ENST00000469009 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
FBXO18-207ENST00000469009 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.47■■□□□ 1.19
FBXO18-207ENST00000469009 PRDM2Q13029 1718 aa22.36■■□□□ 1.17
FBXO18-207ENST00000469009 OSCARQ8IYS5 282 aa22.33■■□□□ 1.17
FBXO18-207ENST00000469009 TOPBP1Q92547 1522 aa22.22■■□□□ 1.15
FBXO18-207ENST00000469009 IFT140Q96RY7 1462 aa22.22■■□□□ 1.15
FBXO18-207ENST00000469009 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
FBXO18-207ENST00000469009 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.17■■□□□ 1.14
FBXO18-207ENST00000469009 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.17■■□□□ 1.14
FBXO18-207ENST00000469009 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.17■■□□□ 1.14
FBXO18-207ENST00000469009 ABCC8Q09428 1581 aa22.12■■□□□ 1.13
FBXO18-207ENST00000469009 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.12■■□□□ 1.13
FBXO18-207ENST00000469009 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
FBXO18-207ENST00000469009 ARHGEF11O15085 1522 aa22.07■■□□□ 1.12
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FBXO18-207ENST00000469009 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.95■■□□□ 1.1
FBXO18-207ENST00000469009 SOGA1O94964 1423 aa21.9■■□□□ 1.1
FBXO18-207ENST00000469009 CUX1P39880 1505 aa21.89■■□□□ 1.09
FBXO18-207ENST00000469009 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
FBXO18-207ENST00000469009 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.87■■□□□ 1.09
FBXO18-207ENST00000469009 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
FBXO18-207ENST00000469009 ARAP1Q96P48 1450 aa21.85■■□□□ 1.09
FBXO18-207ENST00000469009 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.8■■□□□ 1.08
FBXO18-207ENST00000469009 WDR97A6NE52 1622 aa21.78■■□□□ 1.08
FBXO18-207ENST00000469009 FBLN2P98095 1184 aa21.78■■□□□ 1.08
FBXO18-207ENST00000469009 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.76■■□□□ 1.07
FBXO18-207ENST00000469009 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.74■■□□□ 1.07
FBXO18-207ENST00000469009 GRIN2BQ13224 1484 aa21.69■■□□□ 1.06
FBXO18-207ENST00000469009 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
FBXO18-207ENST00000469009 SYNJ1O43426 1573 aa21.66■■□□□ 1.06
FBXO18-207ENST00000469009 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
FBXO18-207ENST00000469009 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.62■■□□□ 1.05
FBXO18-207ENST00000469009 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.62■■□□□ 1.05
FBXO18-207ENST00000469009 SYNJ2O15056 1496 aa21.61■■□□□ 1.05
FBXO18-207ENST00000469009 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
FBXO18-207ENST00000469009 PBRM1Q86U86 1689 aa21.58■■□□□ 1.05
FBXO18-207ENST00000469009 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.57■■□□□ 1.04
FBXO18-207ENST00000469009 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
FBXO18-207ENST00000469009 TOP2BQ02880 1626 aa21.5■■□□□ 1.03
FBXO18-207ENST00000469009 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.49■■□□□ 1.03
FBXO18-207ENST00000469009 GRIN2AQ12879 1464 aa21.42■■□□□ 1.02
FBXO18-207ENST00000469009 ADAMTS12P58397 1594 aa21.4■■□□□ 1.02
FBXO18-207ENST00000469009 NUP160Q12769 1436 aa21.38■■□□□ 1.01
FBXO18-207ENST00000469009 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.36■■□□□ 1.01
FBXO18-207ENST00000469009 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.36■■□□□ 1.01
FBXO18-207ENST00000469009 CEP170Q5SW79 1584 aa21.35■■□□□ 1.01
FBXO18-207ENST00000469009 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.33■■□□□ 1
FBXO18-207ENST00000469009 SHROOM2Q13796 1616 aa21.29■■□□□ 1
FBXO18-207ENST00000469009 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
FBXO18-207ENST00000469009 IGF1RP08069 1367 aa21.14■□□□□ 0.98
FBXO18-207ENST00000469009 JPH4Q96JJ6 628 aa21.14■□□□□ 0.97
FBXO18-207ENST00000469009 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
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