RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468530.1

EPAS1-208, Transcript of endothelial PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene EPAS1, Length 452 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPAS1-208ENST00000468530 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.64■■■□□ 2.17
EPAS1-208ENST00000468530 ABCC9O60706 1549 aa25.7■■□□□ 1.7
EPAS1-208ENST00000468530 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.29■■□□□ 1.64
EPAS1-208ENST00000468530 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.73■■□□□ 1.55
EPAS1-208ENST00000468530 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.2■■□□□ 1.46
EPAS1-208ENST00000468530 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
EPAS1-208ENST00000468530 NACADO15069 1562 aa23.9■■□□□ 1.42
EPAS1-208ENST00000468530 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.85■■□□□ 1.41
EPAS1-208ENST00000468530 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.79■■□□□ 1.4
EPAS1-208ENST00000468530 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.69■■□□□ 1.38
EPAS1-208ENST00000468530 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.62■■□□□ 1.37
EPAS1-208ENST00000468530 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.59■■□□□ 1.37
EPAS1-208ENST00000468530 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.51■■□□□ 1.35
EPAS1-208ENST00000468530 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.24■■□□□ 1.31
EPAS1-208ENST00000468530 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.23■■□□□ 1.31
EPAS1-208ENST00000468530 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.19■■□□□ 1.3
EPAS1-208ENST00000468530 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.17■■□□□ 1.3
EPAS1-208ENST00000468530 SCRIBQ14160 1630 aa23.03■■□□□ 1.28
EPAS1-208ENST00000468530 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
EPAS1-208ENST00000468530 CUX2O14529 1486 aa22.46■■□□□ 1.19
EPAS1-208ENST00000468530 ERCC6Q03468 1493 aa22.25■■□□□ 1.15
EPAS1-208ENST00000468530 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
EPAS1-208ENST00000468530 SMARCA4P51532 1647 aa22.13■■□□□ 1.13
EPAS1-208ENST00000468530 NCAPD3P42695 1498 aa22.09■■□□□ 1.13
EPAS1-208ENST00000468530 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.08■■□□□ 1.13
EPAS1-208ENST00000468530 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
EPAS1-208ENST00000468530 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.97■■□□□ 1.11
EPAS1-208ENST00000468530 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.9■■□□□ 1.1
EPAS1-208ENST00000468530 NESP48681 1621 aa21.88■■□□□ 1.09
EPAS1-208ENST00000468530 TRIM41Q8WV44 630 aa21.87■■□□□ 1.09
EPAS1-208ENST00000468530 WIZO95785 1651 aa21.85■■□□□ 1.09
EPAS1-208ENST00000468530 HMGXB3Q12766 1538 aa21.83■■□□□ 1.09
EPAS1-208ENST00000468530 SMARCA2P51531 1590 aa21.82■■□□□ 1.08
EPAS1-208ENST00000468530 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
EPAS1-208ENST00000468530 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
EPAS1-208ENST00000468530 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.66■■□□□ 1.06
EPAS1-208ENST00000468530 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
EPAS1-208ENST00000468530 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
EPAS1-208ENST00000468530 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.59■■□□□ 1.05
EPAS1-208ENST00000468530 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.55■■□□□ 1.04
EPAS1-208ENST00000468530 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.4■■□□□ 1.02
EPAS1-208ENST00000468530 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.38■■□□□ 1.01
EPAS1-208ENST00000468530 OSCARQ8IYS5 282 aa21.37■■□□□ 1.01
EPAS1-208ENST00000468530 WDR62O43379 1518 aa21.37■■□□□ 1.01
EPAS1-208ENST00000468530 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.37■■□□□ 1.01
EPAS1-208ENST00000468530 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.19■□□□□ 0.98
EPAS1-208ENST00000468530 CFTRP13569 1480 aa21.13■□□□□ 0.97
EPAS1-208ENST00000468530 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.11■□□□□ 0.97
EPAS1-208ENST00000468530 PRDM2Q13029 1718 aa21.08■□□□□ 0.97
EPAS1-208ENST00000468530 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.07■□□□□ 0.96
EPAS1-208ENST00000468530 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.07■□□□□ 0.96
EPAS1-208ENST00000468530 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.07■□□□□ 0.96
EPAS1-208ENST00000468530 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
EPAS1-208ENST00000468530 ARHGEF11O15085 1522 aa20.95■□□□□ 0.94
EPAS1-208ENST00000468530 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.88■□□□□ 0.93
EPAS1-208ENST00000468530 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
EPAS1-208ENST00000468530 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
EPAS1-208ENST00000468530 IFT140Q96RY7 1462 aa20.81■□□□□ 0.92
EPAS1-208ENST00000468530 ABCC8Q09428 1581 aa20.77■□□□□ 0.92
EPAS1-208ENST00000468530 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
EPAS1-208ENST00000468530 ARAP1Q96P48 1450 aa20.7■□□□□ 0.9
EPAS1-208ENST00000468530 SYNJ1O43426 1573 aa20.7■□□□□ 0.9
EPAS1-208ENST00000468530 CUX1P39880 1505 aa20.69■□□□□ 0.9
EPAS1-208ENST00000468530 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.69■□□□□ 0.9
EPAS1-208ENST00000468530 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.69■□□□□ 0.9
EPAS1-208ENST00000468530 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.66■□□□□ 0.9
EPAS1-208ENST00000468530 TOP2BQ02880 1626 aa20.66■□□□□ 0.9
EPAS1-208ENST00000468530 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
EPAS1-208ENST00000468530 TOPBP1Q92547 1522 aa20.63■□□□□ 0.89
EPAS1-208ENST00000468530 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.59■□□□□ 0.89
EPAS1-208ENST00000468530 CHD1O14646 1710 aa20.58■□□□□ 0.89
EPAS1-208ENST00000468530 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.882e-6■■■■□ 19.6
EPAS1-208ENST00000468530 FBLN2P98095 1184 aa20.56■□□□□ 0.88
EPAS1-208ENST00000468530 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.5■□□□□ 0.87
EPAS1-208ENST00000468530 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
EPAS1-208ENST00000468530 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
EPAS1-208ENST00000468530 WDR97A6NE52 1622 aa20.43■□□□□ 0.86
EPAS1-208ENST00000468530 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.38■□□□□ 0.85
EPAS1-208ENST00000468530 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.36■□□□□ 0.85
EPAS1-208ENST00000468530 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.34■□□□□ 0.85
EPAS1-208ENST00000468530 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
EPAS1-208ENST00000468530 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
EPAS1-208ENST00000468530 SOGA1O94964 1423 aa20.31■□□□□ 0.84
EPAS1-208ENST00000468530 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.3■□□□□ 0.84
EPAS1-208ENST00000468530 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.29■□□□□ 0.84
EPAS1-208ENST00000468530 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
EPAS1-208ENST00000468530 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.23■□□□□ 0.83
EPAS1-208ENST00000468530 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.22■□□□□ 0.83
EPAS1-208ENST00000468530 SYNJ2O15056 1496 aa20.2■□□□□ 0.82
EPAS1-208ENST00000468530 EEA1Q15075 1411 aa20.19■□□□□ 0.82
EPAS1-208ENST00000468530 GRIN2BQ13224 1484 aa20.19■□□□□ 0.82
EPAS1-208ENST00000468530 KIF27Q86VH2 1401 aa20.18■□□□□ 0.82
EPAS1-208ENST00000468530 PBRM1Q86U86 1689 aa20.13■□□□□ 0.81
EPAS1-208ENST00000468530 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.12■□□□□ 0.81
EPAS1-208ENST00000468530 IGF1RP08069 1367 aa20.05■□□□□ 0.8
EPAS1-208ENST00000468530 ADAMTS12P58397 1594 aa20.04■□□□□ 0.8
EPAS1-208ENST00000468530 CUL7Q14999 1698 aa20.04■□□□□ 0.8
EPAS1-208ENST00000468530 PRXQ9BXM0 1461 aa20.03■□□□□ 0.8
EPAS1-208ENST00000468530 KIF21BO75037 1637 aa20.02■□□□□ 0.8
EPAS1-208ENST00000468530 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 295.1 ms