RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466995.5

TIMM17B-205, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17B, humanhuman

TSL 2

Gene TIMM17B, Length 1,528 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17B-205ENST00000466995 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.12■■■■□ 3.37
TIMM17B-205ENST00000466995 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.93■■■□□ 2.7
TIMM17B-205ENST00000466995 ABCC9O60706 1549 aa30.99■■■□□ 2.55
TIMM17B-205ENST00000466995 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.2■■■□□ 2.42
TIMM17B-205ENST00000466995 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
TIMM17B-205ENST00000466995 NACADO15069 1562 aa29.95■■■□□ 2.38
TIMM17B-205ENST00000466995 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.93■■■□□ 2.38
TIMM17B-205ENST00000466995 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.85■■■□□ 2.37
TIMM17B-205ENST00000466995 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.82■■■□□ 2.36
TIMM17B-205ENST00000466995 SCRIBQ14160 1630 aa29.28■■■□□ 2.28
TIMM17B-205ENST00000466995 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.2■■■□□ 2.27
TIMM17B-205ENST00000466995 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.04■■■□□ 2.24
TIMM17B-205ENST00000466995 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.95■■■□□ 2.23
TIMM17B-205ENST00000466995 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.92■■■□□ 2.22
TIMM17B-205ENST00000466995 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
TIMM17B-205ENST00000466995 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.12■■■□□ 2.09
TIMM17B-205ENST00000466995 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.03■■■□□ 2.08
TIMM17B-205ENST00000466995 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.01■■■□□ 2.07
TIMM17B-205ENST00000466995 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
TIMM17B-205ENST00000466995 SMARCA4P51532 1647 aa27.97■■■□□ 2.07
TIMM17B-205ENST00000466995 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.87■■■□□ 2.05
TIMM17B-205ENST00000466995 SMARCA2P51531 1590 aa27.72■■■□□ 2.03
TIMM17B-205ENST00000466995 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.72■■■□□ 2.03
TIMM17B-205ENST00000466995 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
TIMM17B-205ENST00000466995 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.63■■■□□ 2.01
TIMM17B-205ENST00000466995 NCAPD3P42695 1498 aa27.61■■■□□ 2.01
TIMM17B-205ENST00000466995 WIZO95785 1651 aa27.6■■■□□ 2.01
TIMM17B-205ENST00000466995 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
TIMM17B-205ENST00000466995 HMGXB3Q12766 1538 aa27.53■■■□□ 2
TIMM17B-205ENST00000466995 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
TIMM17B-205ENST00000466995 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
TIMM17B-205ENST00000466995 CCDC88BA6NC98 1476 aa27■■□□□ 1.91
TIMM17B-205ENST00000466995 NESP48681 1621 aa26.9■■□□□ 1.9
TIMM17B-205ENST00000466995 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.86■■□□□ 1.89
TIMM17B-205ENST00000466995 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.86■■□□□ 1.89
TIMM17B-205ENST00000466995 CFTRP13569 1480 aa26.77■■□□□ 1.88
TIMM17B-205ENST00000466995 ERCC6Q03468 1493 aa26.73■■□□□ 1.87
TIMM17B-205ENST00000466995 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.7■■□□□ 1.86
TIMM17B-205ENST00000466995 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.6■■□□□ 1.85
TIMM17B-205ENST00000466995 PRDM2Q13029 1718 aa26.59■■□□□ 1.85
TIMM17B-205ENST00000466995 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.59■■□□□ 1.85
TIMM17B-205ENST00000466995 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.54■■□□□ 1.84
TIMM17B-205ENST00000466995 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.4■■□□□ 1.82
TIMM17B-205ENST00000466995 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
TIMM17B-205ENST00000466995 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
TIMM17B-205ENST00000466995 WDR62O43379 1518 aa26.28■■□□□ 1.8
TIMM17B-205ENST00000466995 CUX2O14529 1486 aa26.21■■□□□ 1.79
TIMM17B-205ENST00000466995 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.19■■□□□ 1.78
TIMM17B-205ENST00000466995 TOPBP1Q92547 1522 aa26.19■■□□□ 1.78
TIMM17B-205ENST00000466995 ABCC8Q09428 1581 aa26.19■■□□□ 1.78
TIMM17B-205ENST00000466995 CUX1P39880 1505 aa26.14■■□□□ 1.77
TIMM17B-205ENST00000466995 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.12■■□□□ 1.77
TIMM17B-205ENST00000466995 SYNJ1O43426 1573 aa26.03■■□□□ 1.76
TIMM17B-205ENST00000466995 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26■■□□□ 1.75
TIMM17B-205ENST00000466995 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
TIMM17B-205ENST00000466995 TOP2BQ02880 1626 aa25.99■■□□□ 1.75
TIMM17B-205ENST00000466995 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.97■■□□□ 1.75
TIMM17B-205ENST00000466995 IFT140Q96RY7 1462 aa25.94■■□□□ 1.74
TIMM17B-205ENST00000466995 SOGA1O94964 1423 aa25.91■■□□□ 1.74
TIMM17B-205ENST00000466995 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.9■■□□□ 1.74
TIMM17B-205ENST00000466995 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
TIMM17B-205ENST00000466995 TRIM41Q8WV44 630 aa25.82■■□□□ 1.72
TIMM17B-205ENST00000466995 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
TIMM17B-205ENST00000466995 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
TIMM17B-205ENST00000466995 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.73■■□□□ 1.71
TIMM17B-205ENST00000466995 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
TIMM17B-205ENST00000466995 WDR97A6NE52 1622 aa25.72■■□□□ 1.71
TIMM17B-205ENST00000466995 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.714e-6■■■■■ 31
TIMM17B-205ENST00000466995 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.68■■□□□ 1.7
TIMM17B-205ENST00000466995 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.62■■□□□ 1.69
TIMM17B-205ENST00000466995 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.6■■□□□ 1.69
TIMM17B-205ENST00000466995 GRIN2BQ13224 1484 aa25.56■■□□□ 1.68
TIMM17B-205ENST00000466995 KIF27Q86VH2 1401 aa25.56■■□□□ 1.68
TIMM17B-205ENST00000466995 PBRM1Q86U86 1689 aa25.54■■□□□ 1.68
TIMM17B-205ENST00000466995 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.5■■□□□ 1.67
TIMM17B-205ENST00000466995 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TIMM17B-205ENST00000466995 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.44■■□□□ 1.66
TIMM17B-205ENST00000466995 FBLN2P98095 1184 aa25.42■■□□□ 1.66
TIMM17B-205ENST00000466995 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.42■■□□□ 1.66
TIMM17B-205ENST00000466995 ADAMTS12P58397 1594 aa25.36■■□□□ 1.65
TIMM17B-205ENST00000466995 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
TIMM17B-205ENST00000466995 IGF1RP08069 1367 aa25.35■■□□□ 1.65
TIMM17B-205ENST00000466995 SYNJ2O15056 1496 aa25.35■■□□□ 1.65
TIMM17B-205ENST00000466995 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
TIMM17B-205ENST00000466995 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.33■■□□□ 1.65
TIMM17B-205ENST00000466995 CHD1O14646 1710 aa25.32■■□□□ 1.64
TIMM17B-205ENST00000466995 CUL7Q14999 1698 aa25.3■■□□□ 1.64
TIMM17B-205ENST00000466995 EEA1Q15075 1411 aa25.28■■□□□ 1.64
TIMM17B-205ENST00000466995 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.25■■□□□ 1.63
TIMM17B-205ENST00000466995 GRIN2AQ12879 1464 aa25.23■■□□□ 1.63
TIMM17B-205ENST00000466995 OSCARQ8IYS5 282 aa25.22■■□□□ 1.63
TIMM17B-205ENST00000466995 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.22■■□□□ 1.63
TIMM17B-205ENST00000466995 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.15■■□□□ 1.62
TIMM17B-205ENST00000466995 PRXQ9BXM0 1461 aa25.11■■□□□ 1.61
TIMM17B-205ENST00000466995 CEP170Q5SW79 1584 aa25.08■■□□□ 1.61
TIMM17B-205ENST00000466995 NUP160Q12769 1436 aa25.07■■□□□ 1.6
TIMM17B-205ENST00000466995 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.04■■□□□ 1.6
TIMM17B-205ENST00000466995 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.02■■□□□ 1.6
TIMM17B-205ENST00000466995 KIF21BO75037 1637 aa24.99■■□□□ 1.59
TIMM17B-205ENST00000466995 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.2 ms