RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466624.1

GPC1-207, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 782 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-207ENST00000466624 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.26■■■■□ 3.72
GPC1-207ENST00000466624 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.93■■■■□ 3.02
GPC1-207ENST00000466624 ABCC9O60706 1549 aa32.62■■■□□ 2.81
GPC1-207ENST00000466624 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
GPC1-207ENST00000466624 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.75■■■□□ 2.67
GPC1-207ENST00000466624 NACADO15069 1562 aa31.75■■■□□ 2.67
GPC1-207ENST00000466624 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.75■■■□□ 2.67
GPC1-207ENST00000466624 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.67■■■□□ 2.66
GPC1-207ENST00000466624 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.6■■■□□ 2.65
GPC1-207ENST00000466624 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31■■■□□ 2.55
GPC1-207ENST00000466624 SCRIBQ14160 1630 aa30.87■■■□□ 2.53
GPC1-207ENST00000466624 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.68■■■□□ 2.5
GPC1-207ENST00000466624 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.49■■■□□ 2.47
GPC1-207ENST00000466624 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.48■■■□□ 2.47
GPC1-207ENST00000466624 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
GPC1-207ENST00000466624 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.69■■■□□ 2.34
GPC1-207ENST00000466624 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
GPC1-207ENST00000466624 SMARCA4P51532 1647 aa29.62■■■□□ 2.33
GPC1-207ENST00000466624 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.6■■■□□ 2.33
GPC1-207ENST00000466624 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.5■■■□□ 2.31
GPC1-207ENST00000466624 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.46■■■□□ 2.31
GPC1-207ENST00000466624 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.37■■■□□ 2.29
GPC1-207ENST00000466624 SMARCA2P51531 1590 aa29.35■■■□□ 2.29
GPC1-207ENST00000466624 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.31■■■□□ 2.28
GPC1-207ENST00000466624 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
GPC1-207ENST00000466624 NCAPD3P42695 1498 aa29.26■■■□□ 2.27
GPC1-207ENST00000466624 HMGXB3Q12766 1538 aa29.2■■■□□ 2.26
GPC1-207ENST00000466624 WIZO95785 1651 aa29.18■■■□□ 2.26
GPC1-207ENST00000466624 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
GPC1-207ENST00000466624 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
GPC1-207ENST00000466624 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
GPC1-207ENST00000466624 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.53■■■□□ 2.16
GPC1-207ENST00000466624 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.45■■■□□ 2.15
GPC1-207ENST00000466624 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.39■■■□□ 2.14
GPC1-207ENST00000466624 NESP48681 1621 aa28.36■■■□□ 2.13
GPC1-207ENST00000466624 CFTRP13569 1480 aa28.34■■■□□ 2.13
GPC1-207ENST00000466624 PRDM2Q13029 1718 aa28.28■■■□□ 2.12
GPC1-207ENST00000466624 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.19■■■□□ 2.1
GPC1-207ENST00000466624 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.13■■■□□ 2.09
GPC1-207ENST00000466624 ERCC6Q03468 1493 aa28.1■■■□□ 2.09
GPC1-207ENST00000466624 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.07■■■□□ 2.08
GPC1-207ENST00000466624 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.01■■■□□ 2.07
GPC1-207ENST00000466624 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
GPC1-207ENST00000466624 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.89■■■□□ 2.05
GPC1-207ENST00000466624 WDR62O43379 1518 aa27.82■■■□□ 2.04
GPC1-207ENST00000466624 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
GPC1-207ENST00000466624 ABCC8Q09428 1581 aa27.75■■■□□ 2.03
GPC1-207ENST00000466624 CUX2O14529 1486 aa27.73■■■□□ 2.03
GPC1-207ENST00000466624 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.72■■■□□ 2.03
GPC1-207ENST00000466624 TOPBP1Q92547 1522 aa27.68■■■□□ 2.02
GPC1-207ENST00000466624 CUX1P39880 1505 aa27.62■■■□□ 2.01
GPC1-207ENST00000466624 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.59■■■□□ 2.01
GPC1-207ENST00000466624 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.56■■■□□ 2
GPC1-207ENST00000466624 TOP2BQ02880 1626 aa27.54■■■□□ 2
GPC1-207ENST00000466624 SYNJ1O43426 1573 aa27.52■■■□□ 2
GPC1-207ENST00000466624 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
GPC1-207ENST00000466624 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.45■■□□□ 1.99
GPC1-207ENST00000466624 IFT140Q96RY7 1462 aa27.42■■□□□ 1.98
GPC1-207ENST00000466624 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
GPC1-207ENST00000466624 SOGA1O94964 1423 aa27.33■■□□□ 1.97
GPC1-207ENST00000466624 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.3■■□□□ 1.96
GPC1-207ENST00000466624 WDR97A6NE52 1622 aa27.3■■□□□ 1.96
GPC1-207ENST00000466624 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.25■■□□□ 1.95
GPC1-207ENST00000466624 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
GPC1-207ENST00000466624 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
GPC1-207ENST00000466624 TRIM41Q8WV44 630 aa27.15■■□□□ 1.94
GPC1-207ENST00000466624 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.12■■□□□ 1.93
GPC1-207ENST00000466624 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.1■■□□□ 1.93
GPC1-207ENST00000466624 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
GPC1-207ENST00000466624 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.08■■□□□ 1.93
GPC1-207ENST00000466624 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.05■■□□□ 1.92
GPC1-207ENST00000466624 PBRM1Q86U86 1689 aa27.04■■□□□ 1.92
GPC1-207ENST00000466624 GRIN2BQ13224 1484 aa27■■□□□ 1.91
GPC1-207ENST00000466624 KIF27Q86VH2 1401 aa26.99■■□□□ 1.91
GPC1-207ENST00000466624 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.95■■□□□ 1.9
GPC1-207ENST00000466624 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
GPC1-207ENST00000466624 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.88■■□□□ 1.89
GPC1-207ENST00000466624 ADAMTS12P58397 1594 aa26.82■■□□□ 1.88
GPC1-207ENST00000466624 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.81■■□□□ 1.88
GPC1-207ENST00000466624 CUL7Q14999 1698 aa26.81■■□□□ 1.88
GPC1-207ENST00000466624 IGF1RP08069 1367 aa26.8■■□□□ 1.88
GPC1-207ENST00000466624 EEA1Q15075 1411 aa26.79■■□□□ 1.88
GPC1-207ENST00000466624 SYNJ2O15056 1496 aa26.79■■□□□ 1.88
GPC1-207ENST00000466624 CHD1O14646 1710 aa26.77■■□□□ 1.88
GPC1-207ENST00000466624 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.76■■□□□ 1.87
GPC1-207ENST00000466624 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
GPC1-207ENST00000466624 GRIN2AQ12879 1464 aa26.66■■□□□ 1.86
GPC1-207ENST00000466624 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.65■■□□□ 1.86
GPC1-207ENST00000466624 FBLN2P98095 1184 aa26.61■■□□□ 1.85
GPC1-207ENST00000466624 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.6■■□□□ 1.85
GPC1-207ENST00000466624 PRXQ9BXM0 1461 aa26.59■■□□□ 1.85
GPC1-207ENST00000466624 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.57■■□□□ 1.84
GPC1-207ENST00000466624 OSCARQ8IYS5 282 aa26.57■■□□□ 1.84
GPC1-207ENST00000466624 NUP160Q12769 1436 aa26.53■■□□□ 1.84
GPC1-207ENST00000466624 CEP170Q5SW79 1584 aa26.51■■□□□ 1.83
GPC1-207ENST00000466624 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
GPC1-207ENST00000466624 KIF21BO75037 1637 aa26.5■■□□□ 1.83
GPC1-207ENST00000466624 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.49■■□□□ 1.83
GPC1-207ENST00000466624 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.38■■□□□ 1.81
GPC1-207ENST00000466624 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.38■■□□□ 1.81
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