RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465150.6

TIMM17B-204, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TIMM17B, Length 964 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17B-204ENST00000465150 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.31■■■□□ 2.92
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TIMM17B-204ENST00000465150 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.69■■■□□ 2.18
TIMM17B-204ENST00000465150 NACADO15069 1562 aa28.45■■■□□ 2.14
TIMM17B-204ENST00000465150 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.38■■■□□ 2.13
TIMM17B-204ENST00000465150 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.11■■■□□ 2.09
TIMM17B-204ENST00000465150 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.03■■■□□ 2.08
TIMM17B-204ENST00000465150 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.98■■■□□ 2.07
TIMM17B-204ENST00000465150 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.97■■■□□ 2.07
TIMM17B-204ENST00000465150 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.8■■■□□ 2.04
TIMM17B-204ENST00000465150 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.58■■■□□ 2.01
TIMM17B-204ENST00000465150 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
TIMM17B-204ENST00000465150 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.56■■■□□ 2
TIMM17B-204ENST00000465150 SCRIBQ14160 1630 aa27.27■■□□□ 1.96
TIMM17B-204ENST00000465150 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.24■■□□□ 1.95
TIMM17B-204ENST00000465150 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.2■■□□□ 1.95
TIMM17B-204ENST00000465150 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
TIMM17B-204ENST00000465150 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.31■■□□□ 1.8
TIMM17B-204ENST00000465150 NCAPD3P42695 1498 aa26.24■■□□□ 1.79
TIMM17B-204ENST00000465150 CUX2O14529 1486 aa26.16■■□□□ 1.78
TIMM17B-204ENST00000465150 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.1■■□□□ 1.77
TIMM17B-204ENST00000465150 ERCC6Q03468 1493 aa26.09■■□□□ 1.77
TIMM17B-204ENST00000465150 SMARCA2P51531 1590 aa26.07■■□□□ 1.76
TIMM17B-204ENST00000465150 HMGXB3Q12766 1538 aa26.06■■□□□ 1.76
TIMM17B-204ENST00000465150 SMARCA4P51532 1647 aa26.03■■□□□ 1.76
TIMM17B-204ENST00000465150 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
TIMM17B-204ENST00000465150 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
TIMM17B-204ENST00000465150 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.83■■□□□ 1.73
TIMM17B-204ENST00000465150 NESP48681 1621 aa25.81■■□□□ 1.72
TIMM17B-204ENST00000465150 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.71■■□□□ 1.71
TIMM17B-204ENST00000465150 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
TIMM17B-204ENST00000465150 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.62■■□□□ 1.69
TIMM17B-204ENST00000465150 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.55■■□□□ 1.68
TIMM17B-204ENST00000465150 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.52■■□□□ 1.68
TIMM17B-204ENST00000465150 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.42■■□□□ 1.66
TIMM17B-204ENST00000465150 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.33■■□□□ 1.65
TIMM17B-204ENST00000465150 WIZO95785 1651 aa25.3■■□□□ 1.64
TIMM17B-204ENST00000465150 WDR62O43379 1518 aa25.28■■□□□ 1.64
TIMM17B-204ENST00000465150 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.19■■□□□ 1.62
TIMM17B-204ENST00000465150 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.12■■□□□ 1.61
TIMM17B-204ENST00000465150 CFTRP13569 1480 aa25.09■■□□□ 1.61
TIMM17B-204ENST00000465150 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
TIMM17B-204ENST00000465150 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TIMM17B-204ENST00000465150 TRIM41Q8WV44 630 aa25.01■■□□□ 1.59
TIMM17B-204ENST00000465150 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
TIMM17B-204ENST00000465150 OSCARQ8IYS5 282 aa24.88■■□□□ 1.57
TIMM17B-204ENST00000465150 PRDM2Q13029 1718 aa24.86■■□□□ 1.57
TIMM17B-204ENST00000465150 IFT140Q96RY7 1462 aa24.7■■□□□ 1.55
TIMM17B-204ENST00000465150 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.7■■□□□ 1.54
TIMM17B-204ENST00000465150 ABCC8Q09428 1581 aa24.63■■□□□ 1.53
TIMM17B-204ENST00000465150 TOPBP1Q92547 1522 aa24.62■■□□□ 1.53
TIMM17B-204ENST00000465150 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
TIMM17B-204ENST00000465150 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.57■■□□□ 1.52
TIMM17B-204ENST00000465150 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.57■■□□□ 1.52
TIMM17B-204ENST00000465150 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.57■■□□□ 1.52
TIMM17B-204ENST00000465150 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.54■■□□□ 1.52
TIMM17B-204ENST00000465150 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
TIMM17B-204ENST00000465150 ARHGEF11O15085 1522 aa24.48■■□□□ 1.51
TIMM17B-204ENST00000465150 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
TIMM17B-204ENST00000465150 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.36■■□□□ 1.494e-6■■■■■ 31
TIMM17B-204ENST00000465150 CHD1O14646 1710 aa24.35■■□□□ 1.49
TIMM17B-204ENST00000465150 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TIMM17B-204ENST00000465150 WDR97A6NE52 1622 aa24.26■■□□□ 1.47
TIMM17B-204ENST00000465150 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
TIMM17B-204ENST00000465150 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.25■■□□□ 1.47
TIMM17B-204ENST00000465150 FBLN2P98095 1184 aa24.23■■□□□ 1.47
TIMM17B-204ENST00000465150 SOGA1O94964 1423 aa24.23■■□□□ 1.47
TIMM17B-204ENST00000465150 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.21■■□□□ 1.47
TIMM17B-204ENST00000465150 ARAP1Q96P48 1450 aa24.2■■□□□ 1.47
TIMM17B-204ENST00000465150 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TIMM17B-204ENST00000465150 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.16■■□□□ 1.46
TIMM17B-204ENST00000465150 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.13■■□□□ 1.45
TIMM17B-204ENST00000465150 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
TIMM17B-204ENST00000465150 CUX1P39880 1505 aa24.1■■□□□ 1.45
TIMM17B-204ENST00000465150 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.1■■□□□ 1.45
TIMM17B-204ENST00000465150 SYNJ1O43426 1573 aa24.09■■□□□ 1.45
TIMM17B-204ENST00000465150 GRIN2BQ13224 1484 aa24.08■■□□□ 1.45
TIMM17B-204ENST00000465150 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
TIMM17B-204ENST00000465150 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
TIMM17B-204ENST00000465150 SYNJ2O15056 1496 aa24.03■■□□□ 1.44
TIMM17B-204ENST00000465150 PBRM1Q86U86 1689 aa23.95■■□□□ 1.43
TIMM17B-204ENST00000465150 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.95■■□□□ 1.42
TIMM17B-204ENST00000465150 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.91■■□□□ 1.42
TIMM17B-204ENST00000465150 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.88■■□□□ 1.41
TIMM17B-204ENST00000465150 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.78■■□□□ 1.4
TIMM17B-204ENST00000465150 GRIN2AQ12879 1464 aa23.76■■□□□ 1.39
TIMM17B-204ENST00000465150 ADAMTS12P58397 1594 aa23.72■■□□□ 1.39
TIMM17B-204ENST00000465150 TOP2BQ02880 1626 aa23.7■■□□□ 1.39
TIMM17B-204ENST00000465150 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.7■■□□□ 1.39
TIMM17B-204ENST00000465150 NUP160Q12769 1436 aa23.69■■□□□ 1.38
TIMM17B-204ENST00000465150 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.66■■□□□ 1.38
TIMM17B-204ENST00000465150 CEP170Q5SW79 1584 aa23.65■■□□□ 1.38
TIMM17B-204ENST00000465150 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.63■■□□□ 1.37
TIMM17B-204ENST00000465150 SHROOM2Q13796 1616 aa23.62■■□□□ 1.37
TIMM17B-204ENST00000465150 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.62■■□□□ 1.37
TIMM17B-204ENST00000465150 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
TIMM17B-204ENST00000465150 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
TIMM17B-204ENST00000465150 JPH4Q96JJ6 628 aa23.41■■□□□ 1.34
TIMM17B-204ENST00000465150 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.39■■□□□ 1.34
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