RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465125.1

RERE-208, Transcript of arginine-glutamic acid dipeptide repeats, humanhuman

TSL 5

Gene RERE, Length 396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERE-208ENST00000465125 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.15■■■■■ 6.9
RERE-208ENST00000465125 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.44■■■■■ 5.83
RERE-208ENST00000465125 ABCC9O60706 1549 aa49.65■■■■■ 5.54
RERE-208ENST00000465125 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.6■■■■■ 5.37
RERE-208ENST00000465125 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.29■■■■■ 5.32
RERE-208ENST00000465125 NACADO15069 1562 aa48.17■■■■■ 5.3
RERE-208ENST00000465125 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.15■■■■■ 5.3
RERE-208ENST00000465125 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.09■■■■■ 5.29
RERE-208ENST00000465125 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.09■■■■■ 5.29
RERE-208ENST00000465125 SCRIBQ14160 1630 aa47.01■■■■■ 5.12
RERE-208ENST00000465125 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.99■■■■■ 5.11
RERE-208ENST00000465125 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.56■■■■■ 5.04
RERE-208ENST00000465125 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.48■■■■■ 5.03
RERE-208ENST00000465125 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.37■■■■■ 5.01
RERE-208ENST00000465125 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.3■■■■■ 4.84
RERE-208ENST00000465125 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.2■■■■■ 4.83
RERE-208ENST00000465125 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.05■■■■■ 4.8
RERE-208ENST00000465125 SMARCA4P51532 1647 aa45.01■■■■■ 4.8
RERE-208ENST00000465125 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.95■■■■■ 4.79
RERE-208ENST00000465125 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.86■■■■■ 4.77
RERE-208ENST00000465125 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.82■■■■■ 4.77
RERE-208ENST00000465125 SMARCA2P51531 1590 aa44.57■■■■■ 4.73
RERE-208ENST00000465125 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.55■■■■■ 4.72
RERE-208ENST00000465125 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.55■■■■■ 4.72
RERE-208ENST00000465125 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.52■■■■■ 4.72
RERE-208ENST00000465125 NCAPD3P42695 1498 aa44.4■■■■■ 4.7
RERE-208ENST00000465125 WIZO95785 1651 aa44.39■■■■■ 4.7
RERE-208ENST00000465125 HMGXB3Q12766 1538 aa44.3■■■■■ 4.68
RERE-208ENST00000465125 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.27■■■■■ 4.68
RERE-208ENST00000465125 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.99■■■■■ 4.63
RERE-208ENST00000465125 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.94■■■■■ 4.62
RERE-208ENST00000465125 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.43■■■■■ 4.54
RERE-208ENST00000465125 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.18■■■■■ 4.5
RERE-208ENST00000465125 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.16■■■■■ 4.5
RERE-208ENST00000465125 NESP48681 1621 aa43.15■■■■■ 4.5
RERE-208ENST00000465125 CFTRP13569 1480 aa43.05■■■■■ 4.48
RERE-208ENST00000465125 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.86■■■■■ 4.45
RERE-208ENST00000465125 PRDM2Q13029 1718 aa42.85■■■■■ 4.45
RERE-208ENST00000465125 ERCC6Q03468 1493 aa42.78■■■■■ 4.44
RERE-208ENST00000465125 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.7■■■■■ 4.43
RERE-208ENST00000465125 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.7■■■■■ 4.43
RERE-208ENST00000465125 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.6■■■■■ 4.41
RERE-208ENST00000465125 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.39■■■■■ 4.38
RERE-208ENST00000465125 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
RERE-208ENST00000465125 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
RERE-208ENST00000465125 WDR62O43379 1518 aa42.21■■■■■ 4.35
RERE-208ENST00000465125 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.13■■■■■ 4.33
RERE-208ENST00000465125 ABCC8Q09428 1581 aa42.12■■■■■ 4.33
RERE-208ENST00000465125 TOPBP1Q92547 1522 aa42.09■■■■■ 4.33
RERE-208ENST00000465125 CUX2O14529 1486 aa42.05■■■■■ 4.32
RERE-208ENST00000465125 CUX1P39880 1505 aa42.03■■■■■ 4.32
RERE-208ENST00000465125 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.02■■■■■ 4.32
RERE-208ENST00000465125 SYNJ1O43426 1573 aa41.88■■■■■ 4.3
RERE-208ENST00000465125 TOP2BQ02880 1626 aa41.86■■■■■ 4.29
RERE-208ENST00000465125 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.86■■■■■ 4.29
RERE-208ENST00000465125 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.79■■■■■ 4.28
RERE-208ENST00000465125 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
RERE-208ENST00000465125 IFT140Q96RY7 1462 aa41.66■■■■■ 4.26
RERE-208ENST00000465125 SOGA1O94964 1423 aa41.61■■■■■ 4.25
RERE-208ENST00000465125 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
RERE-208ENST00000465125 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.57■■■■■ 4.25
RERE-208ENST00000465125 TRIM41Q8WV44 630 aa41.47■■■■■ 4.23
RERE-208ENST00000465125 WDR97A6NE52 1622 aa41.42■■■■■ 4.22
RERE-208ENST00000465125 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.4■■■■■ 4.22
RERE-208ENST00000465125 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
RERE-208ENST00000465125 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.38■■■■■ 4.21
RERE-208ENST00000465125 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
RERE-208ENST00000465125 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
RERE-208ENST00000465125 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.24■■■■■ 4.19
RERE-208ENST00000465125 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.2■■■■■ 4.19
RERE-208ENST00000465125 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.15■■■■■ 4.18
RERE-208ENST00000465125 KIF27Q86VH2 1401 aa41.09■■■■■ 4.17
RERE-208ENST00000465125 GRIN2BQ13224 1484 aa41.06■■■■■ 4.16
RERE-208ENST00000465125 PBRM1Q86U86 1689 aa41.06■■■■■ 4.16
RERE-208ENST00000465125 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.93■■■■■ 4.14
RERE-208ENST00000465125 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.92■■■■■ 4.14
RERE-208ENST00000465125 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
RERE-208ENST00000465125 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.88■■■■■ 4.14
RERE-208ENST00000465125 IGF1RP08069 1367 aa40.78■■■■■ 4.12
RERE-208ENST00000465125 ADAMTS12P58397 1594 aa40.78■■■■■ 4.12
RERE-208ENST00000465125 EEA1Q15075 1411 aa40.76■■■■■ 4.12
RERE-208ENST00000465125 CUL7Q14999 1698 aa40.72■■■■■ 4.11
RERE-208ENST00000465125 SYNJ2O15056 1496 aa40.71■■■■■ 4.11
RERE-208ENST00000465125 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.7■■■■■ 4.11
RERE-208ENST00000465125 CHD1O14646 1710 aa40.66■■■■■ 4.1
RERE-208ENST00000465125 FBLN2P98095 1184 aa40.64■■■■■ 4.1
RERE-208ENST00000465125 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.62■■■■■ 4.09
RERE-208ENST00000465125 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
RERE-208ENST00000465125 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.59■■■■■ 4.09
RERE-208ENST00000465125 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.56■■■■■ 4.08
RERE-208ENST00000465125 GRIN2AQ12879 1464 aa40.53■■■■■ 4.08
RERE-208ENST00000465125 PRXQ9BXM0 1461 aa40.45■■■■■ 4.07
RERE-208ENST00000465125 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.45■■■■■ 4.07
RERE-208ENST00000465125 OSCARQ8IYS5 282 aa40.39■■■■■ 4.06
RERE-208ENST00000465125 CEP170Q5SW79 1584 aa40.31■■■■■ 4.04
RERE-208ENST00000465125 NUP160Q12769 1436 aa40.3■■■■■ 4.04
RERE-208ENST00000465125 KIF21BO75037 1637 aa40.3■■■■■ 4.04
RERE-208ENST00000465125 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.21■■■■■ 4.03
RERE-208ENST00000465125 GOLGA3Q08378 1498 aa40.13■■■■■ 4.01
RERE-208ENST00000465125 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.1■■■■■ 4.01
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