RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463965.1

SURF1-203, Transcript of SURF1, cytochrome c oxidase assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SURF1, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1-203ENST00000463965 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.16■■■■■ 7.7
SURF1-203ENST00000463965 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.09■■■■■ 6.57
SURF1-203ENST00000463965 ABCC9O60706 1549 aa54.89■■■■■ 6.38
SURF1-203ENST00000463965 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.93■■■■■ 6.06
SURF1-203ENST00000463965 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.84■■■■■ 6.05
SURF1-203ENST00000463965 NACADO15069 1562 aa52.79■■■■■ 6.04
SURF1-203ENST00000463965 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.6■■■■■ 6.01
SURF1-203ENST00000463965 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.48■■■■■ 5.99
SURF1-203ENST00000463965 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.26■■■■■ 5.96
SURF1-203ENST00000463965 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.48■■■■■ 5.83
SURF1-203ENST00000463965 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.35■■■■■ 5.81
SURF1-203ENST00000463965 SCRIBQ14160 1630 aa51.2■■■■■ 5.79
SURF1-203ENST00000463965 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.12■■■■■ 5.77
SURF1-203ENST00000463965 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.71■■■■■ 5.71
SURF1-203ENST00000463965 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.29■■■■■ 5.64
SURF1-203ENST00000463965 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.83■■■■■ 5.57
SURF1-203ENST00000463965 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.61■■■■■ 5.53
SURF1-203ENST00000463965 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.33■■■■■ 5.49
SURF1-203ENST00000463965 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.98■■■■■ 5.43
SURF1-203ENST00000463965 SMARCA4P51532 1647 aa48.97■■■■■ 5.43
SURF1-203ENST00000463965 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.73■■■■■ 5.39
SURF1-203ENST00000463965 NCAPD3P42695 1498 aa48.71■■■■■ 5.39
SURF1-203ENST00000463965 SMARCA2P51531 1590 aa48.71■■■■■ 5.39
SURF1-203ENST00000463965 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.64■■■■■ 5.38
SURF1-203ENST00000463965 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.48■■■■■ 5.35
SURF1-203ENST00000463965 HMGXB3Q12766 1538 aa48.44■■■■■ 5.35
SURF1-203ENST00000463965 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.37■■■■■ 5.33
SURF1-203ENST00000463965 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.15■■■■■ 5.3
SURF1-203ENST00000463965 WIZO95785 1651 aa48.11■■■■■ 5.29
SURF1-203ENST00000463965 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.65■■■■■ 5.22
SURF1-203ENST00000463965 NESP48681 1621 aa47.47■■■■■ 5.19
SURF1-203ENST00000463965 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.41■■■■■ 5.18
SURF1-203ENST00000463965 ERCC6Q03468 1493 aa47.39■■■■■ 5.18
SURF1-203ENST00000463965 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.33■■■■■ 5.17
SURF1-203ENST00000463965 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.17■■■■■ 5.14
SURF1-203ENST00000463965 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.1■■■■■ 5.13
SURF1-203ENST00000463965 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.09■■■■■ 5.13
SURF1-203ENST00000463965 CFTRP13569 1480 aa47.02■■■■■ 5.12
SURF1-203ENST00000463965 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.87■■■■■ 5.09
SURF1-203ENST00000463965 CUX2O14529 1486 aa46.82■■■■■ 5.09
SURF1-203ENST00000463965 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.76■■■■■ 5.08
SURF1-203ENST00000463965 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.71■■■■■ 5.07
SURF1-203ENST00000463965 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.7■■■■■ 5.07
SURF1-203ENST00000463965 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.62■■■■■ 5.05
SURF1-203ENST00000463965 PRDM2Q13029 1718 aa46.58■■■■■ 5.05
SURF1-203ENST00000463965 WDR62O43379 1518 aa46.42■■■■■ 5.02
SURF1-203ENST00000463965 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.23■■■■■ 4.99
SURF1-203ENST00000463965 ABCC8Q09428 1581 aa46.09■■■■■ 4.97
SURF1-203ENST00000463965 TOPBP1Q92547 1522 aa45.99■■■■■ 4.95
SURF1-203ENST00000463965 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.94■■■■■ 4.94
SURF1-203ENST00000463965 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.77■■■■■ 4.92
SURF1-203ENST00000463965 IFT140Q96RY7 1462 aa45.74■■■■■ 4.91
SURF1-203ENST00000463965 CUX1P39880 1505 aa45.63■■■■■ 4.9
SURF1-203ENST00000463965 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.61■■■■■ 4.89
SURF1-203ENST00000463965 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.51■■■■■ 4.88
SURF1-203ENST00000463965 SOGA1O94964 1423 aa45.49■■■■■ 4.87
SURF1-203ENST00000463965 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.45■■■■■ 4.87
SURF1-203ENST00000463965 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.44■■■■■ 4.87
SURF1-203ENST00000463965 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.43■■■■■ 4.86
SURF1-203ENST00000463965 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.41■■■■■ 4.86
SURF1-203ENST00000463965 TOP2BQ02880 1626 aa45.27■■■■■ 4.84
SURF1-203ENST00000463965 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.26■■■■■ 4.84
SURF1-203ENST00000463965 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.25■■■■■ 4.83
SURF1-203ENST00000463965 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.23■■■■■ 4.83
SURF1-203ENST00000463965 SYNJ1O43426 1573 aa45.22■■■■■ 4.83
SURF1-203ENST00000463965 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.2■■■■■ 4.83
SURF1-203ENST00000463965 WDR97A6NE52 1622 aa45.15■■■■■ 4.82
SURF1-203ENST00000463965 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.08■■■■■ 4.81
SURF1-203ENST00000463965 OSCARQ8IYS5 282 aa44.99■■■■■ 4.79
SURF1-203ENST00000463965 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.95■■■■■ 4.79
SURF1-203ENST00000463965 GRIN2BQ13224 1484 aa44.94■■■■■ 4.78
SURF1-203ENST00000463965 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.83■■■■■ 4.77
SURF1-203ENST00000463965 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.83■■■■■ 4.77
SURF1-203ENST00000463965 FBLN2P98095 1184 aa44.82■■■■■ 4.77
SURF1-203ENST00000463965 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.8■■■■■ 4.76
SURF1-203ENST00000463965 PBRM1Q86U86 1689 aa44.74■■■■■ 4.75
SURF1-203ENST00000463965 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.71■■■■■ 4.75
SURF1-203ENST00000463965 CHD1O14646 1710 aa44.66■■■■■ 4.74
SURF1-203ENST00000463965 SYNJ2O15056 1496 aa44.62■■■■■ 4.73
SURF1-203ENST00000463965 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.55■■■■■ 4.72
SURF1-203ENST00000463965 KIF27Q86VH2 1401 aa44.54■■■■■ 4.72
SURF1-203ENST00000463965 TRIM41Q8WV44 630 aa44.51■■■■■ 4.72
SURF1-203ENST00000463965 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.44■■■■■ 4.7
SURF1-203ENST00000463965 ADAMTS12P58397 1594 aa44.42■■■■■ 4.7
SURF1-203ENST00000463965 GRIN2AQ12879 1464 aa44.33■■■■■ 4.69
SURF1-203ENST00000463965 IGF1RP08069 1367 aa44.3■■■■■ 4.68
SURF1-203ENST00000463965 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.19■■■■■ 4.67
SURF1-203ENST00000463965 CUL7Q14999 1698 aa44.14■■■■■ 4.66
SURF1-203ENST00000463965 NUP160Q12769 1436 aa44.12■■■■■ 4.65
SURF1-203ENST00000463965 ARHGEF11O15085 1522 aa44.12■■■■■ 4.65
SURF1-203ENST00000463965 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.1■■■■■ 4.65
SURF1-203ENST00000463965 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.1■■■■■ 4.65
SURF1-203ENST00000463965 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.1■■■■■ 4.65
SURF1-203ENST00000463965 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.08■■■■■ 4.65
SURF1-203ENST00000463965 CEP170Q5SW79 1584 aa44.05■■■■■ 4.64
SURF1-203ENST00000463965 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.02■■■■■ 4.64
SURF1-203ENST00000463965 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.92■■■■■ 4.62
SURF1-203ENST00000463965 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.82■■■■■ 4.61
SURF1-203ENST00000463965 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.8■■■■■ 4.6
SURF1-203ENST00000463965 JPH4Q96JJ6 628 aa43.77■■■■■ 4.6
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