RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463190.1

ITGB1BP1-208, Transcript of integrin subunit beta 1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene ITGB1BP1, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1BP1-208ENST00000463190 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.3■■■■□ 3.88
ITGB1BP1-208ENST00000463190 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.11■■■■□ 3.21
ITGB1BP1-208ENST00000463190 ABCC9O60706 1549 aa34.81■■■■□ 3.16
ITGB1BP1-208ENST00000463190 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.3■■■□□ 2.92
ITGB1BP1-208ENST00000463190 NACADO15069 1562 aa33.17■■■□□ 2.9
ITGB1BP1-208ENST00000463190 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.07■■■□□ 2.88
ITGB1BP1-208ENST00000463190 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.83■■■□□ 2.85
ITGB1BP1-208ENST00000463190 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.63■■■□□ 2.81
ITGB1BP1-208ENST00000463190 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.51■■■□□ 2.8
ITGB1BP1-208ENST00000463190 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.46■■■□□ 2.79
ITGB1BP1-208ENST00000463190 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.42■■■□□ 2.78
ITGB1BP1-208ENST00000463190 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.33■■■□□ 2.77
ITGB1BP1-208ENST00000463190 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.24■■■□□ 2.75
ITGB1BP1-208ENST00000463190 SCRIBQ14160 1630 aa31.99■■■□□ 2.71
ITGB1BP1-208ENST00000463190 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.97■■■□□ 2.71
ITGB1BP1-208ENST00000463190 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
ITGB1BP1-208ENST00000463190 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.45■■■□□ 2.62
ITGB1BP1-208ENST00000463190 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.34■■■□□ 2.61
ITGB1BP1-208ENST00000463190 NCAPD3P42695 1498 aa30.62■■■□□ 2.49
ITGB1BP1-208ENST00000463190 SMARCA4P51532 1647 aa30.56■■■□□ 2.48
ITGB1BP1-208ENST00000463190 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.55■■■□□ 2.48
ITGB1BP1-208ENST00000463190 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
ITGB1BP1-208ENST00000463190 SMARCA2P51531 1590 aa30.5■■■□□ 2.47
ITGB1BP1-208ENST00000463190 HMGXB3Q12766 1538 aa30.4■■■□□ 2.46
ITGB1BP1-208ENST00000463190 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.29■■■□□ 2.44
ITGB1BP1-208ENST00000463190 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
ITGB1BP1-208ENST00000463190 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.26■■■□□ 2.43
ITGB1BP1-208ENST00000463190 ERCC6Q03468 1493 aa30.07■■■□□ 2.4
ITGB1BP1-208ENST00000463190 NESP48681 1621 aa29.96■■■□□ 2.39
ITGB1BP1-208ENST00000463190 CUX2O14529 1486 aa29.91■■■□□ 2.38
ITGB1BP1-208ENST00000463190 WIZO95785 1651 aa29.88■■■□□ 2.37
ITGB1BP1-208ENST00000463190 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.86■■■□□ 2.37
ITGB1BP1-208ENST00000463190 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
ITGB1BP1-208ENST00000463190 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.72■■■□□ 2.35
ITGB1BP1-208ENST00000463190 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.71■■■□□ 2.35
ITGB1BP1-208ENST00000463190 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
ITGB1BP1-208ENST00000463190 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.55■■■□□ 2.32
ITGB1BP1-208ENST00000463190 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.53■■■□□ 2.32
ITGB1BP1-208ENST00000463190 CFTRP13569 1480 aa29.42■■■□□ 2.3
ITGB1BP1-208ENST00000463190 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.41■■■□□ 2.3
ITGB1BP1-208ENST00000463190 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.36■■■□□ 2.29
ITGB1BP1-208ENST00000463190 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.35■■■□□ 2.29
ITGB1BP1-208ENST00000463190 WDR62O43379 1518 aa29.3■■■□□ 2.28
ITGB1BP1-208ENST00000463190 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.24■■■□□ 2.27
ITGB1BP1-208ENST00000463190 PRDM2Q13029 1718 aa29.08■■■□□ 2.25
ITGB1BP1-208ENST00000463190 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
ITGB1BP1-208ENST00000463190 ABCC8Q09428 1581 aa28.84■■■□□ 2.21
ITGB1BP1-208ENST00000463190 TOPBP1Q92547 1522 aa28.82■■■□□ 2.2
ITGB1BP1-208ENST00000463190 IFT140Q96RY7 1462 aa28.78■■■□□ 2.2
ITGB1BP1-208ENST00000463190 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.74■■■□□ 2.19
ITGB1BP1-208ENST00000463190 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
ITGB1BP1-208ENST00000463190 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.17
ITGB1BP1-208ENST00000463190 OSCARQ8IYS5 282 aa28.63■■■□□ 2.17
ITGB1BP1-208ENST00000463190 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
ITGB1BP1-208ENST00000463190 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
ITGB1BP1-208ENST00000463190 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
ITGB1BP1-208ENST00000463190 SOGA1O94964 1423 aa28.45■■■□□ 2.15
ITGB1BP1-208ENST00000463190 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.44■■■□□ 2.14
ITGB1BP1-208ENST00000463190 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.41■■■□□ 2.14
ITGB1BP1-208ENST00000463190 CUX1P39880 1505 aa28.41■■■□□ 2.14
ITGB1BP1-208ENST00000463190 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.4■■■□□ 2.14
ITGB1BP1-208ENST00000463190 TRIM41Q8WV44 630 aa28.35■■■□□ 2.13
ITGB1BP1-208ENST00000463190 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
ITGB1BP1-208ENST00000463190 WDR97A6NE52 1622 aa28.3■■■□□ 2.12
ITGB1BP1-208ENST00000463190 FBLN2P98095 1184 aa28.24■■■□□ 2.11
ITGB1BP1-208ENST00000463190 CHD1O14646 1710 aa28.18■■■□□ 2.1
ITGB1BP1-208ENST00000463190 GRIN2BQ13224 1484 aa28.17■■■□□ 2.1
ITGB1BP1-208ENST00000463190 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.16■■■□□ 2.1
ITGB1BP1-208ENST00000463190 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
ITGB1BP1-208ENST00000463190 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.13■■■□□ 2.09
ITGB1BP1-208ENST00000463190 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.12■■■□□ 2.09
ITGB1BP1-208ENST00000463190 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.12■■■□□ 2.09
ITGB1BP1-208ENST00000463190 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.12■■■□□ 2.09
ITGB1BP1-208ENST00000463190 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.11■■■□□ 2.09
ITGB1BP1-208ENST00000463190 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.1■■■□□ 2.09
ITGB1BP1-208ENST00000463190 ARHGEF11O15085 1522 aa28.1■■■□□ 2.09
ITGB1BP1-208ENST00000463190 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
ITGB1BP1-208ENST00000463190 TOP2BQ02880 1626 aa28.06■■■□□ 2.08
ITGB1BP1-208ENST00000463190 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.03■■■□□ 2.08
ITGB1BP1-208ENST00000463190 SYNJ2O15056 1496 aa28.03■■■□□ 2.08
ITGB1BP1-208ENST00000463190 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.01■■■□□ 2.07
ITGB1BP1-208ENST00000463190 SYNJ1O43426 1573 aa28■■■□□ 2.07
ITGB1BP1-208ENST00000463190 PBRM1Q86U86 1689 aa28■■■□□ 2.07
ITGB1BP1-208ENST00000463190 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.92■■■□□ 2.06
ITGB1BP1-208ENST00000463190 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.91■■■□□ 2.06
ITGB1BP1-208ENST00000463190 ARAP1Q96P48 1450 aa27.83■■■□□ 2.05
ITGB1BP1-208ENST00000463190 ADAMTS12P58397 1594 aa27.78■■■□□ 2.04
ITGB1BP1-208ENST00000463190 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.78■■■□□ 2.04
ITGB1BP1-208ENST00000463190 GRIN2AQ12879 1464 aa27.78■■■□□ 2.04
ITGB1BP1-208ENST00000463190 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.77■■■□□ 2.04
ITGB1BP1-208ENST00000463190 NUP160Q12769 1436 aa27.68■■■□□ 2.02
ITGB1BP1-208ENST00000463190 CEP170Q5SW79 1584 aa27.63■■■□□ 2.01
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KIF27Q86VH2 1401 aa27.58■■■□□ 2.01
ITGB1BP1-208ENST00000463190 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
ITGB1BP1-208ENST00000463190 IGF1RP08069 1367 aa27.5■■□□□ 1.99
ITGB1BP1-208ENST00000463190 SHROOM2Q13796 1616 aa27.49■■□□□ 1.99
ITGB1BP1-208ENST00000463190 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.46■■□□□ 1.99
ITGB1BP1-208ENST00000463190 JPH4Q96JJ6 628 aa27.44■■□□□ 1.98
ITGB1BP1-208ENST00000463190 CUL7Q14999 1698 aa27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms