RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462743.1

HPS1-206, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene HPS1, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-206ENST00000462743 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.35■■■□□ 2.29
HPS1-206ENST00000462743 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.06■■□□□ 1.76
HPS1-206ENST00000462743 ABCC9O60706 1549 aa25.43■■□□□ 1.66
HPS1-206ENST00000462743 NACADO15069 1562 aa24.54■■□□□ 1.52
HPS1-206ENST00000462743 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.52■■□□□ 1.52
HPS1-206ENST00000462743 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.46■■□□□ 1.51
HPS1-206ENST00000462743 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.46■■□□□ 1.51
HPS1-206ENST00000462743 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
HPS1-206ENST00000462743 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.34■■□□□ 1.49
HPS1-206ENST00000462743 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.94■■□□□ 1.42
HPS1-206ENST00000462743 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.8■■□□□ 1.4
HPS1-206ENST00000462743 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.79■■□□□ 1.4
HPS1-206ENST00000462743 SCRIBQ14160 1630 aa23.68■■□□□ 1.38
HPS1-206ENST00000462743 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.59■■□□□ 1.37
HPS1-206ENST00000462743 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.44■■□□□ 1.34
HPS1-206ENST00000462743 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
HPS1-206ENST00000462743 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.03■■□□□ 1.28
HPS1-206ENST00000462743 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.89■■□□□ 1.25
HPS1-206ENST00000462743 SMARCA4P51532 1647 aa22.73■■□□□ 1.23
HPS1-206ENST00000462743 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
HPS1-206ENST00000462743 NCAPD3P42695 1498 aa22.68■■□□□ 1.22
HPS1-206ENST00000462743 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.65■■□□□ 1.22
HPS1-206ENST00000462743 SMARCA2P51531 1590 aa22.61■■□□□ 1.21
HPS1-206ENST00000462743 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.59■■□□□ 1.21
HPS1-206ENST00000462743 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.57■■□□□ 1.2
HPS1-206ENST00000462743 HMGXB3Q12766 1538 aa22.51■■□□□ 1.19
HPS1-206ENST00000462743 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
HPS1-206ENST00000462743 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HPS1-206ENST00000462743 WIZO95785 1651 aa22.31■■□□□ 1.16
HPS1-206ENST00000462743 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HPS1-206ENST00000462743 NESP48681 1621 aa22.02■■□□□ 1.12
HPS1-206ENST00000462743 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.02■■□□□ 1.12
HPS1-206ENST00000462743 CADPSQ9ULU8 1353 aa22■■□□□ 1.11
HPS1-206ENST00000462743 ERCC6Q03468 1493 aa21.9■■□□□ 1.1
HPS1-206ENST00000462743 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.89■■□□□ 1.1
HPS1-206ENST00000462743 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.87■■□□□ 1.09
HPS1-206ENST00000462743 CFTRP13569 1480 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS1-206ENST00000462743 CUX2O14529 1486 aa21.76■■□□□ 1.07
HPS1-206ENST00000462743 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
HPS1-206ENST00000462743 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.74■■□□□ 1.07
HPS1-206ENST00000462743 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.69■■□□□ 1.06
HPS1-206ENST00000462743 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
HPS1-206ENST00000462743 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.64■■□□□ 1.05
HPS1-206ENST00000462743 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.63■■□□□ 1.05
HPS1-206ENST00000462743 PRDM2Q13029 1718 aa21.63■■□□□ 1.05
HPS1-206ENST00000462743 WDR62O43379 1518 aa21.55■■□□□ 1.04
HPS1-206ENST00000462743 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HPS1-206ENST00000462743 ABCC8Q09428 1581 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS1-206ENST00000462743 TOPBP1Q92547 1522 aa21.35■■□□□ 1.01
HPS1-206ENST00000462743 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.31■■□□□ 1
HPS1-206ENST00000462743 IFT140Q96RY7 1462 aa21.23■□□□□ 0.99
HPS1-206ENST00000462743 CUX1P39880 1505 aa21.18■□□□□ 0.98
HPS1-206ENST00000462743 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
HPS1-206ENST00000462743 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.14■□□□□ 0.97
HPS1-206ENST00000462743 SOGA1O94964 1423 aa21.12■□□□□ 0.97
HPS1-206ENST00000462743 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
HPS1-206ENST00000462743 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.1■□□□□ 0.97
HPS1-206ENST00000462743 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
HPS1-206ENST00000462743 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.06■□□□□ 0.96
HPS1-206ENST00000462743 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.06■□□□□ 0.96
HPS1-206ENST00000462743 TOP2BQ02880 1626 aa21.01■□□□□ 0.95
HPS1-206ENST00000462743 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21■□□□□ 0.95
HPS1-206ENST00000462743 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21■□□□□ 0.95
HPS1-206ENST00000462743 WDR97A6NE52 1622 aa20.99■□□□□ 0.95
HPS1-206ENST00000462743 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
HPS1-206ENST00000462743 SYNJ1O43426 1573 aa20.96■□□□□ 0.95
HPS1-206ENST00000462743 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
HPS1-206ENST00000462743 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.94■□□□□ 0.94
HPS1-206ENST00000462743 OSCARQ8IYS5 282 aa20.91■□□□□ 0.94
HPS1-206ENST00000462743 GRIN2BQ13224 1484 aa20.85■□□□□ 0.93
HPS1-206ENST00000462743 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.85■□□□□ 0.93
HPS1-206ENST00000462743 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.81■□□□□ 0.92
HPS1-206ENST00000462743 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HPS1-206ENST00000462743 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.76■□□□□ 0.91
HPS1-206ENST00000462743 PBRM1Q86U86 1689 aa20.73■□□□□ 0.91
HPS1-206ENST00000462743 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
HPS1-206ENST00000462743 CHD1O14646 1710 aa20.71■□□□□ 0.91
HPS1-206ENST00000462743 FBLN2P98095 1184 aa20.71■□□□□ 0.91
HPS1-206ENST00000462743 SYNJ2O15056 1496 aa20.7■□□□□ 0.9
HPS1-206ENST00000462743 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.68■□□□□ 0.9
HPS1-206ENST00000462743 KIF27Q86VH2 1401 aa20.64■□□□□ 0.89
HPS1-206ENST00000462743 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS1-206ENST00000462743 IGF1RP08069 1367 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS1-206ENST00000462743 TRIM41Q8WV44 630 aa20.59■□□□□ 0.89
HPS1-206ENST00000462743 ADAMTS12P58397 1594 aa20.59■□□□□ 0.89
HPS1-206ENST00000462743 GRIN2AQ12879 1464 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS1-206ENST00000462743 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.53■□□□□ 0.88
HPS1-206ENST00000462743 NUP160Q12769 1436 aa20.51■□□□□ 0.87
HPS1-206ENST00000462743 ARHGEF11O15085 1522 aa20.48■□□□□ 0.87
HPS1-206ENST00000462743 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS1-206ENST00000462743 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.45■□□□□ 0.87
HPS1-206ENST00000462743 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.45■□□□□ 0.87
HPS1-206ENST00000462743 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.45■□□□□ 0.87
HPS1-206ENST00000462743 CUL7Q14999 1698 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS1-206ENST00000462743 CEP170Q5SW79 1584 aa20.43■□□□□ 0.86
HPS1-206ENST00000462743 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.43■□□□□ 0.86
HPS1-206ENST00000462743 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS1-206ENST00000462743 JPH4Q96JJ6 628 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS1-206ENST00000462743 SHROOM2Q13796 1616 aa20.33■□□□□ 0.84
HPS1-206ENST00000462743 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.32■□□□□ 0.84
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