RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462601.5

PRKRIP1-202, Transcript of PRKR interacting protein 1, humanhuman

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Gene PRKRIP1, Length 884 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1-202ENST00000462601 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.73■■■□□ 2.51
PRKRIP1-202ENST00000462601 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.27■■□□□ 1.96
PRKRIP1-202ENST00000462601 ABCC9O60706 1549 aa26.19■■□□□ 1.78
PRKRIP1-202ENST00000462601 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
PRKRIP1-202ENST00000462601 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.54■■□□□ 1.68
PRKRIP1-202ENST00000462601 NACADO15069 1562 aa25.54■■□□□ 1.68
PRKRIP1-202ENST00000462601 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.53■■□□□ 1.68
PRKRIP1-202ENST00000462601 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.48■■□□□ 1.67
PRKRIP1-202ENST00000462601 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1-202ENST00000462601 SCRIBQ14160 1630 aa24.79■■□□□ 1.56
PRKRIP1-202ENST00000462601 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.77■■□□□ 1.56
PRKRIP1-202ENST00000462601 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.58■■□□□ 1.53
PRKRIP1-202ENST00000462601 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.56■■□□□ 1.52
PRKRIP1-202ENST00000462601 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.512e-7■■■□□ 15.9
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PRKRIP1-202ENST00000462601 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
PRKRIP1-202ENST00000462601 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.8■■□□□ 1.4
PRKRIP1-202ENST00000462601 SMARCA4P51532 1647 aa23.79■■□□□ 1.4
PRKRIP1-202ENST00000462601 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.74■■□□□ 1.39
PRKRIP1-202ENST00000462601 SMARCA2P51531 1590 aa23.63■■□□□ 1.37
PRKRIP1-202ENST00000462601 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.62■■□□□ 1.37
PRKRIP1-202ENST00000462601 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.59■■□□□ 1.37
PRKRIP1-202ENST00000462601 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.56■■□□□ 1.36
PRKRIP1-202ENST00000462601 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.55■■□□□ 1.36
PRKRIP1-202ENST00000462601 NCAPD3P42695 1498 aa23.51■■□□□ 1.35
PRKRIP1-202ENST00000462601 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PRKRIP1-202ENST00000462601 HMGXB3Q12766 1538 aa23.49■■□□□ 1.35
PRKRIP1-202ENST00000462601 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PRKRIP1-202ENST00000462601 WIZO95785 1651 aa23.38■■□□□ 1.33
PRKRIP1-202ENST00000462601 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PRKRIP1-202ENST00000462601 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
PRKRIP1-202ENST00000462601 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.91■■□□□ 1.26
PRKRIP1-202ENST00000462601 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.89■■□□□ 1.25
PRKRIP1-202ENST00000462601 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.83■■□□□ 1.25
PRKRIP1-202ENST00000462601 CFTRP13569 1480 aa22.78■■□□□ 1.24
PRKRIP1-202ENST00000462601 NESP48681 1621 aa22.72■■□□□ 1.23
PRKRIP1-202ENST00000462601 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.72■■□□□ 1.23
PRKRIP1-202ENST00000462601 PRDM2Q13029 1718 aa22.68■■□□□ 1.22
PRKRIP1-202ENST00000462601 ERCC6Q03468 1493 aa22.65■■□□□ 1.22
PRKRIP1-202ENST00000462601 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.57■■□□□ 1.2
PRKRIP1-202ENST00000462601 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.55■■□□□ 1.2
PRKRIP1-202ENST00000462601 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.53■■□□□ 1.2
PRKRIP1-202ENST00000462601 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.44■■□□□ 1.18
PRKRIP1-202ENST00000462601 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PRKRIP1-202ENST00000462601 ABCC8Q09428 1581 aa22.37■■□□□ 1.17
PRKRIP1-202ENST00000462601 WDR62O43379 1518 aa22.36■■□□□ 1.17
PRKRIP1-202ENST00000462601 CUX2O14529 1486 aa22.31■■□□□ 1.16
PRKRIP1-202ENST00000462601 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.29■■□□□ 1.16
PRKRIP1-202ENST00000462601 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PRKRIP1-202ENST00000462601 TOPBP1Q92547 1522 aa22.24■■□□□ 1.15
PRKRIP1-202ENST00000462601 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
PRKRIP1-202ENST00000462601 CUX1P39880 1505 aa22.16■■□□□ 1.14
PRKRIP1-202ENST00000462601 TOP2BQ02880 1626 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKRIP1-202ENST00000462601 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKRIP1-202ENST00000462601 SYNJ1O43426 1573 aa22.08■■□□□ 1.13
PRKRIP1-202ENST00000462601 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PRKRIP1-202ENST00000462601 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.07■■□□□ 1.12
PRKRIP1-202ENST00000462601 IFT140Q96RY7 1462 aa22.07■■□□□ 1.12
PRKRIP1-202ENST00000462601 SOGA1O94964 1423 aa21.98■■□□□ 1.11
PRKRIP1-202ENST00000462601 WDR97A6NE52 1622 aa21.97■■□□□ 1.11
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PRKRIP1-202ENST00000462601 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.91■■□□□ 1.1
PRKRIP1-202ENST00000462601 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.9■■□□□ 1.1
PRKRIP1-202ENST00000462601 TRIM41Q8WV44 630 aa21.9■■□□□ 1.1
PRKRIP1-202ENST00000462601 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PRKRIP1-202ENST00000462601 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
PRKRIP1-202ENST00000462601 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.79■■□□□ 1.08
PRKRIP1-202ENST00000462601 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.77■■□□□ 1.08
PRKRIP1-202ENST00000462601 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PRKRIP1-202ENST00000462601 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.76■■□□□ 1.07
PRKRIP1-202ENST00000462601 KIF27Q86VH2 1401 aa21.75■■□□□ 1.07
PRKRIP1-202ENST00000462601 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.071e-9■■■■■ 28.1
PRKRIP1-202ENST00000462601 GRIN2BQ13224 1484 aa21.74■■□□□ 1.07
PRKRIP1-202ENST00000462601 PBRM1Q86U86 1689 aa21.69■■□□□ 1.06
PRKRIP1-202ENST00000462601 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.69■■□□□ 1.06
PRKRIP1-202ENST00000462601 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PRKRIP1-202ENST00000462601 EEA1Q15075 1411 aa21.63■■□□□ 1.05
PRKRIP1-202ENST00000462601 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.61■■□□□ 1.05
PRKRIP1-202ENST00000462601 CUL7Q14999 1698 aa21.58■■□□□ 1.05
PRKRIP1-202ENST00000462601 ADAMTS12P58397 1594 aa21.57■■□□□ 1.04
PRKRIP1-202ENST00000462601 SYNJ2O15056 1496 aa21.56■■□□□ 1.04
PRKRIP1-202ENST00000462601 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.55■■□□□ 1.04
PRKRIP1-202ENST00000462601 IGF1RP08069 1367 aa21.52■■□□□ 1.04
PRKRIP1-202ENST00000462601 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PRKRIP1-202ENST00000462601 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.47■■□□□ 1.03
PRKRIP1-202ENST00000462601 CHD1O14646 1710 aa21.46■■□□□ 1.03
PRKRIP1-202ENST00000462601 FBLN2P98095 1184 aa21.44■■□□□ 1.02
PRKRIP1-202ENST00000462601 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.44■■□□□ 1.02
PRKRIP1-202ENST00000462601 GRIN2AQ12879 1464 aa21.44■■□□□ 1.02
PRKRIP1-202ENST00000462601 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKRIP1-202ENST00000462601 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.39■■□□□ 1.02
PRKRIP1-202ENST00000462601 PRXQ9BXM0 1461 aa21.38■■□□□ 1.01
PRKRIP1-202ENST00000462601 OSCARQ8IYS5 282 aa21.37■■□□□ 1.01
PRKRIP1-202ENST00000462601 KIF21BO75037 1637 aa21.33■■□□□ 1
PRKRIP1-202ENST00000462601 NUP160Q12769 1436 aa21.32■■□□□ 1
PRKRIP1-202ENST00000462601 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
PRKRIP1-202ENST00000462601 CEP170Q5SW79 1584 aa21.27■■□□□ 1
PRKRIP1-202ENST00000462601 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.26■□□□□ 0.99
PRKRIP1-202ENST00000462601 GOLGA3Q08378 1498 aa21.23■□□□□ 0.99
PRKRIP1-202ENST00000462601 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.22■□□□□ 0.99
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