RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462576.5

RPS7-205, Transcript of ribosomal protein S7, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RPS7, Length 907 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS7-205ENST00000462576 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.06■■■■■ 8.17
RPS7-205ENST00000462576 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.33■■■■■ 7.09
RPS7-205ENST00000462576 ABCC9O60706 1549 aa59.33■■■■■ 7.09
RPS7-205ENST00000462576 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.49■■■■■ 6.63
RPS7-205ENST00000462576 NACADO15069 1562 aa56.09■■■■■ 6.57
RPS7-205ENST00000462576 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.72■■■■■ 6.51
RPS7-205ENST00000462576 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.65■■■■■ 6.5
RPS7-205ENST00000462576 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.32■■■■■ 6.45
RPS7-205ENST00000462576 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.21■■■■■ 6.43
RPS7-205ENST00000462576 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.2■■■■■ 6.43
RPS7-205ENST00000462576 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.83■■■■■ 6.37
RPS7-205ENST00000462576 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.75■■■■■ 6.36
RPS7-205ENST00000462576 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.59■■■■■ 6.33
RPS7-205ENST00000462576 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.14■■■■■ 6.26
RPS7-205ENST00000462576 SCRIBQ14160 1630 aa54.02■■■■■ 6.24
RPS7-205ENST00000462576 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.61■■■■■ 6.17
RPS7-205ENST00000462576 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.49■■■■■ 6.15
RPS7-205ENST00000462576 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.46■■■■■ 6.15
RPS7-205ENST00000462576 NCAPD3P42695 1498 aa51.78■■■■■ 5.88
RPS7-205ENST00000462576 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.61■■■■■ 5.85
RPS7-205ENST00000462576 SMARCA4P51532 1647 aa51.55■■■■■ 5.84
RPS7-205ENST00000462576 SMARCA2P51531 1590 aa51.49■■■■■ 5.83
RPS7-205ENST00000462576 HMGXB3Q12766 1538 aa51.41■■■■■ 5.82
RPS7-205ENST00000462576 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.29■■■■■ 5.8
RPS7-205ENST00000462576 ERCC6Q03468 1493 aa51.25■■■■■ 5.79
RPS7-205ENST00000462576 CUX2O14529 1486 aa51.2■■■■■ 5.79
RPS7-205ENST00000462576 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.17■■■■■ 5.78
RPS7-205ENST00000462576 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.11■■■■■ 5.77
RPS7-205ENST00000462576 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.06■■■■■ 5.76
RPS7-205ENST00000462576 NESP48681 1621 aa50.95■■■■■ 5.75
RPS7-205ENST00000462576 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.89■■■■■ 5.74
RPS7-205ENST00000462576 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.63■■■■■ 5.7
RPS7-205ENST00000462576 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.47■■■■■ 5.67
RPS7-205ENST00000462576 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.33■■■■■ 5.65
RPS7-205ENST00000462576 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.31■■■■■ 5.65
RPS7-205ENST00000462576 WIZO95785 1651 aa50.27■■■■■ 5.64
RPS7-205ENST00000462576 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.19■■■■■ 5.63
RPS7-205ENST00000462576 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.9■■■■■ 5.58
RPS7-205ENST00000462576 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.82■■■■■ 5.57
RPS7-205ENST00000462576 WDR62O43379 1518 aa49.79■■■■■ 5.56
RPS7-205ENST00000462576 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.69■■■■■ 5.55
RPS7-205ENST00000462576 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.66■■■■■ 5.54
RPS7-205ENST00000462576 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.63■■■■■ 5.53
RPS7-205ENST00000462576 CFTRP13569 1480 aa49.62■■■■■ 5.53
RPS7-205ENST00000462576 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.21■■■■■ 5.47
RPS7-205ENST00000462576 PRDM2Q13029 1718 aa49.14■■■■■ 5.46
RPS7-205ENST00000462576 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.07■■■■■ 5.45
RPS7-205ENST00000462576 TRIM41Q8WV44 630 aa48.9■■■■■ 5.42
RPS7-205ENST00000462576 OSCARQ8IYS5 282 aa48.81■■■■■ 5.4
RPS7-205ENST00000462576 IFT140Q96RY7 1462 aa48.71■■■■■ 5.39
RPS7-205ENST00000462576 TOPBP1Q92547 1522 aa48.68■■■■■ 5.38
RPS7-205ENST00000462576 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.6■■■■■ 5.37
RPS7-205ENST00000462576 ABCC8Q09428 1581 aa48.6■■■■■ 5.37
RPS7-205ENST00000462576 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.51■■■■■ 5.36
RPS7-205ENST00000462576 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.35■■■■■ 5.33
RPS7-205ENST00000462576 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.25■■■■■ 5.32
RPS7-205ENST00000462576 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.2■■■■■ 5.31
RPS7-205ENST00000462576 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.2■■■■■ 5.31
RPS7-205ENST00000462576 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.2■■■■■ 5.31
RPS7-205ENST00000462576 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.18■■■■■ 5.3
RPS7-205ENST00000462576 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.15■■■■■ 5.33e-8■■■■■ 30.2
RPS7-205ENST00000462576 ARHGEF11O15085 1522 aa48.05■■■■■ 5.28
RPS7-205ENST00000462576 CHD1O14646 1710 aa48.01■■■■■ 5.28
RPS7-205ENST00000462576 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.98■■■■■ 5.27
RPS7-205ENST00000462576 SOGA1O94964 1423 aa47.95■■■■■ 5.27
RPS7-205ENST00000462576 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.87■■■■■ 5.25
RPS7-205ENST00000462576 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.85■■■■■ 5.25
RPS7-205ENST00000462576 FBLN2P98095 1184 aa47.84■■■■■ 5.25
RPS7-205ENST00000462576 CUX1P39880 1505 aa47.82■■■■■ 5.25
RPS7-205ENST00000462576 WDR97A6NE52 1622 aa47.8■■■■■ 5.24
RPS7-205ENST00000462576 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.68■■■■■ 5.22
RPS7-205ENST00000462576 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.66■■■■■ 5.22
RPS7-205ENST00000462576 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.61■■■■■ 5.21
RPS7-205ENST00000462576 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.58■■■■■ 5.21
RPS7-205ENST00000462576 ARAP1Q96P48 1450 aa47.57■■■■■ 5.21
RPS7-205ENST00000462576 GRIN2BQ13224 1484 aa47.56■■■■■ 5.2
RPS7-205ENST00000462576 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.49■■■■■ 5.19
RPS7-205ENST00000462576 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.46■■■■■ 5.19
RPS7-205ENST00000462576 SYNJ1O43426 1573 aa47.44■■■■■ 5.18
RPS7-205ENST00000462576 SYNJ2O15056 1496 aa47.41■■■■■ 5.18
RPS7-205ENST00000462576 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.39■■■■■ 5.18
RPS7-205ENST00000462576 PBRM1Q86U86 1689 aa47.38■■■■■ 5.17
RPS7-205ENST00000462576 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.34■■■■■ 5.17
RPS7-205ENST00000462576 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.28■■■■■ 5.16
RPS7-205ENST00000462576 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.14■■■■■ 5.14
RPS7-205ENST00000462576 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.13■■■■■ 5.148e-7■■□□□ 13.9
RPS7-205ENST00000462576 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.07■■■■■ 5.13
RPS7-205ENST00000462576 TOP2BQ02880 1626 aa47.05■■■■■ 5.12
RPS7-205ENST00000462576 GRIN2AQ12879 1464 aa46.95■■■■■ 5.11
RPS7-205ENST00000462576 ADAMTS12P58397 1594 aa46.93■■■■■ 5.1
RPS7-205ENST00000462576 NUP160Q12769 1436 aa46.8■■■■■ 5.08
RPS7-205ENST00000462576 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.79■■■■■ 5.08
RPS7-205ENST00000462576 CEP170Q5SW79 1584 aa46.77■■■■■ 5.08
RPS7-205ENST00000462576 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.74■■■■■ 5.07
RPS7-205ENST00000462576 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.69■■■■■ 5.06
RPS7-205ENST00000462576 SHROOM2Q13796 1616 aa46.6■■■■■ 5.05
RPS7-205ENST00000462576 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.33■■■■■ 5.01
RPS7-205ENST00000462576 JPH4Q96JJ6 628 aa46.29■■■■■ 5
RPS7-205ENST00000462576 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.26■■■■■ 5
RPS7-205ENST00000462576 KIF27Q86VH2 1401 aa46.15■■■■■ 4.98
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