RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461426.1

SIGMAR1-204, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SIGMAR1, Length 939 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-204ENST00000461426 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.31■■■■■ 7.89
SIGMAR1-204ENST00000461426 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.07■■■■■ 6.73
SIGMAR1-204ENST00000461426 ABCC9O60706 1549 aa55.88■■■■■ 6.54
SIGMAR1-204ENST00000461426 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.86■■■■■ 6.21
SIGMAR1-204ENST00000461426 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.77■■■■■ 6.2
SIGMAR1-204ENST00000461426 NACADO15069 1562 aa53.75■■■■■ 6.2
SIGMAR1-204ENST00000461426 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.54■■■■■ 6.16
SIGMAR1-204ENST00000461426 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.47■■■■■ 6.15
SIGMAR1-204ENST00000461426 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.23■■■■■ 6.11
SIGMAR1-204ENST00000461426 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.37■■■■■ 5.97
SIGMAR1-204ENST00000461426 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.31■■■■■ 5.967e-7■■■■□ 25.6
SIGMAR1-204ENST00000461426 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.09■■■■■ 5.93
SIGMAR1-204ENST00000461426 SCRIBQ14160 1630 aa52.06■■■■■ 5.92
SIGMAR1-204ENST00000461426 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.63■■■■■ 5.86
SIGMAR1-204ENST00000461426 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.34■■■■■ 5.81
SIGMAR1-204ENST00000461426 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.74■■■■■ 5.71
SIGMAR1-204ENST00000461426 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.51■■■■■ 5.68
SIGMAR1-204ENST00000461426 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.24■■■■■ 5.63
SIGMAR1-204ENST00000461426 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.83■■■■■ 5.57
SIGMAR1-204ENST00000461426 SMARCA4P51532 1647 aa49.83■■■■■ 5.57
SIGMAR1-204ENST00000461426 NCAPD3P42695 1498 aa49.65■■■■■ 5.54
SIGMAR1-204ENST00000461426 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.64■■■■■ 5.54
SIGMAR1-204ENST00000461426 SMARCA2P51531 1590 aa49.57■■■■■ 5.53
SIGMAR1-204ENST00000461426 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.53■■■■■ 5.52
SIGMAR1-204ENST00000461426 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.37■■■■■ 5.49
SIGMAR1-204ENST00000461426 HMGXB3Q12766 1538 aa49.31■■■■■ 5.48
SIGMAR1-204ENST00000461426 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.21■■■■■ 5.47
SIGMAR1-204ENST00000461426 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.05■■■■■ 5.44
SIGMAR1-204ENST00000461426 WIZO95785 1651 aa48.94■■■■■ 5.43
SIGMAR1-204ENST00000461426 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.48■■■■■ 5.35
SIGMAR1-204ENST00000461426 NESP48681 1621 aa48.34■■■■■ 5.33
SIGMAR1-204ENST00000461426 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.25■■■■■ 5.31
SIGMAR1-204ENST00000461426 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.23■■■■■ 5.31
SIGMAR1-204ENST00000461426 ERCC6Q03468 1493 aa48.2■■■■■ 5.31
SIGMAR1-204ENST00000461426 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.03■■■■■ 5.28
SIGMAR1-204ENST00000461426 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.97■■■■■ 5.27
SIGMAR1-204ENST00000461426 CFTRP13569 1480 aa47.9■■■■■ 5.26
SIGMAR1-204ENST00000461426 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.88■■■■■ 5.26
SIGMAR1-204ENST00000461426 CUX2O14529 1486 aa47.68■■■■■ 5.22
SIGMAR1-204ENST00000461426 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.67■■■■■ 5.22
SIGMAR1-204ENST00000461426 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.6■■■■■ 5.21
SIGMAR1-204ENST00000461426 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.54■■■■■ 5.2
SIGMAR1-204ENST00000461426 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.53■■■■■ 5.2
SIGMAR1-204ENST00000461426 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.46■■■■■ 5.19
SIGMAR1-204ENST00000461426 PRDM2Q13029 1718 aa47.33■■■■■ 5.17
SIGMAR1-204ENST00000461426 WDR62O43379 1518 aa47.26■■■■■ 5.16
SIGMAR1-204ENST00000461426 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.09■■■■■ 5.13
SIGMAR1-204ENST00000461426 ABCC8Q09428 1581 aa46.91■■■■■ 5.1
SIGMAR1-204ENST00000461426 TOPBP1Q92547 1522 aa46.83■■■■■ 5.09
SIGMAR1-204ENST00000461426 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.75■■■■■ 5.07
SIGMAR1-204ENST00000461426 IFT140Q96RY7 1462 aa46.57■■■■■ 5.04
SIGMAR1-204ENST00000461426 CUX1P39880 1505 aa46.47■■■■■ 5.03
SIGMAR1-204ENST00000461426 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.43■■■■■ 5.02
SIGMAR1-204ENST00000461426 SOGA1O94964 1423 aa46.32■■■■■ 5.01
SIGMAR1-204ENST00000461426 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.31■■■■■ 5
SIGMAR1-204ENST00000461426 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.3■■■■■ 5
SIGMAR1-204ENST00000461426 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.29■■■■■ 5
SIGMAR1-204ENST00000461426 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.26■■■■■ 5
SIGMAR1-204ENST00000461426 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.24■■■■■ 4.99
SIGMAR1-204ENST00000461426 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.24■■■■■ 4.99
SIGMAR1-204ENST00000461426 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.09■■■■■ 4.972e-8■■■■■ 30.3
SIGMAR1-204ENST00000461426 TOP2BQ02880 1626 aa46.06■■■■■ 4.96
SIGMAR1-204ENST00000461426 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.04■■■■■ 4.96
SIGMAR1-204ENST00000461426 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.04■■■■■ 4.96
SIGMAR1-204ENST00000461426 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.02■■■■■ 4.96
SIGMAR1-204ENST00000461426 SYNJ1O43426 1573 aa46.01■■■■■ 4.96
SIGMAR1-204ENST00000461426 WDR97A6NE52 1622 aa45.94■■■■■ 4.94
SIGMAR1-204ENST00000461426 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.9■■■■■ 4.94
SIGMAR1-204ENST00000461426 OSCARQ8IYS5 282 aa45.85■■■■■ 4.93
SIGMAR1-204ENST00000461426 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.75■■■■■ 4.91
SIGMAR1-204ENST00000461426 GRIN2BQ13224 1484 aa45.74■■■■■ 4.91
SIGMAR1-204ENST00000461426 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.62■■■■■ 4.89
SIGMAR1-204ENST00000461426 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.61■■■■■ 4.89
SIGMAR1-204ENST00000461426 FBLN2P98095 1184 aa45.61■■■■■ 4.89
SIGMAR1-204ENST00000461426 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.61■■■■■ 4.89
SIGMAR1-204ENST00000461426 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.52■■■■■ 4.88
SIGMAR1-204ENST00000461426 PBRM1Q86U86 1689 aa45.47■■■■■ 4.87
SIGMAR1-204ENST00000461426 SYNJ2O15056 1496 aa45.42■■■■■ 4.86
SIGMAR1-204ENST00000461426 CHD1O14646 1710 aa45.41■■■■■ 4.86
SIGMAR1-204ENST00000461426 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.34■■■■■ 4.85
SIGMAR1-204ENST00000461426 KIF27Q86VH2 1401 aa45.32■■■■■ 4.85
SIGMAR1-204ENST00000461426 TRIM41Q8WV44 630 aa45.28■■■■■ 4.84
SIGMAR1-204ENST00000461426 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.24■■■■■ 4.83
SIGMAR1-204ENST00000461426 ADAMTS12P58397 1594 aa45.19■■■■■ 4.82
SIGMAR1-204ENST00000461426 IGF1RP08069 1367 aa45.15■■■■■ 4.82
SIGMAR1-204ENST00000461426 GRIN2AQ12879 1464 aa45.11■■■■■ 4.81
SIGMAR1-204ENST00000461426 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.01■■■■■ 4.8
SIGMAR1-204ENST00000461426 NUP160Q12769 1436 aa44.94■■■■■ 4.79
SIGMAR1-204ENST00000461426 ARHGEF11O15085 1522 aa44.93■■■■■ 4.78
SIGMAR1-204ENST00000461426 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.88■■■■■ 4.78
SIGMAR1-204ENST00000461426 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.88■■■■■ 4.78
SIGMAR1-204ENST00000461426 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.88■■■■■ 4.78
SIGMAR1-204ENST00000461426 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.88■■■■■ 4.78
SIGMAR1-204ENST00000461426 CUL7Q14999 1698 aa44.87■■■■■ 4.77
SIGMAR1-204ENST00000461426 CEP170Q5SW79 1584 aa44.82■■■■■ 4.77
SIGMAR1-204ENST00000461426 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.82■■■■■ 4.77
SIGMAR1-204ENST00000461426 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.72■■■■■ 4.75
SIGMAR1-204ENST00000461426 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.65■■■■■ 4.74
SIGMAR1-204ENST00000461426 JPH4Q96JJ6 628 aa44.6■■■■■ 4.73
SIGMAR1-204ENST00000461426 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.57■■■■■ 4.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms