RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461404.1

PEMT-207, Transcript of phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

TSL 5

Gene PEMT, Length 591 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMT-207ENST00000461404 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.74■■■■■ 6.83
PEMT-207ENST00000461404 ABCC9O60706 1549 aa51.85■■■■■ 5.89
PEMT-207ENST00000461404 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.71■■■■■ 5.87
PEMT-207ENST00000461404 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.25■■■■■ 5.47
PEMT-207ENST00000461404 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.92■■■■■ 5.42
PEMT-207ENST00000461404 NACADO15069 1562 aa48.9■■■■■ 5.42
PEMT-207ENST00000461404 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.64■■■■■ 5.38
PEMT-207ENST00000461404 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.35■■■■■ 5.33
PEMT-207ENST00000461404 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.19■■■■■ 5.31
PEMT-207ENST00000461404 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.17■■■■■ 5.3
PEMT-207ENST00000461404 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.86■■■■■ 5.25
PEMT-207ENST00000461404 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.84■■■■■ 5.25
PEMT-207ENST00000461404 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.59■■■■■ 5.21
PEMT-207ENST00000461404 SCRIBQ14160 1630 aa47.28■■■■■ 5.16
PEMT-207ENST00000461404 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.05■■■■■ 5.12
PEMT-207ENST00000461404 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.79■■■■■ 5.08
PEMT-207ENST00000461404 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.67■■■■■ 5.06
PEMT-207ENST00000461404 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.65■■■■■ 5.06
PEMT-207ENST00000461404 NCAPD3P42695 1498 aa45.17■■■■■ 4.82
PEMT-207ENST00000461404 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.07■■■■■ 4.81
PEMT-207ENST00000461404 SMARCA4P51532 1647 aa45.04■■■■■ 4.8
PEMT-207ENST00000461404 SMARCA2P51531 1590 aa44.9■■■■■ 4.78
PEMT-207ENST00000461404 HMGXB3Q12766 1538 aa44.8■■■■■ 4.76
PEMT-207ENST00000461404 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.79■■■■■ 4.76
PEMT-207ENST00000461404 ERCC6Q03468 1493 aa44.72■■■■■ 4.75
PEMT-207ENST00000461404 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.66■■■■■ 4.74
PEMT-207ENST00000461404 NESP48681 1621 aa44.57■■■■■ 4.72
PEMT-207ENST00000461404 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.56■■■■■ 4.72
PEMT-207ENST00000461404 CUX2O14529 1486 aa44.53■■■■■ 4.72
PEMT-207ENST00000461404 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.53■■■■■ 4.72
PEMT-207ENST00000461404 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.52■■■■■ 4.72
PEMT-207ENST00000461404 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.13■■■■■ 4.65
PEMT-207ENST00000461404 WIZO95785 1651 aa44.04■■■■■ 4.64
PEMT-207ENST00000461404 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
PEMT-207ENST00000461404 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.95■■■■■ 4.63
PEMT-207ENST00000461404 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.9■■■■■ 4.62
PEMT-207ENST00000461404 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.83■■■■■ 4.61
PEMT-207ENST00000461404 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.63■■■■■ 4.57
PEMT-207ENST00000461404 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.54■■■■■ 4.56
PEMT-207ENST00000461404 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
PEMT-207ENST00000461404 WDR62O43379 1518 aa43.4■■■■■ 4.54
PEMT-207ENST00000461404 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.38■■■■■ 4.54
PEMT-207ENST00000461404 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.35■■■■■ 4.53
PEMT-207ENST00000461404 CFTRP13569 1480 aa43.32■■■■■ 4.52
PEMT-207ENST00000461404 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
PEMT-207ENST00000461404 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.97■■■■■ 4.47
PEMT-207ENST00000461404 PRDM2Q13029 1718 aa42.85■■■■■ 4.45
PEMT-207ENST00000461404 TRIM41Q8WV44 630 aa42.74■■■■■ 4.43
PEMT-207ENST00000461404 OSCARQ8IYS5 282 aa42.59■■■■■ 4.41
PEMT-207ENST00000461404 TOPBP1Q92547 1522 aa42.54■■■■■ 4.4
PEMT-207ENST00000461404 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.39
PEMT-207ENST00000461404 IFT140Q96RY7 1462 aa42.49■■■■■ 4.39
PEMT-207ENST00000461404 ABCC8Q09428 1581 aa42.36■■■■■ 4.37
PEMT-207ENST00000461404 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.35■■■■■ 4.37
PEMT-207ENST00000461404 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
PEMT-207ENST00000461404 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
PEMT-207ENST00000461404 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.14■■■■■ 4.34
PEMT-207ENST00000461404 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
PEMT-207ENST00000461404 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.04■■■■■ 4.32
PEMT-207ENST00000461404 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.04■■■■■ 4.32
PEMT-207ENST00000461404 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.04■■■■■ 4.32
PEMT-207ENST00000461404 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.03■■■■■ 4.32
PEMT-207ENST00000461404 SOGA1O94964 1423 aa41.94■■■■■ 4.3
PEMT-207ENST00000461404 CHD1O14646 1710 aa41.92■■■■■ 4.3
PEMT-207ENST00000461404 FBLN2P98095 1184 aa41.91■■■■■ 4.3
PEMT-207ENST00000461404 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
PEMT-207ENST00000461404 ARHGEF11O15085 1522 aa41.9■■■■■ 4.3
PEMT-207ENST00000461404 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
PEMT-207ENST00000461404 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.87■■■■■ 4.29
PEMT-207ENST00000461404 CUX1P39880 1505 aa41.85■■■■■ 4.29
PEMT-207ENST00000461404 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.68■■■■■ 4.26
PEMT-207ENST00000461404 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.67■■■■■ 4.26
PEMT-207ENST00000461404 WDR97A6NE52 1622 aa41.59■■■■■ 4.25
PEMT-207ENST00000461404 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
PEMT-207ENST00000461404 GRIN2BQ13224 1484 aa41.53■■■■■ 4.24
PEMT-207ENST00000461404 ARAP1Q96P48 1450 aa41.5■■■■■ 4.23
PEMT-207ENST00000461404 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
PEMT-207ENST00000461404 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.41■■■■■ 4.22
PEMT-207ENST00000461404 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.39■■■■■ 4.22
PEMT-207ENST00000461404 PBRM1Q86U86 1689 aa41.39■■■■■ 4.22
PEMT-207ENST00000461404 SYNJ2O15056 1496 aa41.38■■■■■ 4.21
PEMT-207ENST00000461404 SYNJ1O43426 1573 aa41.37■■■■■ 4.21
PEMT-207ENST00000461404 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.34■■■■■ 4.21
PEMT-207ENST00000461404 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.29■■■■■ 4.2
PEMT-207ENST00000461404 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
PEMT-207ENST00000461404 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.2■■■■■ 4.19
PEMT-207ENST00000461404 TOP2BQ02880 1626 aa41.14■■■■■ 4.18
PEMT-207ENST00000461404 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.13■■■■■ 4.17
PEMT-207ENST00000461404 GRIN2AQ12879 1464 aa41.01■■■■■ 4.16
PEMT-207ENST00000461404 ADAMTS12P58397 1594 aa40.99■■■■■ 4.15
PEMT-207ENST00000461404 CEP170Q5SW79 1584 aa40.88■■■■■ 4.13
PEMT-207ENST00000461404 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.86■■■■■ 4.13
PEMT-207ENST00000461404 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.86■■■■■ 4.13
PEMT-207ENST00000461404 NUP160Q12769 1436 aa40.84■■■■■ 4.13
PEMT-207ENST00000461404 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.8■■■■■ 4.12
PEMT-207ENST00000461404 SHROOM2Q13796 1616 aa40.64■■■■■ 4.1
PEMT-207ENST00000461404 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
PEMT-207ENST00000461404 JPH4Q96JJ6 628 aa40.48■■■■■ 4.07
PEMT-207ENST00000461404 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.4■■■■■ 4.06
PEMT-207ENST00000461404 IGF1RP08069 1367 aa40.36■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.4 ms