RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460086.1

PPARA-207, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor alpha, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PPARA, Length 433 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARA-207ENST00000460086 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.4■■■■■ 6.78
PPARA-207ENST00000460086 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.62■■■■■ 5.85
PPARA-207ENST00000460086 ABCC9O60706 1549 aa51.6■■■■■ 5.85
PPARA-207ENST00000460086 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.14■■■■■ 5.46
PPARA-207ENST00000460086 NACADO15069 1562 aa48.76■■■■■ 5.4
PPARA-207ENST00000460086 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.48■■■■■ 5.35
PPARA-207ENST00000460086 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.34■■■■■ 5.33
PPARA-207ENST00000460086 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.07■■■■■ 5.29
PPARA-207ENST00000460086 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.03■■■■■ 5.28
PPARA-207ENST00000460086 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.99■■■■■ 5.27
PPARA-207ENST00000460086 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.66■■■■■ 5.22
PPARA-207ENST00000460086 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.56■■■■■ 5.2
PPARA-207ENST00000460086 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.4■■■■■ 5.18
PPARA-207ENST00000460086 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.04■■■■■ 5.12
PPARA-207ENST00000460086 SCRIBQ14160 1630 aa47.02■■■■■ 5.12
PPARA-207ENST00000460086 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.63■■■■■ 5.06
PPARA-207ENST00000460086 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.52■■■■■ 5.04
PPARA-207ENST00000460086 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.49■■■■■ 5.03
PPARA-207ENST00000460086 NCAPD3P42695 1498 aa44.96■■■■■ 4.79
PPARA-207ENST00000460086 SMARCA4P51532 1647 aa44.83■■■■■ 4.77
PPARA-207ENST00000460086 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.83■■■■■ 4.77
PPARA-207ENST00000460086 SMARCA2P51531 1590 aa44.76■■■■■ 4.76
PPARA-207ENST00000460086 HMGXB3Q12766 1538 aa44.68■■■■■ 4.74
PPARA-207ENST00000460086 ERCC6Q03468 1493 aa44.6■■■■■ 4.73
PPARA-207ENST00000460086 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.6■■■■■ 4.73
PPARA-207ENST00000460086 CUX2O14529 1486 aa44.5■■■■■ 4.71
PPARA-207ENST00000460086 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.47■■■■■ 4.71
PPARA-207ENST00000460086 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.45■■■■■ 4.71
PPARA-207ENST00000460086 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.36■■■■■ 4.69
PPARA-207ENST00000460086 NESP48681 1621 aa44.31■■■■■ 4.68
PPARA-207ENST00000460086 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.22■■■■■ 4.67
PPARA-207ENST00000460086 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.03■■■■■ 4.64
PPARA-207ENST00000460086 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
PPARA-207ENST00000460086 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.81■■■■■ 4.6
PPARA-207ENST00000460086 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.74■■■■■ 4.59
PPARA-207ENST00000460086 WIZO95785 1651 aa43.74■■■■■ 4.59
PPARA-207ENST00000460086 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.59■■■■■ 4.57
PPARA-207ENST00000460086 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.38■■■■■ 4.54
PPARA-207ENST00000460086 WDR62O43379 1518 aa43.27■■■■■ 4.52
PPARA-207ENST00000460086 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.26■■■■■ 4.52
PPARA-207ENST00000460086 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.22■■■■■ 4.51
PPARA-207ENST00000460086 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
PPARA-207ENST00000460086 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.14■■■■■ 4.5
PPARA-207ENST00000460086 CFTRP13569 1480 aa43.1■■■■■ 4.49
PPARA-207ENST00000460086 PRDM2Q13029 1718 aa42.81■■■■■ 4.44
PPARA-207ENST00000460086 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
PPARA-207ENST00000460086 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.64■■■■■ 4.42
PPARA-207ENST00000460086 TRIM41Q8WV44 630 aa42.56■■■■■ 4.4
PPARA-207ENST00000460086 OSCARQ8IYS5 282 aa42.43■■■■■ 4.38
PPARA-207ENST00000460086 IFT140Q96RY7 1462 aa42.33■■■■■ 4.37
PPARA-207ENST00000460086 TOPBP1Q92547 1522 aa42.31■■■■■ 4.36
PPARA-207ENST00000460086 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.25■■■■■ 4.35
PPARA-207ENST00000460086 ABCC8Q09428 1581 aa42.23■■■■■ 4.35
PPARA-207ENST00000460086 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.19■■■■■ 4.34
PPARA-207ENST00000460086 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
PPARA-207ENST00000460086 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
PPARA-207ENST00000460086 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.95■■■■■ 4.31
PPARA-207ENST00000460086 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.95■■■■■ 4.31
PPARA-207ENST00000460086 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.95■■■■■ 4.31
PPARA-207ENST00000460086 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.29
PPARA-207ENST00000460086 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.85■■■■■ 4.29
PPARA-207ENST00000460086 CHD1O14646 1710 aa41.82■■■■■ 4.29
PPARA-207ENST00000460086 ARHGEF11O15085 1522 aa41.79■■■■■ 4.28
PPARA-207ENST00000460086 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.71■■■■■ 4.27
PPARA-207ENST00000460086 SOGA1O94964 1423 aa41.68■■■■■ 4.26
PPARA-207ENST00000460086 FBLN2P98095 1184 aa41.63■■■■■ 4.25
PPARA-207ENST00000460086 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.62■■■■■ 4.25
PPARA-207ENST00000460086 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
PPARA-207ENST00000460086 WDR97A6NE52 1622 aa41.56■■■■■ 4.24
PPARA-207ENST00000460086 CUX1P39880 1505 aa41.56■■■■■ 4.24
PPARA-207ENST00000460086 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.47■■■■■ 4.23
PPARA-207ENST00000460086 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.44■■■■■ 4.22
PPARA-207ENST00000460086 ARAP1Q96P48 1450 aa41.35■■■■■ 4.21
PPARA-207ENST00000460086 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
PPARA-207ENST00000460086 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
PPARA-207ENST00000460086 GRIN2BQ13224 1484 aa41.34■■■■■ 4.21
PPARA-207ENST00000460086 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
PPARA-207ENST00000460086 SYNJ1O43426 1573 aa41.28■■■■■ 4.2
PPARA-207ENST00000460086 PBRM1Q86U86 1689 aa41.26■■■■■ 4.2
PPARA-207ENST00000460086 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.26■■■■■ 4.2
PPARA-207ENST00000460086 SYNJ2O15056 1496 aa41.21■■■■■ 4.19
PPARA-207ENST00000460086 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.19■■■■■ 4.18
PPARA-207ENST00000460086 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.13■■■■■ 4.17
PPARA-207ENST00000460086 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.11■■■■■ 4.17
PPARA-207ENST00000460086 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.04■■■■■ 4.16
PPARA-207ENST00000460086 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.97■■■■■ 4.15
PPARA-207ENST00000460086 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.94■■■■■ 4.14
PPARA-207ENST00000460086 TOP2BQ02880 1626 aa40.92■■■■■ 4.14
PPARA-207ENST00000460086 GRIN2AQ12879 1464 aa40.82■■■■■ 4.12
PPARA-207ENST00000460086 ADAMTS12P58397 1594 aa40.82■■■■■ 4.12
PPARA-207ENST00000460086 CEP170Q5SW79 1584 aa40.68■■■■■ 4.1
PPARA-207ENST00000460086 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.66■■■■■ 4.1
PPARA-207ENST00000460086 NUP160Q12769 1436 aa40.65■■■■■ 4.1
PPARA-207ENST00000460086 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.64■■■■■ 4.1
PPARA-207ENST00000460086 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.61■■■■■ 4.09
PPARA-207ENST00000460086 SHROOM2Q13796 1616 aa40.53■■■■■ 4.08
PPARA-207ENST00000460086 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
PPARA-207ENST00000460086 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.25■■■■■ 4.03
PPARA-207ENST00000460086 JPH4Q96JJ6 628 aa40.21■■■■■ 4.03
PPARA-207ENST00000460086 KIF27Q86VH2 1401 aa40.09■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.8 ms