RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459946.5

CCDC136-203, Transcript of coiled-coil domain containing 136, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene CCDC136, Length 624 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136-203ENST00000459946 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.16■■■■■ 7.06
CCDC136-203ENST00000459946 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.89■■■■■ 6.06
CCDC136-203ENST00000459946 ABCC9O60706 1549 aa51.99■■■■■ 5.91
CCDC136-203ENST00000459946 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.95■■■■■ 5.59
CCDC136-203ENST00000459946 NACADO15069 1562 aa49.79■■■■■ 5.56
CCDC136-203ENST00000459946 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.52■■■■■ 5.52
CCDC136-203ENST00000459946 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.37■■■■■ 5.49
CCDC136-203ENST00000459946 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.18■■■■■ 5.46
CCDC136-203ENST00000459946 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.99■■■■■ 5.43
CCDC136-203ENST00000459946 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.82■■■■■ 5.41
CCDC136-203ENST00000459946 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.46■■■■■ 5.35
CCDC136-203ENST00000459946 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.38■■■■■ 5.33
CCDC136-203ENST00000459946 SCRIBQ14160 1630 aa48.1■■■■■ 5.29
CCDC136-203ENST00000459946 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.01■■■■■ 5.28
CCDC136-203ENST00000459946 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.96■■■■■ 5.27
CCDC136-203ENST00000459946 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.16■■■■■ 5.14
CCDC136-203ENST00000459946 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.07■■■■■ 5.13
CCDC136-203ENST00000459946 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.8■■■■■ 5.08
CCDC136-203ENST00000459946 SMARCA4P51532 1647 aa46.02■■■■■ 4.96
CCDC136-203ENST00000459946 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.92■■■■■ 4.94
CCDC136-203ENST00000459946 NCAPD3P42695 1498 aa45.9■■■■■ 4.94
CCDC136-203ENST00000459946 SMARCA2P51531 1590 aa45.84■■■■■ 4.93
CCDC136-203ENST00000459946 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.83■■■■■ 4.93
CCDC136-203ENST00000459946 HMGXB3Q12766 1538 aa45.67■■■■■ 4.9
CCDC136-203ENST00000459946 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.6■■■■■ 4.89
CCDC136-203ENST00000459946 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.54■■■■■ 4.88
CCDC136-203ENST00000459946 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.46■■■■■ 4.87
CCDC136-203ENST00000459946 WIZO95785 1651 aa45.06■■■■■ 4.8
CCDC136-203ENST00000459946 ERCC6Q03468 1493 aa44.91■■■■■ 4.78
CCDC136-203ENST00000459946 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.86■■■■■ 4.77
CCDC136-203ENST00000459946 NESP48681 1621 aa44.85■■■■■ 4.77
CCDC136-203ENST00000459946 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.82■■■■■ 4.76
CCDC136-203ENST00000459946 CUX2O14529 1486 aa44.63■■■■■ 4.73
CCDC136-203ENST00000459946 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
CCDC136-203ENST00000459946 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.52■■■■■ 4.72
CCDC136-203ENST00000459946 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.5■■■■■ 4.71
CCDC136-203ENST00000459946 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.41■■■■■ 4.7
CCDC136-203ENST00000459946 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
CCDC136-203ENST00000459946 CFTRP13569 1480 aa44.18■■■■■ 4.66
CCDC136-203ENST00000459946 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.04■■■■■ 4.64
CCDC136-203ENST00000459946 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.03■■■■■ 4.64
CCDC136-203ENST00000459946 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.02■■■■■ 4.64
CCDC136-203ENST00000459946 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.01■■■■■ 4.64
CCDC136-203ENST00000459946 PRDM2Q13029 1718 aa43.95■■■■■ 4.63
CCDC136-203ENST00000459946 WDR62O43379 1518 aa43.92■■■■■ 4.62
CCDC136-203ENST00000459946 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.68■■■■■ 4.58
CCDC136-203ENST00000459946 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.57■■■■■ 4.56
CCDC136-203ENST00000459946 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.37■■■■■ 4.53
CCDC136-203ENST00000459946 ABCC8Q09428 1581 aa43.33■■■■■ 4.53
CCDC136-203ENST00000459946 TOPBP1Q92547 1522 aa43.27■■■■■ 4.52
CCDC136-203ENST00000459946 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.21■■■■■ 4.51
CCDC136-203ENST00000459946 IFT140Q96RY7 1462 aa43.13■■■■■ 4.49
CCDC136-203ENST00000459946 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.88■■■■■ 4.46
CCDC136-203ENST00000459946 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.86■■■■■ 4.45
CCDC136-203ENST00000459946 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.85■■■■■ 4.45
CCDC136-203ENST00000459946 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
CCDC136-203ENST00000459946 CUX1P39880 1505 aa42.76■■■■■ 4.44
CCDC136-203ENST00000459946 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.69■■■■■ 4.42
CCDC136-203ENST00000459946 SOGA1O94964 1423 aa42.68■■■■■ 4.42
CCDC136-203ENST00000459946 OSCARQ8IYS5 282 aa42.66■■■■■ 4.42
CCDC136-203ENST00000459946 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.63■■■■■ 4.42
CCDC136-203ENST00000459946 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.59■■■■■ 4.41
CCDC136-203ENST00000459946 WDR97A6NE52 1622 aa42.58■■■■■ 4.41
CCDC136-203ENST00000459946 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
CCDC136-203ENST00000459946 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.36■■■■■ 4.37
CCDC136-203ENST00000459946 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.36■■■■■ 4.37
CCDC136-203ENST00000459946 CHD1O14646 1710 aa42.34■■■■■ 4.37
CCDC136-203ENST00000459946 TOP2BQ02880 1626 aa42.34■■■■■ 4.37
CCDC136-203ENST00000459946 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.29■■■■■ 4.36
CCDC136-203ENST00000459946 GRIN2BQ13224 1484 aa42.26■■■■■ 4.36
CCDC136-203ENST00000459946 SYNJ1O43426 1573 aa42.25■■■■■ 4.35
CCDC136-203ENST00000459946 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.23■■■■■ 4.35
CCDC136-203ENST00000459946 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.22■■■■■ 4.35
CCDC136-203ENST00000459946 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.2■■■■■ 4.35
CCDC136-203ENST00000459946 PBRM1Q86U86 1689 aa42.19■■■■■ 4.34
CCDC136-203ENST00000459946 FBLN2P98095 1184 aa42.18■■■■■ 4.34
CCDC136-203ENST00000459946 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.17■■■■■ 4.34
CCDC136-203ENST00000459946 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
CCDC136-203ENST00000459946 SYNJ2O15056 1496 aa42.04■■■■■ 4.32
CCDC136-203ENST00000459946 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.03■■■■■ 4.32
CCDC136-203ENST00000459946 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.03■■■■■ 4.32
CCDC136-203ENST00000459946 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.03■■■■■ 4.32
CCDC136-203ENST00000459946 TRIM41Q8WV44 630 aa42.02■■■■■ 4.32
CCDC136-203ENST00000459946 ARHGEF11O15085 1522 aa41.96■■■■■ 4.31
CCDC136-203ENST00000459946 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.85■■■■■ 4.29
CCDC136-203ENST00000459946 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.81■■■■■ 4.28
CCDC136-203ENST00000459946 ADAMTS12P58397 1594 aa41.79■■■■■ 4.28
CCDC136-203ENST00000459946 GRIN2AQ12879 1464 aa41.71■■■■■ 4.27
CCDC136-203ENST00000459946 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.7■■■■■ 4.27
CCDC136-203ENST00000459946 ARAP1Q96P48 1450 aa41.57■■■■■ 4.25
CCDC136-203ENST00000459946 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.56■■■■■ 4.24
CCDC136-203ENST00000459946 NUP160Q12769 1436 aa41.53■■■■■ 4.24
CCDC136-203ENST00000459946 KIF27Q86VH2 1401 aa41.52■■■■■ 4.24
CCDC136-203ENST00000459946 CEP170Q5SW79 1584 aa41.5■■■■■ 4.23
CCDC136-203ENST00000459946 CUL7Q14999 1698 aa41.38■■■■■ 4.21
CCDC136-203ENST00000459946 IGF1RP08069 1367 aa41.35■■■■■ 4.21
CCDC136-203ENST00000459946 SHROOM2Q13796 1616 aa41.31■■■■■ 4.2
CCDC136-203ENST00000459946 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.18■■■■■ 4.18
CCDC136-203ENST00000459946 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.16■■■■■ 4.18
CCDC136-203ENST00000459946 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.12■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms