RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458696.2

LATS1-204, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

TSL 3

Gene LATS1, Length 602 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-204ENST00000458696 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.75■■■■□ 3.63
LATS1-204ENST00000458696 ABCC9O60706 1549 aa33.77■■■■□ 3
LATS1-204ENST00000458696 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.66■■■□□ 2.98
LATS1-204ENST00000458696 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.07■■■□□ 2.72
LATS1-204ENST00000458696 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32■■■□□ 2.71
LATS1-204ENST00000458696 NACADO15069 1562 aa31.9■■■□□ 2.7
LATS1-204ENST00000458696 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.75■■■□□ 2.67
LATS1-204ENST00000458696 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.57■■■□□ 2.64
LATS1-204ENST00000458696 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.48■■■□□ 2.63
LATS1-204ENST00000458696 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.29■■■□□ 2.6
LATS1-204ENST00000458696 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
LATS1-204ENST00000458696 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.19■■■□□ 2.58
LATS1-204ENST00000458696 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.13■■■□□ 2.57
LATS1-204ENST00000458696 SCRIBQ14160 1630 aa30.78■■■□□ 2.52
LATS1-204ENST00000458696 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.68■■■□□ 2.5
LATS1-204ENST00000458696 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.44■■■□□ 2.46
LATS1-204ENST00000458696 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
LATS1-204ENST00000458696 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.38■■■□□ 2.45
LATS1-204ENST00000458696 NCAPD3P42695 1498 aa29.53■■■□□ 2.32
LATS1-204ENST00000458696 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.45■■■□□ 2.31
LATS1-204ENST00000458696 SMARCA4P51532 1647 aa29.36■■■□□ 2.29
LATS1-204ENST00000458696 SMARCA2P51531 1590 aa29.29■■■□□ 2.28
LATS1-204ENST00000458696 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
LATS1-204ENST00000458696 HMGXB3Q12766 1538 aa29.21■■■□□ 2.27
LATS1-204ENST00000458696 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
LATS1-204ENST00000458696 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.12■■■□□ 2.25
LATS1-204ENST00000458696 ERCC6Q03468 1493 aa29.1■■■□□ 2.25
LATS1-204ENST00000458696 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.06■■■□□ 2.24
LATS1-204ENST00000458696 NESP48681 1621 aa29.05■■■□□ 2.24
LATS1-204ENST00000458696 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.02■■■□□ 2.24
LATS1-204ENST00000458696 CUX2O14529 1486 aa28.97■■■□□ 2.23
LATS1-204ENST00000458696 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.74■■■□□ 2.19
LATS1-204ENST00000458696 WIZO95785 1651 aa28.72■■■□□ 2.19
LATS1-204ENST00000458696 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.66■■■□□ 2.18
LATS1-204ENST00000458696 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.66■■■□□ 2.18
LATS1-204ENST00000458696 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
LATS1-204ENST00000458696 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
LATS1-204ENST00000458696 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.54■■■□□ 2.16
LATS1-204ENST00000458696 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.37■■■□□ 2.13
LATS1-204ENST00000458696 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
LATS1-204ENST00000458696 CFTRP13569 1480 aa28.32■■■□□ 2.12
LATS1-204ENST00000458696 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.29■■■□□ 2.12
LATS1-204ENST00000458696 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.27■■■□□ 2.12
LATS1-204ENST00000458696 WDR62O43379 1518 aa28.27■■■□□ 2.12
LATS1-204ENST00000458696 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.12■■■□□ 2.09
LATS1-204ENST00000458696 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
LATS1-204ENST00000458696 OSCARQ8IYS5 282 aa27.83■■■□□ 2.05
LATS1-204ENST00000458696 PRDM2Q13029 1718 aa27.82■■■□□ 2.04
LATS1-204ENST00000458696 TRIM41Q8WV44 630 aa27.79■■■□□ 2.04
LATS1-204ENST00000458696 TOPBP1Q92547 1522 aa27.76■■■□□ 2.03
LATS1-204ENST00000458696 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
LATS1-204ENST00000458696 IFT140Q96RY7 1462 aa27.72■■■□□ 2.03
LATS1-204ENST00000458696 ABCC8Q09428 1581 aa27.67■■■□□ 2.02
LATS1-204ENST00000458696 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.6■■■□□ 2.01
LATS1-204ENST00000458696 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.52■■■□□ 27e-7■■■■■ 32.5
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LATS1-204ENST00000458696 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
LATS1-204ENST00000458696 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
LATS1-204ENST00000458696 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.44■■□□□ 1.98
LATS1-204ENST00000458696 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
LATS1-204ENST00000458696 SOGA1O94964 1423 aa27.42■■□□□ 1.98
LATS1-204ENST00000458696 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
LATS1-204ENST00000458696 FBLN2P98095 1184 aa27.37■■□□□ 1.97
LATS1-204ENST00000458696 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.32■■□□□ 1.96
LATS1-204ENST00000458696 CUX1P39880 1505 aa27.32■■□□□ 1.96
LATS1-204ENST00000458696 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.3■■□□□ 1.96
LATS1-204ENST00000458696 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.3■■□□□ 1.96
LATS1-204ENST00000458696 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.3■■□□□ 1.96
LATS1-204ENST00000458696 ARHGEF11O15085 1522 aa27.26■■□□□ 1.95
LATS1-204ENST00000458696 CHD1O14646 1710 aa27.21■■□□□ 1.95
LATS1-204ENST00000458696 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.2■■□□□ 1.94
LATS1-204ENST00000458696 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.17■■□□□ 1.94
LATS1-204ENST00000458696 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
LATS1-204ENST00000458696 GRIN2BQ13224 1484 aa27.11■■□□□ 1.93
LATS1-204ENST00000458696 WDR97A6NE52 1622 aa27.1■■□□□ 1.93
LATS1-204ENST00000458696 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
LATS1-204ENST00000458696 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.05■■□□□ 1.92
LATS1-204ENST00000458696 ARAP1Q96P48 1450 aa27.02■■□□□ 1.92
LATS1-204ENST00000458696 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.01■■□□□ 1.91
LATS1-204ENST00000458696 SYNJ2O15056 1496 aa27■■□□□ 1.91
LATS1-204ENST00000458696 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.95■■□□□ 1.91
LATS1-204ENST00000458696 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.95■■□□□ 1.9
LATS1-204ENST00000458696 SYNJ1O43426 1573 aa26.92■■□□□ 1.9
LATS1-204ENST00000458696 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.9■■□□□ 1.9
LATS1-204ENST00000458696 PBRM1Q86U86 1689 aa26.88■■□□□ 1.89
LATS1-204ENST00000458696 TOP2BQ02880 1626 aa26.86■■□□□ 1.89
LATS1-204ENST00000458696 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
LATS1-204ENST00000458696 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.82■■□□□ 1.88
LATS1-204ENST00000458696 GRIN2AQ12879 1464 aa26.74■■□□□ 1.87
LATS1-204ENST00000458696 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.71■■□□□ 1.87
LATS1-204ENST00000458696 ADAMTS12P58397 1594 aa26.68■■□□□ 1.86
LATS1-204ENST00000458696 NUP160Q12769 1436 aa26.67■■□□□ 1.86
LATS1-204ENST00000458696 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.65■■□□□ 1.86
LATS1-204ENST00000458696 CEP170Q5SW79 1584 aa26.63■■□□□ 1.85
LATS1-204ENST00000458696 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.61■■□□□ 1.85
LATS1-204ENST00000458696 JPH4Q96JJ6 628 aa26.53■■□□□ 1.84
LATS1-204ENST00000458696 IGF1RP08069 1367 aa26.48■■□□□ 1.83
LATS1-204ENST00000458696 SHROOM2Q13796 1616 aa26.47■■□□□ 1.83
LATS1-204ENST00000458696 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
LATS1-204ENST00000458696 KIF27Q86VH2 1401 aa26.4■■□□□ 1.82
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