RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457586.1

PRNP-204, Transcript of prion protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRNP, Length 855 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNP-204ENST00000457586 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.22■■■■■ 6.91
PRNP-204ENST00000457586 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.04■■■■■ 5.92
PRNP-204ENST00000457586 ABCC9O60706 1549 aa51.23■■■■■ 5.79
PRNP-204ENST00000457586 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.16■■■■■ 5.46
PRNP-204ENST00000457586 NACADO15069 1562 aa49.02■■■■■ 5.44
PRNP-204ENST00000457586 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.65■■■■■ 5.38
PRNP-204ENST00000457586 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.62■■■■■ 5.37
PRNP-204ENST00000457586 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.41■■■■■ 5.34
PRNP-204ENST00000457586 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.24■■■■■ 5.31
PRNP-204ENST00000457586 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.06■■■■■ 5.28
PRNP-204ENST00000457586 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.75■■■■■ 5.23
PRNP-204ENST00000457586 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.71■■■■■ 5.23
PRNP-204ENST00000457586 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.5■■■■■ 5.19
PRNP-204ENST00000457586 SCRIBQ14160 1630 aa47.3■■■■■ 5.16
PRNP-204ENST00000457586 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.26■■■■■ 5.16
PRNP-204ENST00000457586 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.47■■■■■ 5.03
PRNP-204ENST00000457586 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.39■■■■■ 5.02
PRNP-204ENST00000457586 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.13■■■■■ 4.98
PRNP-204ENST00000457586 SMARCA4P51532 1647 aa45.27■■■■■ 4.84
PRNP-204ENST00000457586 NCAPD3P42695 1498 aa45.24■■■■■ 4.83
PRNP-204ENST00000457586 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.16■■■■■ 4.82
PRNP-204ENST00000457586 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.16■■■■■ 4.82
PRNP-204ENST00000457586 SMARCA2P51531 1590 aa45.09■■■■■ 4.81
PRNP-204ENST00000457586 HMGXB3Q12766 1538 aa44.98■■■■■ 4.79
PRNP-204ENST00000457586 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.92■■■■■ 4.78
PRNP-204ENST00000457586 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.82■■■■■ 4.77
PRNP-204ENST00000457586 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.72■■■■■ 4.75
PRNP-204ENST00000457586 WIZO95785 1651 aa44.31■■■■■ 4.68
PRNP-204ENST00000457586 NESP48681 1621 aa44.21■■■■■ 4.67
PRNP-204ENST00000457586 ERCC6Q03468 1493 aa44.2■■■■■ 4.67
PRNP-204ENST00000457586 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.16■■■■■ 4.66
PRNP-204ENST00000457586 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.12■■■■■ 4.65
PRNP-204ENST00000457586 CUX2O14529 1486 aa44.02■■■■■ 4.64
PRNP-204ENST00000457586 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.86■■■■■ 4.61
PRNP-204ENST00000457586 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
PRNP-204ENST00000457586 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.8■■■■■ 4.6
PRNP-204ENST00000457586 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.72■■■■■ 4.59
PRNP-204ENST00000457586 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.71■■■■■ 4.59
PRNP-204ENST00000457586 CFTRP13569 1480 aa43.52■■■■■ 4.56
PRNP-204ENST00000457586 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.38■■■■■ 4.53
PRNP-204ENST00000457586 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.33■■■■■ 4.53
PRNP-204ENST00000457586 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.32■■■■■ 4.53
PRNP-204ENST00000457586 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.31■■■■■ 4.52
PRNP-204ENST00000457586 WDR62O43379 1518 aa43.29■■■■■ 4.52
PRNP-204ENST00000457586 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.2■■■■■ 4.51
PRNP-204ENST00000457586 PRDM2Q13029 1718 aa43.17■■■■■ 4.5
PRNP-204ENST00000457586 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.94■■■■■ 4.46
PRNP-204ENST00000457586 ABCC8Q09428 1581 aa42.61■■■■■ 4.41
PRNP-204ENST00000457586 TOPBP1Q92547 1522 aa42.6■■■■■ 4.41
PRNP-204ENST00000457586 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.52■■■■■ 4.4
PRNP-204ENST00000457586 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
PRNP-204ENST00000457586 IFT140Q96RY7 1462 aa42.46■■■■■ 4.39
PRNP-204ENST00000457586 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.27■■■■■ 4.36
PRNP-204ENST00000457586 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
PRNP-204ENST00000457586 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
PRNP-204ENST00000457586 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
PRNP-204ENST00000457586 CUX1P39880 1505 aa42.1■■■■■ 4.33
PRNP-204ENST00000457586 OSCARQ8IYS5 282 aa42.03■■■■■ 4.32
PRNP-204ENST00000457586 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.01■■■■■ 4.32
PRNP-204ENST00000457586 SOGA1O94964 1423 aa41.99■■■■■ 4.31
PRNP-204ENST00000457586 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.98■■■■■ 4.31
PRNP-204ENST00000457586 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.95■■■■■ 4.31
PRNP-204ENST00000457586 WDR97A6NE52 1622 aa41.9■■■■■ 4.3
PRNP-204ENST00000457586 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
PRNP-204ENST00000457586 CHD1O14646 1710 aa41.66■■■■■ 4.26
PRNP-204ENST00000457586 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.64■■■■■ 4.26
PRNP-204ENST00000457586 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.63■■■■■ 4.25
PRNP-204ENST00000457586 TOP2BQ02880 1626 aa41.62■■■■■ 4.25
PRNP-204ENST00000457586 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.62■■■■■ 4.25
PRNP-204ENST00000457586 GRIN2BQ13224 1484 aa41.59■■■■■ 4.25
PRNP-204ENST00000457586 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.56■■■■■ 4.24
PRNP-204ENST00000457586 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
PRNP-204ENST00000457586 SYNJ1O43426 1573 aa41.55■■■■■ 4.24
PRNP-204ENST00000457586 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.52■■■■■ 4.24
PRNP-204ENST00000457586 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.51■■■■■ 4.23
PRNP-204ENST00000457586 PBRM1Q86U86 1689 aa41.47■■■■■ 4.23
PRNP-204ENST00000457586 FBLN2P98095 1184 aa41.45■■■■■ 4.23
PRNP-204ENST00000457586 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.44■■■■■ 4.22
PRNP-204ENST00000457586 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.44■■■■■ 4.22
PRNP-204ENST00000457586 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.44■■■■■ 4.22
PRNP-204ENST00000457586 TRIM41Q8WV44 630 aa41.41■■■■■ 4.22
PRNP-204ENST00000457586 SYNJ2O15056 1496 aa41.39■■■■■ 4.22
PRNP-204ENST00000457586 ARHGEF11O15085 1522 aa41.39■■■■■ 4.22
PRNP-204ENST00000457586 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
PRNP-204ENST00000457586 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.25■■■■■ 4.19
PRNP-204ENST00000457586 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.13■■■■■ 4.18
PRNP-204ENST00000457586 ADAMTS12P58397 1594 aa41.12■■■■■ 4.17
PRNP-204ENST00000457586 GRIN2AQ12879 1464 aa41.05■■■■■ 4.16
PRNP-204ENST00000457586 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.03■■■■■ 4.16
PRNP-204ENST00000457586 ARAP1Q96P48 1450 aa41.02■■■■■ 4.16
PRNP-204ENST00000457586 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.94■■■■■ 4.14
PRNP-204ENST00000457586 NUP160Q12769 1436 aa40.93■■■■■ 4.14
PRNP-204ENST00000457586 CEP170Q5SW79 1584 aa40.86■■■■■ 4.13
PRNP-204ENST00000457586 KIF27Q86VH2 1401 aa40.79■■■■■ 4.12
PRNP-204ENST00000457586 IGF1RP08069 1367 aa40.71■■■■■ 4.11
PRNP-204ENST00000457586 SHROOM2Q13796 1616 aa40.7■■■■■ 4.11
PRNP-204ENST00000457586 CUL7Q14999 1698 aa40.65■■■■■ 4.1
PRNP-204ENST00000457586 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.57■■■■■ 4.09
PRNP-204ENST00000457586 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.53■■■■■ 4.08
PRNP-204ENST00000457586 JPH4Q96JJ6 628 aa40.44■■■■■ 4.06
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