RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457204.2

MED22-204, Transcript of mediator complex subunit 22, humanhuman

TSL 4

Gene MED22, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED22-204ENST00000457204 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.62■■■■■ 4.09
MED22-204ENST00000457204 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.26■■■■□ 3.39
MED22-204ENST00000457204 ABCC9O60706 1549 aa35.97■■■■□ 3.35
MED22-204ENST00000457204 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.3■■■■□ 3.08
MED22-204ENST00000457204 NACADO15069 1562 aa34.17■■■■□ 3.06
MED22-204ENST00000457204 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.02■■■■□ 3.04
MED22-204ENST00000457204 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.82■■■■□ 3
MED22-204ENST00000457204 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
MED22-204ENST00000457204 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.74■■■□□ 2.99
MED22-204ENST00000457204 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.6■■■□□ 2.97
MED22-204ENST00000457204 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.56■■■□□ 2.96
MED22-204ENST00000457204 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.53■■■□□ 2.96
MED22-204ENST00000457204 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.49■■■□□ 2.95
MED22-204ENST00000457204 SCRIBQ14160 1630 aa33.1■■■□□ 2.89
MED22-204ENST00000457204 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.82■■■□□ 2.84
MED22-204ENST00000457204 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.53■■■□□ 2.8
MED22-204ENST00000457204 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
MED22-204ENST00000457204 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.32■■■□□ 2.76
MED22-204ENST00000457204 SMARCA4P51532 1647 aa31.62■■■□□ 2.65
MED22-204ENST00000457204 NCAPD3P42695 1498 aa31.59■■■□□ 2.65
MED22-204ENST00000457204 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.56■■■□□ 2.64
MED22-204ENST00000457204 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
MED22-204ENST00000457204 SMARCA2P51531 1590 aa31.39■■■□□ 2.62
MED22-204ENST00000457204 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.37■■■□□ 2.61
MED22-204ENST00000457204 HMGXB3Q12766 1538 aa31.36■■■□□ 2.61
MED22-204ENST00000457204 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.31■■■□□ 2.6
MED22-204ENST00000457204 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.58
MED22-204ENST00000457204 NESP48681 1621 aa31.07■■■□□ 2.56
MED22-204ENST00000457204 WIZO95785 1651 aa31.01■■■□□ 2.55
MED22-204ENST00000457204 ERCC6Q03468 1493 aa30.89■■■□□ 2.54
MED22-204ENST00000457204 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
MED22-204ENST00000457204 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.78■■■□□ 2.52
MED22-204ENST00000457204 CUX2O14529 1486 aa30.76■■■□□ 2.52
MED22-204ENST00000457204 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.67■■■□□ 2.5
MED22-204ENST00000457204 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
MED22-204ENST00000457204 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.62■■■□□ 2.49
MED22-204ENST00000457204 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
MED22-204ENST00000457204 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.52■■■□□ 2.48
MED22-204ENST00000457204 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.43■■■□□ 2.46
MED22-204ENST00000457204 CFTRP13569 1480 aa30.38■■■□□ 2.45
MED22-204ENST00000457204 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.31■■■□□ 2.44
MED22-204ENST00000457204 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.27■■■□□ 2.44
MED22-204ENST00000457204 WDR62O43379 1518 aa30.27■■■□□ 2.44
MED22-204ENST00000457204 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.25■■■□□ 2.43
MED22-204ENST00000457204 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.23■■■□□ 2.43
MED22-204ENST00000457204 PRDM2Q13029 1718 aa30.1■■■□□ 2.41
MED22-204ENST00000457204 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
MED22-204ENST00000457204 TOPBP1Q92547 1522 aa29.77■■■□□ 2.36
MED22-204ENST00000457204 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
MED22-204ENST00000457204 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.66■■■□□ 2.34
MED22-204ENST00000457204 IFT140Q96RY7 1462 aa29.61■■■□□ 2.33
MED22-204ENST00000457204 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
MED22-204ENST00000457204 ABCC8Q09428 1581 aa29.59■■■□□ 2.33
MED22-204ENST00000457204 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
MED22-204ENST00000457204 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
MED22-204ENST00000457204 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
MED22-204ENST00000457204 CUX1P39880 1505 aa29.43■■■□□ 2.3
MED22-204ENST00000457204 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.42■■■□□ 2.3
MED22-204ENST00000457204 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.41■■■□□ 2.31e-7■■■■■ 27.3
MED22-204ENST00000457204 OSCARQ8IYS5 282 aa29.4■■■□□ 2.3
MED22-204ENST00000457204 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.35■■■□□ 2.29
MED22-204ENST00000457204 SOGA1O94964 1423 aa29.31■■■□□ 2.28
MED22-204ENST00000457204 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
MED22-204ENST00000457204 CHD1O14646 1710 aa29.22■■■□□ 2.27
MED22-204ENST00000457204 WDR97A6NE52 1622 aa29.19■■■□□ 2.26
MED22-204ENST00000457204 TRIM41Q8WV44 630 aa29.18■■■□□ 2.26
MED22-204ENST00000457204 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.1■■■□□ 2.25
MED22-204ENST00000457204 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.1■■■□□ 2.25
MED22-204ENST00000457204 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.1■■■□□ 2.25
MED22-204ENST00000457204 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.07■■■□□ 2.24
MED22-204ENST00000457204 SYNJ1O43426 1573 aa29.05■■■□□ 2.24
MED22-204ENST00000457204 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.02■■■□□ 2.24
MED22-204ENST00000457204 ARHGEF11O15085 1522 aa29.02■■■□□ 2.24
MED22-204ENST00000457204 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.02■■■□□ 2.24
MED22-204ENST00000457204 FBLN2P98095 1184 aa29■■■□□ 2.23
MED22-204ENST00000457204 TOP2BQ02880 1626 aa29■■■□□ 2.23
MED22-204ENST00000457204 GRIN2BQ13224 1484 aa28.99■■■□□ 2.23
MED22-204ENST00000457204 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.99■■■□□ 2.23
MED22-204ENST00000457204 PBRM1Q86U86 1689 aa28.99■■■□□ 2.23
MED22-204ENST00000457204 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.97■■■□□ 2.23
MED22-204ENST00000457204 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.97■■■□□ 2.23
MED22-204ENST00000457204 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
MED22-204ENST00000457204 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.89■■■□□ 2.21
MED22-204ENST00000457204 SYNJ2O15056 1496 aa28.87■■■□□ 2.21
MED22-204ENST00000457204 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
MED22-204ENST00000457204 ARAP1Q96P48 1450 aa28.79■■■□□ 2.2
MED22-204ENST00000457204 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.74■■■□□ 2.19
MED22-204ENST00000457204 ADAMTS12P58397 1594 aa28.72■■■□□ 2.19
MED22-204ENST00000457204 GRIN2AQ12879 1464 aa28.66■■■□□ 2.18
MED22-204ENST00000457204 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.63■■■□□ 2.17
MED22-204ENST00000457204 CEP170Q5SW79 1584 aa28.62■■■□□ 2.17
MED22-204ENST00000457204 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.59■■■□□ 2.17
MED22-204ENST00000457204 NUP160Q12769 1436 aa28.59■■■□□ 2.17
MED22-204ENST00000457204 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.55■■■□□ 2.16
MED22-204ENST00000457204 SHROOM2Q13796 1616 aa28.45■■■□□ 2.14
MED22-204ENST00000457204 IGF1RP08069 1367 aa28.41■■■□□ 2.14
MED22-204ENST00000457204 KIF27Q86VH2 1401 aa28.35■■■□□ 2.13
MED22-204ENST00000457204 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.32■■■□□ 2.12
MED22-204ENST00000457204 CUL7Q14999 1698 aa28.26■■■□□ 2.12
MED22-204ENST00000457204 JPH4Q96JJ6 628 aa28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms