RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452979.5

HERC3-207, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HERC3, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-207ENST00000452979 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.61■■■□□ 2.33
HERC3-207ENST00000452979 ABCC9O60706 1549 aa26.75■■□□□ 1.87
HERC3-207ENST00000452979 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.66■■□□□ 1.86
HERC3-207ENST00000452979 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.44■■□□□ 1.66
HERC3-207ENST00000452979 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.3■■□□□ 1.64
HERC3-207ENST00000452979 NACADO15069 1562 aa25.24■■□□□ 1.63
HERC3-207ENST00000452979 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.97■■□□□ 1.59
HERC3-207ENST00000452979 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.89■■□□□ 1.58
HERC3-207ENST00000452979 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.87■■□□□ 1.57
HERC3-207ENST00000452979 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
HERC3-207ENST00000452979 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.71■■□□□ 1.55
HERC3-207ENST00000452979 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
HERC3-207ENST00000452979 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.48■■□□□ 1.51
HERC3-207ENST00000452979 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.38■■□□□ 1.49
HERC3-207ENST00000452979 SCRIBQ14160 1630 aa24.2■■□□□ 1.46
HERC3-207ENST00000452979 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.2■■□□□ 1.46
HERC3-207ENST00000452979 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.13■■□□□ 1.45
HERC3-207ENST00000452979 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HERC3-207ENST00000452979 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.38■■□□□ 1.33
HERC3-207ENST00000452979 NCAPD3P42695 1498 aa23.31■■□□□ 1.32
HERC3-207ENST00000452979 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.18■■□□□ 1.3
HERC3-207ENST00000452979 CUX2O14529 1486 aa23.17■■□□□ 1.3
HERC3-207ENST00000452979 SMARCA4P51532 1647 aa23.11■■□□□ 1.29
HERC3-207ENST00000452979 SMARCA2P51531 1590 aa23.11■■□□□ 1.29
HERC3-207ENST00000452979 HMGXB3Q12766 1538 aa23.09■■□□□ 1.29
HERC3-207ENST00000452979 ERCC6Q03468 1493 aa23.09■■□□□ 1.29
HERC3-207ENST00000452979 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
HERC3-207ENST00000452979 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.94■■□□□ 1.26
HERC3-207ENST00000452979 NESP48681 1621 aa22.93■■□□□ 1.26
HERC3-207ENST00000452979 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HERC3-207ENST00000452979 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.8■■□□□ 1.24
HERC3-207ENST00000452979 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.78■■□□□ 1.24
HERC3-207ENST00000452979 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
HERC3-207ENST00000452979 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.66■■□□□ 1.22
HERC3-207ENST00000452979 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.65■■□□□ 1.22
HERC3-207ENST00000452979 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.57■■□□□ 1.2
HERC3-207ENST00000452979 WIZO95785 1651 aa22.51■■□□□ 1.19
HERC3-207ENST00000452979 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.46■■□□□ 1.19
HERC3-207ENST00000452979 WDR62O43379 1518 aa22.43■■□□□ 1.18
HERC3-207ENST00000452979 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.32■■□□□ 1.16
HERC3-207ENST00000452979 CFTRP13569 1480 aa22.28■■□□□ 1.16
HERC3-207ENST00000452979 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.28■■□□□ 1.16
HERC3-207ENST00000452979 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HERC3-207ENST00000452979 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HERC3-207ENST00000452979 TRIM41Q8WV44 630 aa22.18■■□□□ 1.14
HERC3-207ENST00000452979 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HERC3-207ENST00000452979 OSCARQ8IYS5 282 aa22.08■■□□□ 1.13
HERC3-207ENST00000452979 PRDM2Q13029 1718 aa22.07■■□□□ 1.12
HERC3-207ENST00000452979 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.97■■□□□ 1.11
HERC3-207ENST00000452979 IFT140Q96RY7 1462 aa21.9■■□□□ 1.1
HERC3-207ENST00000452979 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
HERC3-207ENST00000452979 TOPBP1Q92547 1522 aa21.85■■□□□ 1.09
HERC3-207ENST00000452979 ABCC8Q09428 1581 aa21.84■■□□□ 1.09
HERC3-207ENST00000452979 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.8■■□□□ 1.08
HERC3-207ENST00000452979 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.8■■□□□ 1.08
HERC3-207ENST00000452979 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.8■■□□□ 1.08
HERC3-207ENST00000452979 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.76■■□□□ 1.07
HERC3-207ENST00000452979 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
HERC3-207ENST00000452979 ARHGEF11O15085 1522 aa21.7■■□□□ 1.07
HERC3-207ENST00000452979 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
HERC3-207ENST00000452979 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.65■■□□□ 1.06
HERC3-207ENST00000452979 CHD1O14646 1710 aa21.63■■□□□ 1.05
HERC3-207ENST00000452979 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
HERC3-207ENST00000452979 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.55■■□□□ 1.04
HERC3-207ENST00000452979 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.52■■□□□ 1.04
HERC3-207ENST00000452979 SOGA1O94964 1423 aa21.52■■□□□ 1.04
HERC3-207ENST00000452979 FBLN2P98095 1184 aa21.5■■□□□ 1.03
HERC3-207ENST00000452979 WDR97A6NE52 1622 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC3-207ENST00000452979 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HERC3-207ENST00000452979 ARAP1Q96P48 1450 aa21.47■■□□□ 1.03
HERC3-207ENST00000452979 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.45■■□□□ 1.02
HERC3-207ENST00000452979 CUX1P39880 1505 aa21.41■■□□□ 1.02
HERC3-207ENST00000452979 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.4■■□□□ 1.02
HERC3-207ENST00000452979 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.39■■□□□ 1.01
HERC3-207ENST00000452979 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HERC3-207ENST00000452979 GRIN2BQ13224 1484 aa21.35■■□□□ 1.01
HERC3-207ENST00000452979 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
HERC3-207ENST00000452979 SYNJ1O43426 1573 aa21.34■■□□□ 1.01
HERC3-207ENST00000452979 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
HERC3-207ENST00000452979 SYNJ2O15056 1496 aa21.31■■□□□ 1
HERC3-207ENST00000452979 PBRM1Q86U86 1689 aa21.27■■□□□ 1
HERC3-207ENST00000452979 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.25■□□□□ 0.99
HERC3-207ENST00000452979 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.22■□□□□ 0.99
HERC3-207ENST00000452979 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.21■□□□□ 0.99
HERC3-207ENST00000452979 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.09■□□□□ 0.97
HERC3-207ENST00000452979 GRIN2AQ12879 1464 aa21.07■□□□□ 0.96
HERC3-207ENST00000452979 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
HERC3-207ENST00000452979 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.05■□□□□ 0.96
HERC3-207ENST00000452979 TOP2BQ02880 1626 aa21.04■□□□□ 0.96
HERC3-207ENST00000452979 ADAMTS12P58397 1594 aa21.03■□□□□ 0.96
HERC3-207ENST00000452979 NUP160Q12769 1436 aa21.03■□□□□ 0.96
HERC3-207ENST00000452979 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.02■□□□□ 0.95
HERC3-207ENST00000452979 CEP170Q5SW79 1584 aa21.01■□□□□ 0.95
HERC3-207ENST00000452979 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.98■□□□□ 0.95
HERC3-207ENST00000452979 SHROOM2Q13796 1616 aa20.98■□□□□ 0.95
HERC3-207ENST00000452979 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.96■□□□□ 0.95
HERC3-207ENST00000452979 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
HERC3-207ENST00000452979 JPH4Q96JJ6 628 aa20.82■□□□□ 0.92
HERC3-207ENST00000452979 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
HERC3-207ENST00000452979 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.78■□□□□ 0.92
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