RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452545.1

ABCB6-206, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 6 (Langereis blood group), human

TSL 4

Gene ABCB6, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCB6-206	ENST00000452545	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		41.38	■■■■■ 4.21
ABCB6-206	ENST00000452545	ABCC9	O60706	1549 aa		37.31	■■■■□ 3.56
ABCB6-206	ENST00000452545	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		37.14	■■■■□ 3.54
ABCB6-206	ENST00000452545	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		35.45	■■■■□ 3.27
ABCB6-206	ENST00000452545	NACAD	O15069	1562 aa		35.17	■■■■□ 3.22
ABCB6-206	ENST00000452545	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		35.08	■■■■□ 3.21
ABCB6-206	ENST00000452545	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		35.05	■■■■□ 3.2
ABCB6-206	ENST00000452545	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	34.74	■■■■□ 3.15
ABCB6-206	ENST00000452545	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		34.64	■■■■□ 3.14
ABCB6-206	ENST00000452545	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		34.53	■■■■□ 3.12
ABCB6-206	ENST00000452545	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		34.36	■■■■□ 3.09
ABCB6-206	ENST00000452545	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	34.26	■■■■□ 3.07
ABCB6-206	ENST00000452545	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		34.15	■■■■□ 3.06
ABCB6-206	ENST00000452545	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		33.95	■■■■□ 3.02
ABCB6-206	ENST00000452545	SCRIB	Q14160	1630 aa		33.88	■■■■□ 3.01
ABCB6-206	ENST00000452545	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		33.65	■■■□□ 2.98
ABCB6-206	ENST00000452545	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		33.62	■■■□□ 2.97
ABCB6-206	ENST00000452545	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	33.56	■■■□□ 2.96
ABCB6-206	ENST00000452545	NCAPD3	P42695	1498 aa		32.48	■■■□□ 2.79
ABCB6-206	ENST00000452545	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		32.36	■■■□□ 2.77
ABCB6-206	ENST00000452545	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		32.3	■■■□□ 2.76
ABCB6-206	ENST00000452545	SMARCA4	P51532	1647 aa		32.29	■■■□□ 2.76
ABCB6-206	ENST00000452545	SMARCA2	P51531	1590 aa		32.28	■■■□□ 2.76
ABCB6-206	ENST00000452545	ERCC6	Q03468	1493 aa		32.26	■■■□□ 2.75
ABCB6-206	ENST00000452545	HMGXB3	Q12766	1538 aa		32.21	■■■□□ 2.75
ABCB6-206	ENST00000452545	CUX2	O14529	1486 aa		32.19	■■■□□ 2.74
ABCB6-206	ENST00000452545	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
ABCB6-206	ENST00000452545	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
ABCB6-206	ENST00000452545	NES	P48681	1621 aa		31.99	■■■□□ 2.71
ABCB6-206	ENST00000452545	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		31.95	■■■□□ 2.71
ABCB6-206	ENST00000452545	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		31.88	■■■□□ 2.69
ABCB6-206	ENST00000452545	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		31.75	■■■□□ 2.67
ABCB6-206	ENST00000452545	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	31.65	■■■□□ 2.66
ABCB6-206	ENST00000452545	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		31.62	■■■□□ 2.65
ABCB6-206	ENST00000452545	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		31.54	■■■□□ 2.64
ABCB6-206	ENST00000452545	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		31.51	■■■□□ 2.63
ABCB6-206	ENST00000452545	WIZ	O95785	1651 aa		31.47	■■■□□ 2.63
ABCB6-206	ENST00000452545	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		31.33	■■■□□ 2.61
ABCB6-206	ENST00000452545	WDR62	O43379	1518 aa		31.23	■■■□□ 2.59
ABCB6-206	ENST00000452545	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		31.2	■■■□□ 2.58
ABCB6-206	ENST00000452545	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
ABCB6-206	ENST00000452545	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		31.14	■■■□□ 2.58
ABCB6-206	ENST00000452545	CFTR	P13569	1480 aa		31.1	■■■□□ 2.57
ABCB6-206	ENST00000452545	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
ABCB6-206	ENST00000452545	TRIM41	Q8WV44	630 aa		30.89	■■■□□ 2.54
ABCB6-206	ENST00000452545	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	30.87	■■■□□ 2.53
ABCB6-206	ENST00000452545	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		30.75	■■■□□ 2.51
ABCB6-206	ENST00000452545	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		30.75	■■■□□ 2.51
ABCB6-206	ENST00000452545	PRDM2	Q13029	1718 aa		30.71	■■■□□ 2.51
ABCB6-206	ENST00000452545	IFT140	Q96RY7	1462 aa		30.58	■■■□□ 2.49
ABCB6-206	ENST00000452545	TOPBP1	Q92547	1522 aa		30.53	■■■□□ 2.48
ABCB6-206	ENST00000452545	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	30.52	■■■□□ 2.48
ABCB6-206	ENST00000452545	ABCC8	Q09428	1581 aa		30.48	■■■□□ 2.47
ABCB6-206	ENST00000452545	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		30.41	■■■□□ 2.46
ABCB6-206	ENST00000452545	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	30.32	■■■□□ 2.45
ABCB6-206	ENST00000452545	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		30.29	■■■□□ 2.44
ABCB6-206	ENST00000452545	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		30.29	■■■□□ 2.44
ABCB6-206	ENST00000452545	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		30.29	■■■□□ 2.44
ABCB6-206	ENST00000452545	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	30.25	■■■□□ 2.43	6e-11	■■■■■ 43.4
ABCB6-206	ENST00000452545	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	30.23	■■■□□ 2.43
ABCB6-206	ENST00000452545	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	30.21	■■■□□ 2.43
ABCB6-206	ENST00000452545	ARHGEF11	O15085	1522 aa		30.2	■■■□□ 2.42
ABCB6-206	ENST00000452545	FBLN2	P98095	1184 aa		30.14	■■■□□ 2.42
ABCB6-206	ENST00000452545	SOGA1	O94964	1423 aa		30.11	■■■□□ 2.41
ABCB6-206	ENST00000452545	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		30.11	■■■□□ 2.41
ABCB6-206	ENST00000452545	CHD1	O14646	1710 aa		30.1	■■■□□ 2.41
ABCB6-206	ENST00000452545	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	30.06	■■■□□ 2.4
ABCB6-206	ENST00000452545	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		30.04	■■■□□ 2.4
ABCB6-206	ENST00000452545	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		30.02	■■■□□ 2.4
ABCB6-206	ENST00000452545	CUX1	P39880	1505 aa		29.96	■■■□□ 2.39
ABCB6-206	ENST00000452545	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		29.93	■■■□□ 2.38
ABCB6-206	ENST00000452545	WDR97	A6NE52	1622 aa		29.93	■■■□□ 2.38
ABCB6-206	ENST00000452545	ARAP1	Q96P48	1450 aa		29.89	■■■□□ 2.38
ABCB6-206	ENST00000452545	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	29.89	■■■□□ 2.38
ABCB6-206	ENST00000452545	GRIN2B	Q13224	1484 aa		29.86	■■■□□ 2.37
ABCB6-206	ENST00000452545	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	29.85	■■■□□ 2.37
ABCB6-206	ENST00000452545	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	29.82	■■■□□ 2.36
ABCB6-206	ENST00000452545	SYNJ1	O43426	1573 aa		29.78	■■■□□ 2.36
ABCB6-206	ENST00000452545	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		29.77	■■■□□ 2.36
ABCB6-206	ENST00000452545	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	29.77	■■■□□ 2.36
ABCB6-206	ENST00000452545	SYNJ2	O15056	1496 aa		29.75	■■■□□ 2.35
ABCB6-206	ENST00000452545	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		29.73	■■■□□ 2.35
ABCB6-206	ENST00000452545	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		29.66	■■■□□ 2.34
ABCB6-206	ENST00000452545	PBRM1	Q86U86	1689 aa		29.66	■■■□□ 2.34
ABCB6-206	ENST00000452545	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		29.6	■■■□□ 2.33
ABCB6-206	ENST00000452545	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	29.56	■■■□□ 2.32
ABCB6-206	ENST00000452545	GRIN2A	Q12879	1464 aa		29.45	■■■□□ 2.31
ABCB6-206	ENST00000452545	TOP2B	Q02880	1626 aa		29.44	■■■□□ 2.3
ABCB6-206	ENST00000452545	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		29.42	■■■□□ 2.3
ABCB6-206	ENST00000452545	ADAMTS12	P58397	1594 aa		29.4	■■■□□ 2.3
ABCB6-206	ENST00000452545	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		29.36	■■■□□ 2.29
ABCB6-206	ENST00000452545	NUP160	Q12769	1436 aa		29.35	■■■□□ 2.29
ABCB6-206	ENST00000452545	CEP170	Q5SW79	1584 aa		29.32	■■■□□ 2.28
ABCB6-206	ENST00000452545	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		29.3	■■■□□ 2.28
ABCB6-206	ENST00000452545	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		29.29	■■■□□ 2.28
ABCB6-206	ENST00000452545	SHROOM2	Q13796	1616 aa		29.19	■■■□□ 2.26
ABCB6-206	ENST00000452545	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
ABCB6-206	ENST00000452545	JPH4	Q96JJ6	628 aa		29.09	■■■□□ 2.25
ABCB6-206	ENST00000452545	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
ABCB6-206	ENST00000452545	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		28.98	■■■□□ 2.23

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