RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450625.1

SH3BP5-207, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 763 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-207ENST00000450625 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.46■■■■■ 4.23
SH3BP5-207ENST00000450625 ABCC9O60706 1549 aa37.24■■■■□ 3.55
SH3BP5-207ENST00000450625 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.19■■■■□ 3.54
SH3BP5-207ENST00000450625 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.42■■■■□ 3.26
SH3BP5-207ENST00000450625 NACADO15069 1562 aa35.16■■■■□ 3.22
SH3BP5-207ENST00000450625 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.15■■■■□ 3.22
SH3BP5-207ENST00000450625 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.9■■■■□ 3.18
SH3BP5-207ENST00000450625 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.7■■■■□ 3.15
SH3BP5-207ENST00000450625 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.67■■■■□ 3.14
SH3BP5-207ENST00000450625 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.62■■■■□ 3.13
SH3BP5-207ENST00000450625 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.36■■■■□ 3.09
SH3BP5-207ENST00000450625 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
SH3BP5-207ENST00000450625 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.2■■■■□ 3.06
SH3BP5-207ENST00000450625 SCRIBQ14160 1630 aa33.95■■■■□ 3.03
SH3BP5-207ENST00000450625 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.84■■■■□ 3.01
SH3BP5-207ENST00000450625 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.62■■■□□ 2.97
SH3BP5-207ENST00000450625 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
SH3BP5-207ENST00000450625 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.52■■■□□ 2.96
SH3BP5-207ENST00000450625 NCAPD3P42695 1498 aa32.44■■■□□ 2.78
SH3BP5-207ENST00000450625 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.36■■■□□ 2.77
SH3BP5-207ENST00000450625 SMARCA4P51532 1647 aa32.35■■■□□ 2.77
SH3BP5-207ENST00000450625 SMARCA2P51531 1590 aa32.28■■■□□ 2.76
SH3BP5-207ENST00000450625 HMGXB3Q12766 1538 aa32.2■■■□□ 2.74
SH3BP5-207ENST00000450625 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
SH3BP5-207ENST00000450625 ERCC6Q03468 1493 aa32.16■■■□□ 2.74
SH3BP5-207ENST00000450625 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
SH3BP5-207ENST00000450625 CUX2O14529 1486 aa32.03■■■□□ 2.72
SH3BP5-207ENST00000450625 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.03■■■□□ 2.72
SH3BP5-207ENST00000450625 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.98■■■□□ 2.71
SH3BP5-207ENST00000450625 NESP48681 1621 aa31.98■■■□□ 2.71
SH3BP5-207ENST00000450625 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.96■■■□□ 2.71
SH3BP5-207ENST00000450625 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.73■■■□□ 2.67
SH3BP5-207ENST00000450625 WIZO95785 1651 aa31.62■■■□□ 2.65
SH3BP5-207ENST00000450625 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
SH3BP5-207ENST00000450625 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.59■■■□□ 2.65
SH3BP5-207ENST00000450625 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.57■■■□□ 2.64
SH3BP5-207ENST00000450625 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.49■■■□□ 2.63
SH3BP5-207ENST00000450625 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
SH3BP5-207ENST00000450625 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.28■■■□□ 2.6
SH3BP5-207ENST00000450625 WDR62O43379 1518 aa31.19■■■□□ 2.58
SH3BP5-207ENST00000450625 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.17■■■□□ 2.58
SH3BP5-207ENST00000450625 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
SH3BP5-207ENST00000450625 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.14■■■□□ 2.57
SH3BP5-207ENST00000450625 CFTRP13569 1480 aa31.11■■■□□ 2.57
SH3BP5-207ENST00000450625 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
SH3BP5-207ENST00000450625 PRDM2Q13029 1718 aa30.86■■■□□ 2.53
SH3BP5-207ENST00000450625 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.84■■■□□ 2.53
SH3BP5-207ENST00000450625 TRIM41Q8WV44 630 aa30.73■■■□□ 2.51
SH3BP5-207ENST00000450625 OSCARQ8IYS5 282 aa30.64■■■□□ 2.5
SH3BP5-207ENST00000450625 TOPBP1Q92547 1522 aa30.54■■■□□ 2.48
SH3BP5-207ENST00000450625 IFT140Q96RY7 1462 aa30.54■■■□□ 2.48
SH3BP5-207ENST00000450625 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
SH3BP5-207ENST00000450625 ABCC8Q09428 1581 aa30.48■■■□□ 2.47
SH3BP5-207ENST00000450625 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.43■■■□□ 2.46
SH3BP5-207ENST00000450625 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
SH3BP5-207ENST00000450625 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
SH3BP5-207ENST00000450625 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.25■■■□□ 2.435e-8■■■□□ 18.8
SH3BP5-207ENST00000450625 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
SH3BP5-207ENST00000450625 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.22■■■□□ 2.43
SH3BP5-207ENST00000450625 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.22■■■□□ 2.43
SH3BP5-207ENST00000450625 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.22■■■□□ 2.43
SH3BP5-207ENST00000450625 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.15■■■□□ 2.42
SH3BP5-207ENST00000450625 CHD1O14646 1710 aa30.15■■■□□ 2.42
SH3BP5-207ENST00000450625 SOGA1O94964 1423 aa30.13■■■□□ 2.41
SH3BP5-207ENST00000450625 FBLN2P98095 1184 aa30.12■■■□□ 2.41
SH3BP5-207ENST00000450625 ARHGEF11O15085 1522 aa30.1■■■□□ 2.41
SH3BP5-207ENST00000450625 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
SH3BP5-207ENST00000450625 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.06■■■□□ 2.4
SH3BP5-207ENST00000450625 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
SH3BP5-207ENST00000450625 CUX1P39880 1505 aa30.02■■■□□ 2.4
SH3BP5-207ENST00000450625 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.95■■■□□ 2.39
SH3BP5-207ENST00000450625 WDR97A6NE52 1622 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP5-207ENST00000450625 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP5-207ENST00000450625 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
SH3BP5-207ENST00000450625 GRIN2BQ13224 1484 aa29.84■■■□□ 2.37
SH3BP5-207ENST00000450625 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
SH3BP5-207ENST00000450625 ARAP1Q96P48 1450 aa29.8■■■□□ 2.36
SH3BP5-207ENST00000450625 PBRM1Q86U86 1689 aa29.76■■■□□ 2.36
SH3BP5-207ENST00000450625 SYNJ1O43426 1573 aa29.76■■■□□ 2.35
SH3BP5-207ENST00000450625 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.75■■■□□ 2.35
SH3BP5-207ENST00000450625 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.73■■■□□ 2.35
SH3BP5-207ENST00000450625 SYNJ2O15056 1496 aa29.73■■■□□ 2.35
SH3BP5-207ENST00000450625 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.69■■■□□ 2.34
SH3BP5-207ENST00000450625 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.65■■■□□ 2.34
SH3BP5-207ENST00000450625 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
SH3BP5-207ENST00000450625 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.61■■■□□ 2.33
SH3BP5-207ENST00000450625 TOP2BQ02880 1626 aa29.55■■■□□ 2.32
SH3BP5-207ENST00000450625 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.55■■■□□ 2.32
SH3BP5-207ENST00000450625 GRIN2AQ12879 1464 aa29.45■■■□□ 2.31
SH3BP5-207ENST00000450625 ADAMTS12P58397 1594 aa29.43■■■□□ 2.3
SH3BP5-207ENST00000450625 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.36■■■□□ 2.29
SH3BP5-207ENST00000450625 CEP170Q5SW79 1584 aa29.35■■■□□ 2.29
SH3BP5-207ENST00000450625 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.32■■■□□ 2.28
SH3BP5-207ENST00000450625 NUP160Q12769 1436 aa29.32■■■□□ 2.28
SH3BP5-207ENST00000450625 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.3■■■□□ 2.28
SH3BP5-207ENST00000450625 SHROOM2Q13796 1616 aa29.2■■■□□ 2.27
SH3BP5-207ENST00000450625 JPH4Q96JJ6 628 aa29.1■■■□□ 2.25
SH3BP5-207ENST00000450625 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
SH3BP5-207ENST00000450625 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.01■■■□□ 2.23
SH3BP5-207ENST00000450625 KIF27Q86VH2 1401 aa28.99■■■□□ 2.23
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