RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450271.5

PBRM1-217, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 5

Gene PBRM1, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-217ENST00000450271 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.51■■■■■ 8.08
PBRM1-217ENST00000450271 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.61■■■■■ 6.97
PBRM1-217ENST00000450271 ABCC9O60706 1549 aa58.3■■■■■ 6.92
PBRM1-217ENST00000450271 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.63■■■■■ 6.5
PBRM1-217ENST00000450271 NACADO15069 1562 aa55.36■■■■■ 6.45
PBRM1-217ENST00000450271 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.06■■■■■ 6.4
PBRM1-217ENST00000450271 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.76■■■■■ 6.36
PBRM1-217ENST00000450271 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.46■■■■■ 6.31
PBRM1-217ENST00000450271 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.38■■■■■ 6.3
PBRM1-217ENST00000450271 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.34■■■■■ 6.29
PBRM1-217ENST00000450271 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.34■■■■■ 6.29
PBRM1-217ENST00000450271 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.16■■■■■ 6.26
PBRM1-217ENST00000450271 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.04■■■■■ 6.24
PBRM1-217ENST00000450271 SCRIBQ14160 1630 aa53.42■■■■■ 6.14
PBRM1-217ENST00000450271 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.37■■■■■ 6.13
PBRM1-217ENST00000450271 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.69■■■■■ 6.02
PBRM1-217ENST00000450271 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.68■■■■■ 6.02
PBRM1-217ENST00000450271 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.5■■■■■ 6
PBRM1-217ENST00000450271 NCAPD3P42695 1498 aa51.13■■■■■ 5.78
PBRM1-217ENST00000450271 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.02■■■■■ 5.76
PBRM1-217ENST00000450271 SMARCA4P51532 1647 aa51.02■■■■■ 5.76
PBRM1-217ENST00000450271 SMARCA2P51531 1590 aa50.86■■■■■ 5.73
PBRM1-217ENST00000450271 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.81■■■■■ 5.72
PBRM1-217ENST00000450271 HMGXB3Q12766 1538 aa50.77■■■■■ 5.72
PBRM1-217ENST00000450271 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.56■■■■■ 5.68
PBRM1-217ENST00000450271 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.51■■■■■ 5.68
PBRM1-217ENST00000450271 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.48■■■■■ 5.67
PBRM1-217ENST00000450271 ERCC6Q03468 1493 aa50.3■■■■■ 5.64
PBRM1-217ENST00000450271 NESP48681 1621 aa50.19■■■■■ 5.63
PBRM1-217ENST00000450271 CUX2O14529 1486 aa50.14■■■■■ 5.62
PBRM1-217ENST00000450271 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.89■■■■■ 5.58
PBRM1-217ENST00000450271 WIZO95785 1651 aa49.85■■■■■ 5.57
PBRM1-217ENST00000450271 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.76■■■■■ 5.56
PBRM1-217ENST00000450271 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.62■■■■■ 5.53
PBRM1-217ENST00000450271 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.6■■■■■ 5.53
PBRM1-217ENST00000450271 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.59■■■■■ 5.53
PBRM1-217ENST00000450271 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.57■■■■■ 5.53
PBRM1-217ENST00000450271 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.51■■■■■ 5.52
PBRM1-217ENST00000450271 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.28■■■■■ 5.48
PBRM1-217ENST00000450271 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.16■■■■■ 5.46
PBRM1-217ENST00000450271 CFTRP13569 1480 aa49.1■■■■■ 5.45
PBRM1-217ENST00000450271 WDR62O43379 1518 aa49.04■■■■■ 5.44
PBRM1-217ENST00000450271 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.01■■■■■ 5.44
PBRM1-217ENST00000450271 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49■■■■■ 5.44
PBRM1-217ENST00000450271 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.73■■■■■ 5.39
PBRM1-217ENST00000450271 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.59■■■■■ 5.37
PBRM1-217ENST00000450271 PRDM2Q13029 1718 aa48.54■■■■■ 5.36
PBRM1-217ENST00000450271 TOPBP1Q92547 1522 aa48.12■■■■■ 5.29
PBRM1-217ENST00000450271 IFT140Q96RY7 1462 aa48.04■■■■■ 5.28
PBRM1-217ENST00000450271 ABCC8Q09428 1581 aa48.02■■■■■ 5.28
PBRM1-217ENST00000450271 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.96■■■■■ 5.27
PBRM1-217ENST00000450271 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.94■■■■■ 5.26
PBRM1-217ENST00000450271 OSCARQ8IYS5 282 aa47.89■■■■■ 5.26
PBRM1-217ENST00000450271 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.66■■■■■ 5.22
PBRM1-217ENST00000450271 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.66■■■■■ 5.22
PBRM1-217ENST00000450271 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.65■■■■■ 5.22
PBRM1-217ENST00000450271 TRIM41Q8WV44 630 aa47.64■■■■■ 5.22
PBRM1-217ENST00000450271 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.54■■■■■ 5.2
PBRM1-217ENST00000450271 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.53■■■■■ 5.26e-6■■■■□ 23.2
PBRM1-217ENST00000450271 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.46■■■■■ 5.19
PBRM1-217ENST00000450271 SOGA1O94964 1423 aa47.42■■■■■ 5.18
PBRM1-217ENST00000450271 CUX1P39880 1505 aa47.41■■■■■ 5.18
PBRM1-217ENST00000450271 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.39■■■■■ 5.18
PBRM1-217ENST00000450271 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.29■■■■■ 5.16
PBRM1-217ENST00000450271 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.22■■■■■ 5.15
PBRM1-217ENST00000450271 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.22■■■■■ 5.15
PBRM1-217ENST00000450271 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.22■■■■■ 5.15
PBRM1-217ENST00000450271 CHD1O14646 1710 aa47.21■■■■■ 5.15
PBRM1-217ENST00000450271 WDR97A6NE52 1622 aa47.2■■■■■ 5.15
PBRM1-217ENST00000450271 ARHGEF11O15085 1522 aa47.13■■■■■ 5.14
PBRM1-217ENST00000450271 FBLN2P98095 1184 aa47.1■■■■■ 5.13
PBRM1-217ENST00000450271 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.06■■■■■ 5.12
PBRM1-217ENST00000450271 GRIN2BQ13224 1484 aa46.99■■■■■ 5.11
PBRM1-217ENST00000450271 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.96■■■■■ 5.11
PBRM1-217ENST00000450271 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.89■■■■■ 5.1
PBRM1-217ENST00000450271 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.86■■■■■ 5.09
PBRM1-217ENST00000450271 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.84■■■■■ 5.09
PBRM1-217ENST00000450271 SYNJ2O15056 1496 aa46.8■■■■■ 5.08
PBRM1-217ENST00000450271 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.77■■■■■ 5.08
PBRM1-217ENST00000450271 PBRM1Q86U86 1689 aa46.76■■■■■ 5.08
PBRM1-217ENST00000450271 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.75■■■■■ 5.07
PBRM1-217ENST00000450271 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.74■■■■■ 5.07
PBRM1-217ENST00000450271 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.74■■■■■ 5.07
PBRM1-217ENST00000450271 TOP2BQ02880 1626 aa46.72■■■■■ 5.07
PBRM1-217ENST00000450271 ARAP1Q96P48 1450 aa46.71■■■■■ 5.07
PBRM1-217ENST00000450271 SYNJ1O43426 1573 aa46.71■■■■■ 5.07
PBRM1-217ENST00000450271 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.71■■■■■ 5.07
PBRM1-217ENST00000450271 ADAMTS12P58397 1594 aa46.39■■■■■ 5.02
PBRM1-217ENST00000450271 GRIN2AQ12879 1464 aa46.38■■■■■ 5.02
PBRM1-217ENST00000450271 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.29■■■■■ 5
PBRM1-217ENST00000450271 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.29■■■■■ 5
PBRM1-217ENST00000450271 NUP160Q12769 1436 aa46.25■■■■■ 4.99
PBRM1-217ENST00000450271 CEP170Q5SW79 1584 aa46.19■■■■■ 4.99
PBRM1-217ENST00000450271 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.07■■■■■ 4.97
PBRM1-217ENST00000450271 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.03■■■■■ 4.96
PBRM1-217ENST00000450271 SHROOM2Q13796 1616 aa45.97■■■■■ 4.95
PBRM1-217ENST00000450271 KIF27Q86VH2 1401 aa45.82■■■■■ 4.93
PBRM1-217ENST00000450271 IGF1RP08069 1367 aa45.81■■■■■ 4.92
PBRM1-217ENST00000450271 JPH4Q96JJ6 628 aa45.74■■■■■ 4.91
PBRM1-217ENST00000450271 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.73■■■■■ 4.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 137.1 ms