RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449305.5

CCDC18-AS1-217, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 748 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.2■■■■□ 3.23
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.95■■■□□ 2.55
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ABCC9O60706 1549 aa29.43■■■□□ 2.3
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.16■■■□□ 2.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.09■■■□□ 2.25
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.96■■■□□ 2.23
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NACADO15069 1562 aa28.88■■■□□ 2.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.71■■■□□ 2.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.35■■■□□ 2.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SCRIBQ14160 1630 aa28.3■■■□□ 2.12
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.12■■■□□ 2.09
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.78■■■□□ 2.04
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.64■■■□□ 2.02
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.32■■□□□ 1.96
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SMARCA4P51532 1647 aa27.15■■□□□ 1.94
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.14■■□□□ 1.94
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.93
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 WIZO95785 1651 aa26.93■■□□□ 1.9
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.85■■□□□ 1.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SMARCA2P51531 1590 aa26.79■■□□□ 1.88
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.75■■□□□ 1.87
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.68■■□□□ 1.86
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NCAPD3P42695 1498 aa26.61■■□□□ 1.85
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HMGXB3Q12766 1538 aa26.57■■□□□ 1.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.44■■□□□ 1.82
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.35■■□□□ 1.81
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CFTRP13569 1480 aa25.91■■□□□ 1.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.89■■□□□ 1.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PRDM2Q13029 1718 aa25.88■■□□□ 1.73
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.82■■□□□ 1.72
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.8■■□□□ 1.72
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NESP48681 1621 aa25.72■■□□□ 1.71
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ABCC8Q09428 1581 aa25.66■■□□□ 1.7
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.6■■□□□ 1.69
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TRIM41Q8WV44 630 aa25.59■■□□□ 1.69
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.58■■□□□ 1.69
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.49■■□□□ 1.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.48■■□□□ 1.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SYNJ1O43426 1573 aa25.48■■□□□ 1.67
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TOP2BQ02880 1626 aa25.45■■□□□ 1.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.45■■□□□ 1.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CUX1P39880 1505 aa25.42■■□□□ 1.66
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.35■■□□□ 1.65
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ERCC6Q03468 1493 aa25.31■■□□□ 1.64
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TOPBP1Q92547 1522 aa25.29■■□□□ 1.64
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.27■■□□□ 1.64
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.2■■□□□ 1.62
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 WDR62O43379 1518 aa25.15■■□□□ 1.62
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SOGA1O94964 1423 aa25.09■■□□□ 1.61
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EEA1Q15075 1411 aa25.09■■□□□ 1.61
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.01■■□□□ 1.59
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.01■■□□□ 1.59
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.99■■□□□ 1.59
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 WDR97A6NE52 1622 aa24.97■■□□□ 1.59
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIF27Q86VH2 1401 aa24.97■■□□□ 1.59
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CUX2O14529 1486 aa24.96■■□□□ 1.59
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IFT140Q96RY7 1462 aa24.91■■□□□ 1.58
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.83■■□□□ 1.56
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.77■■□□□ 1.56
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIF21BO75037 1637 aa24.77■■□□□ 1.56
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.76■■□□□ 1.55
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IGF1RP08069 1367 aa24.75■■□□□ 1.55
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PBRM1Q86U86 1689 aa24.72■■□□□ 1.55
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.71■■□□□ 1.55
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PRXQ9BXM0 1461 aa24.7■■□□□ 1.54
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CUL7Q14999 1698 aa24.69■■□□□ 1.54
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GOLGA3Q08378 1498 aa24.69■■□□□ 1.54
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.65■■□□□ 1.54
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GRIN2BQ13224 1484 aa24.64■■□□□ 1.54
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.64■■□□□ 1.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.61■■□□□ 1.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.54■■□□□ 1.52
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ADAMTS12P58397 1594 aa24.53■■□□□ 1.52
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.52■■□□□ 1.52
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.5■■□□□ 1.51
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SYNJ2O15056 1496 aa24.38■■□□□ 1.49
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.37■■□□□ 1.49
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CEP162Q5TB80 1403 aa24.35■■□□□ 1.49
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GRIN2AQ12879 1464 aa24.33■■□□□ 1.49
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CLIP1P30622 1438 aa24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms