RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449305.5

CCDC18-AS1-217, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 748 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CHD1O14646 1710 aa24.25■■□□□ 1.47
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CEP170Q5SW79 1584 aa24.18■■□□□ 1.46
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NUP160Q12769 1436 aa24.18■■□□□ 1.46
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.17■■□□□ 1.46
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.94■■□□□ 1.42
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MAP3K1Q13233 1512 aa23.69■■□□□ 1.38
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.39■■□□□ 1.34
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.39■■□□□ 1.33
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.15■■□□□ 1.3
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.15■■□□□ 1.3
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MIA2Q96PC5 1412 aa23.11■■□□□ 1.29
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ASXL2Q76L83 1435 aa23.1■■□□□ 1.29
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.1■■□□□ 1.29
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.08■■□□□ 1.29
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.28
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KCNH8Q96L42 1107 aa23.07■■□□□ 1.28
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.05■■□□□ 1.28
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MAPKBP1O60336 1514 aa23.04■■□□□ 1.28
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.04■■□□□ 1.28
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PREX2Q70Z35 1606 aa23.03■■□□□ 1.28
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.01■■□□□ 1.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23■■□□□ 1.27
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