RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448732.1

R3HDM2-208, Transcript of R3H domain containing 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene R3HDM2, Length 195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM2-208ENST00000448732 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.06■■■■■ 6.88
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R3HDM2-208ENST00000448732 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.42■■■■■ 5.5
R3HDM2-208ENST00000448732 NACADO15069 1562 aa49.15■■■■■ 5.46
R3HDM2-208ENST00000448732 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.94■■■■■ 5.43
R3HDM2-208ENST00000448732 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.57■■■■■ 5.37
R3HDM2-208ENST00000448732 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.56■■■■■ 5.36
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R3HDM2-208ENST00000448732 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.27■■■■■ 5.32
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R3HDM2-208ENST00000448732 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.99■■■■■ 5.27
R3HDM2-208ENST00000448732 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.99■■■■■ 5.27
R3HDM2-208ENST00000448732 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.38■■■■■ 5.17
R3HDM2-208ENST00000448732 SCRIBQ14160 1630 aa47.34■■■■■ 5.17
R3HDM2-208ENST00000448732 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.84■■■■■ 5.09
R3HDM2-208ENST00000448732 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.78■■■■■ 5.08
R3HDM2-208ENST00000448732 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.7■■■■■ 5.07
R3HDM2-208ENST00000448732 NCAPD3P42695 1498 aa45.41■■■■■ 4.86
R3HDM2-208ENST00000448732 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.26■■■■■ 4.84
R3HDM2-208ENST00000448732 SMARCA4P51532 1647 aa45.22■■■■■ 4.83
R3HDM2-208ENST00000448732 SMARCA2P51531 1590 aa45.13■■■■■ 4.82
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R3HDM2-208ENST00000448732 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.82■■■■■ 4.76
R3HDM2-208ENST00000448732 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.8■■■■■ 4.76
R3HDM2-208ENST00000448732 ERCC6Q03468 1493 aa44.73■■■■■ 4.75
R3HDM2-208ENST00000448732 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.72■■■■■ 4.75
R3HDM2-208ENST00000448732 CUX2O14529 1486 aa44.64■■■■■ 4.74
R3HDM2-208ENST00000448732 NESP48681 1621 aa44.58■■■■■ 4.73
R3HDM2-208ENST00000448732 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.5■■■■■ 4.71
R3HDM2-208ENST00000448732 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.31■■■■■ 4.68
R3HDM2-208ENST00000448732 WIZO95785 1651 aa44.17■■■■■ 4.66
R3HDM2-208ENST00000448732 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.08■■■■■ 4.65
R3HDM2-208ENST00000448732 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.07■■■■■ 4.65
R3HDM2-208ENST00000448732 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.03■■■■■ 4.64
R3HDM2-208ENST00000448732 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.97■■■■■ 4.63
R3HDM2-208ENST00000448732 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.89■■■■■ 4.62
R3HDM2-208ENST00000448732 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.65■■■■■ 4.58
R3HDM2-208ENST00000448732 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.63■■■■■ 4.58
R3HDM2-208ENST00000448732 CFTRP13569 1480 aa43.55■■■■■ 4.56
R3HDM2-208ENST00000448732 WDR62O43379 1518 aa43.53■■■■■ 4.56
R3HDM2-208ENST00000448732 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.51■■■■■ 4.56
R3HDM2-208ENST00000448732 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.49■■■■■ 4.55
R3HDM2-208ENST00000448732 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.18■■■■■ 4.5
R3HDM2-208ENST00000448732 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
R3HDM2-208ENST00000448732 PRDM2Q13029 1718 aa43.05■■■■■ 4.48
R3HDM2-208ENST00000448732 OSCARQ8IYS5 282 aa42.69■■■■■ 4.42
R3HDM2-208ENST00000448732 TOPBP1Q92547 1522 aa42.68■■■■■ 4.42
R3HDM2-208ENST00000448732 IFT140Q96RY7 1462 aa42.66■■■■■ 4.42
R3HDM2-208ENST00000448732 ABCC8Q09428 1581 aa42.65■■■■■ 4.42
R3HDM2-208ENST00000448732 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
R3HDM2-208ENST00000448732 TRIM41Q8WV44 630 aa42.53■■■■■ 4.4
R3HDM2-208ENST00000448732 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.52■■■■■ 4.4
R3HDM2-208ENST00000448732 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.29■■■■■ 4.36
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R3HDM2-208ENST00000448732 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.25■■■■■ 4.35
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R3HDM2-208ENST00000448732 SOGA1O94964 1423 aa42.11■■■■■ 4.33
R3HDM2-208ENST00000448732 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.1■■■■■ 4.33
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R3HDM2-208ENST00000448732 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.02■■■■■ 4.32
R3HDM2-208ENST00000448732 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.02■■■■■ 4.32
R3HDM2-208ENST00000448732 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.02■■■■■ 4.32
R3HDM2-208ENST00000448732 CUX1P39880 1505 aa42■■■■■ 4.31
R3HDM2-208ENST00000448732 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42■■■■■ 4.31
R3HDM2-208ENST00000448732 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
R3HDM2-208ENST00000448732 CHD1O14646 1710 aa41.94■■■■■ 4.3
R3HDM2-208ENST00000448732 ARHGEF11O15085 1522 aa41.91■■■■■ 4.3
R3HDM2-208ENST00000448732 FBLN2P98095 1184 aa41.89■■■■■ 4.3
R3HDM2-208ENST00000448732 WDR97A6NE52 1622 aa41.88■■■■■ 4.3
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R3HDM2-208ENST00000448732 GRIN2BQ13224 1484 aa41.7■■■■■ 4.27
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R3HDM2-208ENST00000448732 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.65■■■■■ 4.26
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R3HDM2-208ENST00000448732 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.56■■■■■ 4.24
R3HDM2-208ENST00000448732 SYNJ2O15056 1496 aa41.53■■■■■ 4.24
R3HDM2-208ENST00000448732 ARAP1Q96P48 1450 aa41.52■■■■■ 4.24
R3HDM2-208ENST00000448732 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.5■■■■■ 4.23
R3HDM2-208ENST00000448732 SYNJ1O43426 1573 aa41.49■■■■■ 4.23
R3HDM2-208ENST00000448732 PBRM1Q86U86 1689 aa41.49■■■■■ 4.23
R3HDM2-208ENST00000448732 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.45■■■■■ 4.23
R3HDM2-208ENST00000448732 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.44■■■■■ 4.22
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R3HDM2-208ENST00000448732 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.04■■■■■ 4.16
R3HDM2-208ENST00000448732 NUP160Q12769 1436 aa41.02■■■■■ 4.16
R3HDM2-208ENST00000448732 CEP170Q5SW79 1584 aa40.97■■■■■ 4.15
R3HDM2-208ENST00000448732 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.86■■■■■ 4.13
R3HDM2-208ENST00000448732 SHROOM2Q13796 1616 aa40.8■■■■■ 4.12
R3HDM2-208ENST00000448732 JPH4Q96JJ6 628 aa40.66■■■■■ 4.1
R3HDM2-208ENST00000448732 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
R3HDM2-208ENST00000448732 IGF1RP08069 1367 aa40.61■■■■■ 4.09
R3HDM2-208ENST00000448732 KIF27Q86VH2 1401 aa40.59■■■■■ 4.09
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