RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442948.3

FOLR3-201, Transcript of folate receptor 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene FOLR3, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR3-201ENST00000442948 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.66■■■■■ 4.1
FOLR3-201ENST00000442948 ABCC9O60706 1549 aa36.85■■■■□ 3.49
FOLR3-201ENST00000442948 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.33■■■■□ 3.41
FOLR3-201ENST00000442948 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.93■■■■□ 3.18
FOLR3-201ENST00000442948 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.78■■■■□ 3.16
FOLR3-201ENST00000442948 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.67■■■■□ 3.14
FOLR3-201ENST00000442948 NACADO15069 1562 aa34.5■■■■□ 3.11
FOLR3-201ENST00000442948 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.43■■■■□ 3.1
FOLR3-201ENST00000442948 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.93■■■■□ 3.02
FOLR3-201ENST00000442948 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.92■■■■□ 3.02
FOLR3-201ENST00000442948 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.89■■■■□ 3.02
FOLR3-201ENST00000442948 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
FOLR3-201ENST00000442948 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.45■■■□□ 2.95
FOLR3-201ENST00000442948 SCRIBQ14160 1630 aa33.3■■■□□ 2.92
FOLR3-201ENST00000442948 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.2■■■□□ 2.91
FOLR3-201ENST00000442948 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.16■■■□□ 2.9
FOLR3-201ENST00000442948 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.15■■■□□ 2.9
FOLR3-201ENST00000442948 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.03■■■□□ 2.88
FOLR3-201ENST00000442948 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.07■■■□□ 2.72
FOLR3-201ENST00000442948 NCAPD3P42695 1498 aa31.97■■■□□ 2.71
FOLR3-201ENST00000442948 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.88■■■□□ 2.69
FOLR3-201ENST00000442948 ERCC6Q03468 1493 aa31.73■■■□□ 2.67
FOLR3-201ENST00000442948 SMARCA4P51532 1647 aa31.69■■■□□ 2.66
FOLR3-201ENST00000442948 CUX2O14529 1486 aa31.66■■■□□ 2.66
FOLR3-201ENST00000442948 SMARCA2P51531 1590 aa31.64■■■□□ 2.65
FOLR3-201ENST00000442948 NESP48681 1621 aa31.63■■■□□ 2.65
FOLR3-201ENST00000442948 HMGXB3Q12766 1538 aa31.59■■■□□ 2.65
FOLR3-201ENST00000442948 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
FOLR3-201ENST00000442948 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
FOLR3-201ENST00000442948 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.4■■■□□ 2.62
FOLR3-201ENST00000442948 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.33■■■□□ 2.61
FOLR3-201ENST00000442948 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.15■■■□□ 2.58
FOLR3-201ENST00000442948 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
FOLR3-201ENST00000442948 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.08■■■□□ 2.57
FOLR3-201ENST00000442948 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.04■■■□□ 2.56
FOLR3-201ENST00000442948 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31■■■□□ 2.55
FOLR3-201ENST00000442948 WIZO95785 1651 aa30.94■■■□□ 2.54
FOLR3-201ENST00000442948 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.82■■■□□ 2.52
FOLR3-201ENST00000442948 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
FOLR3-201ENST00000442948 WDR62O43379 1518 aa30.69■■■□□ 2.5
FOLR3-201ENST00000442948 TRIM41Q8WV44 630 aa30.66■■■□□ 2.5
FOLR3-201ENST00000442948 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.65■■■□□ 2.5
FOLR3-201ENST00000442948 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.64■■■□□ 2.5
FOLR3-201ENST00000442948 CFTRP13569 1480 aa30.59■■■□□ 2.49
FOLR3-201ENST00000442948 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
FOLR3-201ENST00000442948 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
FOLR3-201ENST00000442948 OSCARQ8IYS5 282 aa30.37■■■□□ 2.45
FOLR3-201ENST00000442948 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.28■■■□□ 2.44
FOLR3-201ENST00000442948 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
FOLR3-201ENST00000442948 IFT140Q96RY7 1462 aa30.05■■■□□ 2.4
FOLR3-201ENST00000442948 TOPBP1Q92547 1522 aa30.04■■■□□ 2.4
FOLR3-201ENST00000442948 PRDM2Q13029 1718 aa29.95■■■□□ 2.38
FOLR3-201ENST00000442948 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.87■■■□□ 2.37
FOLR3-201ENST00000442948 ABCC8Q09428 1581 aa29.86■■■□□ 2.37
FOLR3-201ENST00000442948 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.85■■■□□ 2.37
FOLR3-201ENST00000442948 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.85■■■□□ 2.37
FOLR3-201ENST00000442948 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.85■■■□□ 2.37
FOLR3-201ENST00000442948 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.83■■■□□ 2.37
FOLR3-201ENST00000442948 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
FOLR3-201ENST00000442948 ARHGEF11O15085 1522 aa29.77■■■□□ 2.36
FOLR3-201ENST00000442948 FBLN2P98095 1184 aa29.77■■■□□ 2.36
FOLR3-201ENST00000442948 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.75■■■□□ 2.35
FOLR3-201ENST00000442948 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
FOLR3-201ENST00000442948 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
FOLR3-201ENST00000442948 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.73■■■□□ 2.35
FOLR3-201ENST00000442948 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
FOLR3-201ENST00000442948 SOGA1O94964 1423 aa29.65■■■□□ 2.34
FOLR3-201ENST00000442948 CHD1O14646 1710 aa29.56■■■□□ 2.32
FOLR3-201ENST00000442948 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.52■■■□□ 2.32
FOLR3-201ENST00000442948 ARAP1Q96P48 1450 aa29.51■■■□□ 2.31
FOLR3-201ENST00000442948 CUX1P39880 1505 aa29.48■■■□□ 2.31
FOLR3-201ENST00000442948 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.47■■■□□ 2.31
FOLR3-201ENST00000442948 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
FOLR3-201ENST00000442948 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
FOLR3-201ENST00000442948 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
FOLR3-201ENST00000442948 GRIN2BQ13224 1484 aa29.33■■■□□ 2.29
FOLR3-201ENST00000442948 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.3■■■□□ 2.28
FOLR3-201ENST00000442948 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
FOLR3-201ENST00000442948 SYNJ2O15056 1496 aa29.24■■■□□ 2.27
FOLR3-201ENST00000442948 WDR97A6NE52 1622 aa29.23■■■□□ 2.27
FOLR3-201ENST00000442948 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.23■■■□□ 2.27
FOLR3-201ENST00000442948 SYNJ1O43426 1573 aa29.2■■■□□ 2.26
FOLR3-201ENST00000442948 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.14■■■□□ 2.25
FOLR3-201ENST00000442948 PBRM1Q86U86 1689 aa29.04■■■□□ 2.24
FOLR3-201ENST00000442948 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.04■■■□□ 2.24
FOLR3-201ENST00000442948 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.02■■■□□ 2.24
FOLR3-201ENST00000442948 GRIN2AQ12879 1464 aa28.95■■■□□ 2.22
FOLR3-201ENST00000442948 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.95■■■□□ 2.22
FOLR3-201ENST00000442948 NUP160Q12769 1436 aa28.87■■■□□ 2.21
FOLR3-201ENST00000442948 CEP170Q5SW79 1584 aa28.85■■■□□ 2.21
FOLR3-201ENST00000442948 TOP2BQ02880 1626 aa28.85■■■□□ 2.21
FOLR3-201ENST00000442948 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.85■■■□□ 2.21
FOLR3-201ENST00000442948 ADAMTS12P58397 1594 aa28.84■■■□□ 2.21
FOLR3-201ENST00000442948 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.8■■■□□ 2.2
FOLR3-201ENST00000442948 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.71■■■□□ 2.19
FOLR3-201ENST00000442948 JPH4Q96JJ6 628 aa28.71■■■□□ 2.19
FOLR3-201ENST00000442948 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
FOLR3-201ENST00000442948 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
FOLR3-201ENST00000442948 SHROOM2Q13796 1616 aa28.66■■■□□ 2.18
FOLR3-201ENST00000442948 IGF1RP08069 1367 aa28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.2 ms