RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442037.5

H19-211, H19, imprinted maternally expressed transcript, humanhuman

TSL 3

Gene H19, Length 798 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H19-211ENST00000442037 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41■■■■■ 4.15
H19-211ENST00000442037 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.57■■■■□ 3.44
H19-211ENST00000442037 ABCC9O60706 1549 aa35.82■■■■□ 3.32
H19-211ENST00000442037 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.46■■■■□ 3.11
H19-211ENST00000442037 NACADO15069 1562 aa34.39■■■■□ 3.1
H19-211ENST00000442037 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.26■■■■□ 3.08
H19-211ENST00000442037 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.15■■■■□ 3.06
H19-211ENST00000442037 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
H19-211ENST00000442037 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.95■■■■□ 3.03
H19-211ENST00000442037 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.7■■■□□ 2.99
H19-211ENST00000442037 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.42■■■□□ 2.94
H19-211ENST00000442037 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.38■■■□□ 2.93
H19-211ENST00000442037 SCRIBQ14160 1630 aa33.28■■■□□ 2.92
H19-211ENST00000442037 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.08■■■□□ 2.89
H19-211ENST00000442037 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.97■■■□□ 2.87
H19-211ENST00000442037 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
H19-211ENST00000442037 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.43■■■□□ 2.78
H19-211ENST00000442037 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.22■■■□□ 2.75
H19-211ENST00000442037 SMARCA4P51532 1647 aa31.86■■■□□ 2.69
H19-211ENST00000442037 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
H19-211ENST00000442037 NCAPD3P42695 1498 aa31.71■■■□□ 2.67
H19-211ENST00000442037 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.7■■■□□ 2.66
H19-211ENST00000442037 SMARCA2P51531 1590 aa31.68■■■□□ 2.66
H19-211ENST00000442037 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.57■■■□□ 2.64
H19-211ENST00000442037 HMGXB3Q12766 1538 aa31.56■■■□□ 2.64
H19-211ENST00000442037 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.56■■■□□ 2.64
H19-211ENST00000442037 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
H19-211ENST00000442037 WIZO95785 1651 aa31.25■■■□□ 2.59
H19-211ENST00000442037 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
H19-211ENST00000442037 NESP48681 1621 aa30.95■■■□□ 2.54
H19-211ENST00000442037 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.92■■■□□ 2.54
H19-211ENST00000442037 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
H19-211ENST00000442037 ERCC6Q03468 1493 aa30.9■■■□□ 2.54
H19-211ENST00000442037 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.77■■■□□ 2.52
H19-211ENST00000442037 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.7■■■□□ 2.5
H19-211ENST00000442037 CUX2O14529 1486 aa30.65■■■□□ 2.5
H19-211ENST00000442037 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.64■■■□□ 2.5
H19-211ENST00000442037 CFTRP13569 1480 aa30.56■■■□□ 2.48
H19-211ENST00000442037 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
H19-211ENST00000442037 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.53■■■□□ 2.48
H19-211ENST00000442037 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.42■■■□□ 2.46
H19-211ENST00000442037 PRDM2Q13029 1718 aa30.41■■■□□ 2.46
H19-211ENST00000442037 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.4■■■□□ 2.46
H19-211ENST00000442037 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.38■■■□□ 2.45
H19-211ENST00000442037 WDR62O43379 1518 aa30.29■■■□□ 2.44
H19-211ENST00000442037 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
H19-211ENST00000442037 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
H19-211ENST00000442037 ABCC8Q09428 1581 aa29.95■■■□□ 2.39
H19-211ENST00000442037 TOPBP1Q92547 1522 aa29.92■■■□□ 2.38
H19-211ENST00000442037 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.89■■■□□ 2.38
H19-211ENST00000442037 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.84■■■□□ 2.37
H19-211ENST00000442037 IFT140Q96RY7 1462 aa29.78■■■□□ 2.36
H19-211ENST00000442037 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
H19-211ENST00000442037 CUX1P39880 1505 aa29.63■■■□□ 2.33
H19-211ENST00000442037 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
H19-211ENST00000442037 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
H19-211ENST00000442037 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.56■■■□□ 2.32
H19-211ENST00000442037 SOGA1O94964 1423 aa29.53■■■□□ 2.32
H19-211ENST00000442037 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
H19-211ENST00000442037 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.5■■■□□ 2.31
H19-211ENST00000442037 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.43■■■□□ 2.3
H19-211ENST00000442037 WDR97A6NE52 1622 aa29.42■■■□□ 2.3
H19-211ENST00000442037 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.4■■■□□ 2.3
H19-211ENST00000442037 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.38■■■□□ 2.29
H19-211ENST00000442037 TOP2BQ02880 1626 aa29.38■■■□□ 2.29
H19-211ENST00000442037 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
H19-211ENST00000442037 OSCARQ8IYS5 282 aa29.34■■■□□ 2.29
H19-211ENST00000442037 SYNJ1O43426 1573 aa29.32■■■□□ 2.28
H19-211ENST00000442037 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.29■■■□□ 2.28
H19-211ENST00000442037 GRIN2BQ13224 1484 aa29.22■■■□□ 2.27
H19-211ENST00000442037 CHD1O14646 1710 aa29.21■■■□□ 2.27
H19-211ENST00000442037 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.19■■■□□ 2.26
H19-211ENST00000442037 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.19■■■□□ 2.26
H19-211ENST00000442037 PBRM1Q86U86 1689 aa29.18■■■□□ 2.26
H19-211ENST00000442037 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.17■■■□□ 2.26
H19-211ENST00000442037 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
H19-211ENST00000442037 FBLN2P98095 1184 aa29.11■■■□□ 2.25
H19-211ENST00000442037 SYNJ2O15056 1496 aa29.04■■■□□ 2.24
H19-211ENST00000442037 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
H19-211ENST00000442037 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.94■■■□□ 2.22
H19-211ENST00000442037 ADAMTS12P58397 1594 aa28.91■■■□□ 2.22
H19-211ENST00000442037 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.9■■■□□ 2.22
H19-211ENST00000442037 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.9■■■□□ 2.22
H19-211ENST00000442037 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.9■■■□□ 2.22
H19-211ENST00000442037 ARHGEF11O15085 1522 aa28.86■■■□□ 2.21
H19-211ENST00000442037 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.86■■■□□ 2.21
H19-211ENST00000442037 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.86■■■□□ 2.21
H19-211ENST00000442037 GRIN2AQ12879 1464 aa28.83■■■□□ 2.21
H19-211ENST00000442037 KIF27Q86VH2 1401 aa28.81■■■□□ 2.2
H19-211ENST00000442037 TRIM41Q8WV44 630 aa28.77■■■□□ 2.2
H19-211ENST00000442037 NUP160Q12769 1436 aa28.7■■■□□ 2.19
H19-211ENST00000442037 IGF1RP08069 1367 aa28.69■■■□□ 2.18
H19-211ENST00000442037 CEP170Q5SW79 1584 aa28.68■■■□□ 2.18
H19-211ENST00000442037 CUL7Q14999 1698 aa28.67■■■□□ 2.18
H19-211ENST00000442037 ARAP1Q96P48 1450 aa28.61■■■□□ 2.17
H19-211ENST00000442037 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.58■■■□□ 2.17
H19-211ENST00000442037 SHROOM2Q13796 1616 aa28.53■■■□□ 2.16
H19-211ENST00000442037 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.52■■■□□ 2.16
H19-211ENST00000442037 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.48■■■□□ 2.15
H19-211ENST00000442037 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.41■■■□□ 2.14
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