RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441796.1

CRAT-204, Transcript of carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

TSL 5

Gene CRAT, Length 831 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAT-204ENST00000441796 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.94■■■■■ 6.55
CRAT-204ENST00000441796 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.74■■■■■ 5.55
CRAT-204ENST00000441796 ABCC9O60706 1549 aa48.92■■■■■ 5.42
CRAT-204ENST00000441796 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.96■■■■■ 5.11
CRAT-204ENST00000441796 NACADO15069 1562 aa46.9■■■■■ 5.1
CRAT-204ENST00000441796 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.82■■■■■ 5.09
CRAT-204ENST00000441796 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.62■■■■■ 5.05
CRAT-204ENST00000441796 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.56■■■■■ 5.04
CRAT-204ENST00000441796 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.32■■■■■ 5.01
CRAT-204ENST00000441796 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.72■■■■■ 4.91
CRAT-204ENST00000441796 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.72■■■■■ 4.91
CRAT-204ENST00000441796 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.54■■■■■ 4.88
CRAT-204ENST00000441796 SCRIBQ14160 1630 aa45.34■■■■■ 4.85
CRAT-204ENST00000441796 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.16■■■■■ 4.82
CRAT-204ENST00000441796 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.14■■■■■ 4.82
CRAT-204ENST00000441796 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.36■■■■■ 4.69
CRAT-204ENST00000441796 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.21■■■■■ 4.67
CRAT-204ENST00000441796 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.02■■■■■ 4.64
CRAT-204ENST00000441796 SMARCA4P51532 1647 aa43.39■■■■■ 4.54
CRAT-204ENST00000441796 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.36■■■■■ 4.53
CRAT-204ENST00000441796 NCAPD3P42695 1498 aa43.33■■■■■ 4.53
CRAT-204ENST00000441796 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.29■■■■■ 4.52
CRAT-204ENST00000441796 SMARCA2P51531 1590 aa43.2■■■■■ 4.51
CRAT-204ENST00000441796 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.08■■■■■ 4.49
CRAT-204ENST00000441796 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.03■■■■■ 4.48
CRAT-204ENST00000441796 HMGXB3Q12766 1538 aa43.03■■■■■ 4.48
CRAT-204ENST00000441796 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.88■■■■■ 4.46
CRAT-204ENST00000441796 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
CRAT-204ENST00000441796 WIZO95785 1651 aa42.54■■■■■ 4.4
CRAT-204ENST00000441796 NESP48681 1621 aa42.26■■■■■ 4.36
CRAT-204ENST00000441796 ERCC6Q03468 1493 aa42.19■■■■■ 4.34
CRAT-204ENST00000441796 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.14■■■■■ 4.34
CRAT-204ENST00000441796 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
CRAT-204ENST00000441796 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.06■■■■■ 4.32
CRAT-204ENST00000441796 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.94■■■■■ 4.3
CRAT-204ENST00000441796 CUX2O14529 1486 aa41.86■■■■■ 4.29
CRAT-204ENST00000441796 CFTRP13569 1480 aa41.75■■■■■ 4.27
CRAT-204ENST00000441796 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.68■■■■■ 4.26
CRAT-204ENST00000441796 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.64■■■■■ 4.26
CRAT-204ENST00000441796 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.26
CRAT-204ENST00000441796 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.53■■■■■ 4.24
CRAT-204ENST00000441796 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.48■■■■■ 4.23
CRAT-204ENST00000441796 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.47■■■■■ 4.23
CRAT-204ENST00000441796 WDR62O43379 1518 aa41.33■■■■■ 4.21
CRAT-204ENST00000441796 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
CRAT-204ENST00000441796 PRDM2Q13029 1718 aa41.18■■■■■ 4.18
CRAT-204ENST00000441796 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
CRAT-204ENST00000441796 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.88■■■■■ 4.13
CRAT-204ENST00000441796 ABCC8Q09428 1581 aa40.86■■■■■ 4.13
CRAT-204ENST00000441796 TOPBP1Q92547 1522 aa40.83■■■■■ 4.13
CRAT-204ENST00000441796 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.74■■■■■ 4.11
CRAT-204ENST00000441796 IFT140Q96RY7 1462 aa40.66■■■■■ 4.1
CRAT-204ENST00000441796 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
CRAT-204ENST00000441796 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
CRAT-204ENST00000441796 CUX1P39880 1505 aa40.42■■■■■ 4.06
CRAT-204ENST00000441796 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
CRAT-204ENST00000441796 SOGA1O94964 1423 aa40.34■■■■■ 4.05
CRAT-204ENST00000441796 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.32■■■■■ 4.05
CRAT-204ENST00000441796 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.29■■■■■ 4.04
CRAT-204ENST00000441796 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
CRAT-204ENST00000441796 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.21■■■■■ 4.03
CRAT-204ENST00000441796 OSCARQ8IYS5 282 aa40.14■■■■■ 4.02
CRAT-204ENST00000441796 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.14■■■■■ 4.02
CRAT-204ENST00000441796 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
CRAT-204ENST00000441796 WDR97A6NE52 1622 aa40.06■■■■■ 4
CRAT-204ENST00000441796 TOP2BQ02880 1626 aa40.01■■■■■ 4
CRAT-204ENST00000441796 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.97■■■■□ 3.99
CRAT-204ENST00000441796 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.96■■■■□ 3.99
CRAT-204ENST00000441796 SYNJ1O43426 1573 aa39.96■■■■□ 3.99
CRAT-204ENST00000441796 GRIN2BQ13224 1484 aa39.88■■■■□ 3.98
CRAT-204ENST00000441796 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.84■■■■□ 3.97
CRAT-204ENST00000441796 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.81■■■■□ 3.96
CRAT-204ENST00000441796 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.79■■■■□ 3.96
CRAT-204ENST00000441796 FBLN2P98095 1184 aa39.78■■■■□ 3.96
CRAT-204ENST00000441796 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.75■■■■□ 3.95
CRAT-204ENST00000441796 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.68■■■■□ 3.94
CRAT-204ENST00000441796 CHD1O14646 1710 aa39.67■■■■□ 3.94
CRAT-204ENST00000441796 SYNJ2O15056 1496 aa39.64■■■■□ 3.94
CRAT-204ENST00000441796 PBRM1Q86U86 1689 aa39.61■■■■□ 3.93
CRAT-204ENST00000441796 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.47■■■■□ 3.91
CRAT-204ENST00000441796 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.4■■■■□ 3.9
CRAT-204ENST00000441796 ARHGEF11O15085 1522 aa39.4■■■■□ 3.9
CRAT-204ENST00000441796 ADAMTS12P58397 1594 aa39.38■■■■□ 3.9
CRAT-204ENST00000441796 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.37■■■■□ 3.89
CRAT-204ENST00000441796 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.37■■■■□ 3.89
CRAT-204ENST00000441796 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.37■■■■□ 3.89
CRAT-204ENST00000441796 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.37■■■■□ 3.89
CRAT-204ENST00000441796 TRIM41Q8WV44 630 aa39.36■■■■□ 3.89
CRAT-204ENST00000441796 GRIN2AQ12879 1464 aa39.34■■■■□ 3.89
CRAT-204ENST00000441796 KIF27Q86VH2 1401 aa39.32■■■■□ 3.89
CRAT-204ENST00000441796 IGF1RP08069 1367 aa39.22■■■■□ 3.87
CRAT-204ENST00000441796 NUP160Q12769 1436 aa39.22■■■■□ 3.87
CRAT-204ENST00000441796 CEP170Q5SW79 1584 aa39.12■■■■□ 3.85
CRAT-204ENST00000441796 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.1■■■■□ 3.85
CRAT-204ENST00000441796 ARAP1Q96P48 1450 aa39.09■■■■□ 3.85
CRAT-204ENST00000441796 CUL7Q14999 1698 aa39■■■■□ 3.83
CRAT-204ENST00000441796 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.96■■■■□ 3.83
CRAT-204ENST00000441796 SHROOM2Q13796 1616 aa38.86■■■■□ 3.81
CRAT-204ENST00000441796 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.85■■■■□ 3.81
CRAT-204ENST00000441796 JPH4Q96JJ6 628 aa38.85■■■■□ 3.81
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