RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440194.1

FOXP4-AS1-204, FOXP4 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene FOXP4-AS1, Length 196 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.44■■□□□ 1.02
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa18.99■□□□□ 0.63
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 ABCC9O60706 1549 aa18.81■□□□□ 0.6
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.17■□□□□ 0.5
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.95■□□□□ 0.46
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 NACADO15069 1562 aa17.87■□□□□ 0.45
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.65■□□□□ 0.42
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.63■□□□□ 0.41
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.61■□□□□ 0.41
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.55■□□□□ 0.4
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 SCRIBQ14160 1630 aa17.52■□□□□ 0.4
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.41■□□□□ 0.38
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.28■□□□□ 0.36
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.18■□□□□ 0.34
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.93■□□□□ 0.3
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.84■□□□□ 0.29
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 SMARCA4P51532 1647 aa16.65■□□□□ 0.26
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.59■□□□□ 0.25
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.56■□□□□ 0.24
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 NCAPD3P42695 1498 aa16.5■□□□□ 0.23
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 SMARCA2P51531 1590 aa16.5■□□□□ 0.23
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 WIZO95785 1651 aa16.42■□□□□ 0.22
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 HMGXB3Q12766 1538 aa16.41■□□□□ 0.22
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.38■□□□□ 0.21
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 NESP48681 1621 aa16.27■□□□□ 0.19
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 ERCC6Q03468 1493 aa16.19■□□□□ 0.18
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.08■□□□□ 0.16
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.07■□□□□ 0.16
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.03■□□□□ 0.16
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.02■□□□□ 0.16
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.01■□□□□ 0.15
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 CFTRP13569 1480 aa15.94■□□□□ 0.14
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.92■□□□□ 0.14
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 CUX2O14529 1486 aa15.9■□□□□ 0.14
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.9■□□□□ 0.14
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.87■□□□□ 0.13
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 PRDM2Q13029 1718 aa15.79■□□□□ 0.12
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 WDR62O43379 1518 aa15.78■□□□□ 0.12
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 TOPBP1Q92547 1522 aa15.65■□□□□ 0.1
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.61■□□□□ 0.09
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 ABCC8Q09428 1581 aa15.56■□□□□ 0.08
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 CUX1P39880 1505 aa15.55■□□□□ 0.08
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 IFT140Q96RY7 1462 aa15.52■□□□□ 0.08
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.52■□□□□ 0.08
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.51■□□□□ 0.07
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 SOGA1O94964 1423 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.43■□□□□ 0.06
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 SYNJ1O43426 1573 aa15.43■□□□□ 0.06
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 FBLN2P98095 1184 aa15.38■□□□□ 0.05
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 TOP2BQ02880 1626 aa15.36■□□□□ 0.05
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.35■□□□□ 0.05
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 OSCARQ8IYS5 282 aa15.31■□□□□ 0.04
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.31■□□□□ 0.04
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 WDR97A6NE52 1622 aa15.31■□□□□ 0.04
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.28■□□□□ 0.04
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.28■□□□□ 0.04
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 GRIN2BQ13224 1484 aa15.27■□□□□ 0.03
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 CHD1O14646 1710 aa15.26■□□□□ 0.03
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 PBRM1Q86U86 1689 aa15.25■□□□□ 0.03
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.24■□□□□ 0.03
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 TRIM41Q8WV44 630 aa15.18■□□□□ 0.02
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 SYNJ2O15056 1496 aa15.16■□□□□ 0.02
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 ADAMTS12P58397 1594 aa15.12■□□□□ 0.01
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 KIF27Q86VH2 1401 aa15.1■□□□□ 0.01
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 GRIN2AQ12879 1464 aa15.08■□□□□ 0.01
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.08■□□□□ 0.01
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.08■□□□□ 0
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.08■□□□□ 0
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.08■□□□□ 0
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.08■□□□□ 0
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 ARHGEF11O15085 1522 aa15.07■□□□□ 0
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.06■□□□□ 0
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.04■□□□□ -0
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 IGF1RP08069 1367 aa15.04■□□□□ -0
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 CEP170Q5SW79 1584 aa15.03■□□□□ -0
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.02■□□□□ -0
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.98□□□□□ -0.01
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 NUP160Q12769 1436 aa14.97□□□□□ -0.01
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 CUL7Q14999 1698 aa14.96□□□□□ -0.01
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 ARAP1Q96P48 1450 aa14.95□□□□□ -0.02
FOXP4-AS1-204ENST00000440194 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms