RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

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Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.76■■■■□ 3.63
ACTBP11-201ENST00000436287 ABCC9O60706 1549 aa34.26■■■■□ 3.08
ACTBP11-201ENST00000436287 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.87■■■■□ 3.01
ACTBP11-201ENST00000436287 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.49■■■□□ 2.79
ACTBP11-201ENST00000436287 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.45■■■□□ 2.78
ACTBP11-201ENST00000436287 NACADO15069 1562 aa32.19■■■□□ 2.74
ACTBP11-201ENST00000436287 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.06■■■□□ 2.72
ACTBP11-201ENST00000436287 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.93■■■□□ 2.7
ACTBP11-201ENST00000436287 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.7■■■□□ 2.66
ACTBP11-201ENST00000436287 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.55■■■□□ 2.64
ACTBP11-201ENST00000436287 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.52■■■□□ 2.64
ACTBP11-201ENST00000436287 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
ACTBP11-201ENST00000436287 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.18■■■□□ 2.58
ACTBP11-201ENST00000436287 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.1■■■□□ 2.57
ACTBP11-201ENST00000436287 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.91■■■□□ 2.54
ACTBP11-201ENST00000436287 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.88■■■□□ 2.53
ACTBP11-201ENST00000436287 SCRIBQ14160 1630 aa30.87■■■□□ 2.53
ACTBP11-201ENST00000436287 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
ACTBP11-201ENST00000436287 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.06■■■□□ 2.4
ACTBP11-201ENST00000436287 NCAPD3P42695 1498 aa29.8■■■□□ 2.36
ACTBP11-201ENST00000436287 CUX2O14529 1486 aa29.65■■■□□ 2.34
ACTBP11-201ENST00000436287 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.63■■■□□ 2.33
ACTBP11-201ENST00000436287 ERCC6Q03468 1493 aa29.6■■■□□ 2.33
ACTBP11-201ENST00000436287 SMARCA2P51531 1590 aa29.48■■■□□ 2.31
ACTBP11-201ENST00000436287 HMGXB3Q12766 1538 aa29.45■■■□□ 2.31
ACTBP11-201ENST00000436287 SMARCA4P51532 1647 aa29.44■■■□□ 2.3
ACTBP11-201ENST00000436287 NESP48681 1621 aa29.34■■■□□ 2.29
ACTBP11-201ENST00000436287 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
ACTBP11-201ENST00000436287 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
ACTBP11-201ENST00000436287 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.2■■■□□ 2.26
ACTBP11-201ENST00000436287 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.08■■■□□ 2.25
ACTBP11-201ENST00000436287 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.07■■■□□ 2.24
ACTBP11-201ENST00000436287 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
ACTBP11-201ENST00000436287 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.99■■■□□ 2.23
ACTBP11-201ENST00000436287 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.88■■■□□ 2.21
ACTBP11-201ENST00000436287 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.82■■■□□ 2.2
ACTBP11-201ENST00000436287 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.72■■■□□ 2.19
ACTBP11-201ENST00000436287 WIZO95785 1651 aa28.64■■■□□ 2.17
ACTBP11-201ENST00000436287 WDR62O43379 1518 aa28.63■■■□□ 2.17
ACTBP11-201ENST00000436287 TRIM41Q8WV44 630 aa28.56■■■□□ 2.16
ACTBP11-201ENST00000436287 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.53■■■□□ 2.16
ACTBP11-201ENST00000436287 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.5■■■□□ 2.15
ACTBP11-201ENST00000436287 CFTRP13569 1480 aa28.46■■■□□ 2.15
ACTBP11-201ENST00000436287 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
ACTBP11-201ENST00000436287 OSCARQ8IYS5 282 aa28.34■■■□□ 2.13
ACTBP11-201ENST00000436287 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
ACTBP11-201ENST00000436287 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
ACTBP11-201ENST00000436287 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.04■■■□□ 2.08
ACTBP11-201ENST00000436287 IFT140Q96RY7 1462 aa28.01■■■□□ 2.07
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
ACTBP11-201ENST00000436287 TOPBP1Q92547 1522 aa27.92■■■□□ 2.06
ACTBP11-201ENST00000436287 PRDM2Q13029 1718 aa27.9■■■□□ 2.06
ACTBP11-201ENST00000436287 ABCC8Q09428 1581 aa27.86■■■□□ 2.05
ACTBP11-201ENST00000436287 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.83■■■□□ 2.05
ACTBP11-201ENST00000436287 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.83■■■□□ 2.05
ACTBP11-201ENST00000436287 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.83■■■□□ 2.05
ACTBP11-201ENST00000436287 ARHGEF11O15085 1522 aa27.78■■■□□ 2.04
ACTBP11-201ENST00000436287 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.75■■■□□ 2.03
ACTBP11-201ENST00000436287 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.72■■■□□ 2.03
ACTBP11-201ENST00000436287 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
ACTBP11-201ENST00000436287 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.68■■■□□ 2.02
ACTBP11-201ENST00000436287 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
ACTBP11-201ENST00000436287 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
ACTBP11-201ENST00000436287 FBLN2P98095 1184 aa27.61■■■□□ 2.01
ACTBP11-201ENST00000436287 SOGA1O94964 1423 aa27.54■■■□□ 2
ACTBP11-201ENST00000436287 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.54■■■□□ 2
ACTBP11-201ENST00000436287 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
ACTBP11-201ENST00000436287 ARAP1Q96P48 1450 aa27.51■■□□□ 1.99
ACTBP11-201ENST00000436287 CHD1O14646 1710 aa27.5■■□□□ 1.99
ACTBP11-201ENST00000436287 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
ACTBP11-201ENST00000436287 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.4■■□□□ 1.98
ACTBP11-201ENST00000436287 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
ACTBP11-201ENST00000436287 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.38■■□□□ 1.97
ACTBP11-201ENST00000436287 WDR97A6NE52 1622 aa27.34■■□□□ 1.97
ACTBP11-201ENST00000436287 CUX1P39880 1505 aa27.32■■□□□ 1.96
ACTBP11-201ENST00000436287 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
ACTBP11-201ENST00000436287 GRIN2BQ13224 1484 aa27.3■■□□□ 1.96
ACTBP11-201ENST00000436287 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.3■■□□□ 1.96
ACTBP11-201ENST00000436287 SYNJ2O15056 1496 aa27.24■■□□□ 1.95
ACTBP11-201ENST00000436287 SYNJ1O43426 1573 aa27.23■■□□□ 1.95
ACTBP11-201ENST00000436287 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.16■■□□□ 1.94
ACTBP11-201ENST00000436287 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.09■■□□□ 1.93
ACTBP11-201ENST00000436287 PBRM1Q86U86 1689 aa27■■□□□ 1.91
ACTBP11-201ENST00000436287 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.99■■□□□ 1.91
ACTBP11-201ENST00000436287 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
ACTBP11-201ENST00000436287 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.91
ACTBP11-201ENST00000436287 GRIN2AQ12879 1464 aa26.93■■□□□ 1.9
ACTBP11-201ENST00000436287 NUP160Q12769 1436 aa26.89■■□□□ 1.89
ACTBP11-201ENST00000436287 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.85■■□□□ 1.89
ACTBP11-201ENST00000436287 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
ACTBP11-201ENST00000436287 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.83■■□□□ 1.89
ACTBP11-201ENST00000436287 ADAMTS12P58397 1594 aa26.81■■□□□ 1.88
ACTBP11-201ENST00000436287 CEP170Q5SW79 1584 aa26.8■■□□□ 1.88
ACTBP11-201ENST00000436287 TOP2BQ02880 1626 aa26.78■■□□□ 1.88
ACTBP11-201ENST00000436287 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.74■■□□□ 1.87
ACTBP11-201ENST00000436287 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.72■■□□□ 1.87
ACTBP11-201ENST00000436287 SHROOM2Q13796 1616 aa26.7■■□□□ 1.86
ACTBP11-201ENST00000436287 JPH4Q96JJ6 628 aa26.67■■□□□ 1.86
ACTBP11-201ENST00000436287 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
ACTBP11-201ENST00000436287 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.47■■□□□ 1.83
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