RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434030.1

SEMA3B-205, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 3

Gene SEMA3B, Length 1,011 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-205ENST00000434030 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.66■■■■■ 6.34
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SEMA3B-205ENST00000434030 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.14■■■■■ 4.34
SEMA3B-205ENST00000434030 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.11■■■■■ 4.33
SEMA3B-205ENST00000434030 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
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SEMA3B-205ENST00000434030 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.71■■■■■ 4.11
SEMA3B-205ENST00000434030 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.7■■■■■ 4.11
SEMA3B-205ENST00000434030 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.7■■■■■ 4.11
SEMA3B-205ENST00000434030 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.68■■■■■ 4.1
SEMA3B-205ENST00000434030 WDR62O43379 1518 aa40.64■■■■■ 4.1
SEMA3B-205ENST00000434030 PRDM2Q13029 1718 aa40.62■■■■■ 4.09
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SEMA3B-205ENST00000434030 IFT140Q96RY7 1462 aa39.87■■■■□ 3.97
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SEMA3B-205ENST00000434030 WDR97A6NE52 1622 aa39.27■■■■□ 3.88
SEMA3B-205ENST00000434030 CHD1O14646 1710 aa39.26■■■■□ 3.88
SEMA3B-205ENST00000434030 TRIM41Q8WV44 630 aa39.12■■■■□ 3.85
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SEMA3B-205ENST00000434030 TOP2BQ02880 1626 aa39.09■■■■□ 3.85
SEMA3B-205ENST00000434030 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.08■■■■□ 3.85
SEMA3B-205ENST00000434030 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.08■■■■□ 3.85
SEMA3B-205ENST00000434030 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.07■■■■□ 3.84
SEMA3B-205ENST00000434030 GRIN2BQ13224 1484 aa39.05■■■■□ 3.84
SEMA3B-205ENST00000434030 SYNJ1O43426 1573 aa39.05■■■■□ 3.84
SEMA3B-205ENST00000434030 PBRM1Q86U86 1689 aa39.03■■■■□ 3.84
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SEMA3B-205ENST00000434030 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.02■■■■□ 3.84
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SEMA3B-205ENST00000434030 ARHGEF11O15085 1522 aa38.91■■■■□ 3.82
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SEMA3B-205ENST00000434030 SHROOM2Q13796 1616 aa38.22■■■■□ 3.71
SEMA3B-205ENST00000434030 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.2■■■■□ 3.71
SEMA3B-205ENST00000434030 CUL7Q14999 1698 aa38.17■■■■□ 3.7
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SEMA3B-205ENST00000434030 JPH4Q96JJ6 628 aa38.04■■■■□ 3.68
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