RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430554.1

ACHE-208, Transcript of acetylcholinesterase (Cartwright blood group), humanhuman

TSL 3

Gene ACHE, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACHE-208ENST00000430554 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.78■■■■■ 6.04
ACHE-208ENST00000430554 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.98■■■■■ 5.11
ACHE-208ENST00000430554 ABCC9O60706 1549 aa46.09■■■■■ 4.97
ACHE-208ENST00000430554 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.28■■■■■ 4.68
ACHE-208ENST00000430554 NACADO15069 1562 aa44.2■■■■■ 4.67
ACHE-208ENST00000430554 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.2■■■■■ 4.67
ACHE-208ENST00000430554 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.92■■■■■ 4.62
ACHE-208ENST00000430554 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.89■■■■■ 4.62
ACHE-208ENST00000430554 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.65■■■■■ 4.58
ACHE-208ENST00000430554 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.35■■■■■ 4.53
ACHE-208ENST00000430554 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.08■■■■■ 4.49
ACHE-208ENST00000430554 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.97■■■■■ 4.47
ACHE-208ENST00000430554 SCRIBQ14160 1630 aa42.86■■■■■ 4.45
ACHE-208ENST00000430554 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.46■■■■■ 4.39
ACHE-208ENST00000430554 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.45■■■■■ 4.39
ACHE-208ENST00000430554 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
ACHE-208ENST00000430554 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.71■■■■■ 4.27
ACHE-208ENST00000430554 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.42■■■■■ 4.22
ACHE-208ENST00000430554 SMARCA4P51532 1647 aa40.99■■■■■ 4.15
ACHE-208ENST00000430554 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
ACHE-208ENST00000430554 NCAPD3P42695 1498 aa40.79■■■■■ 4.12
ACHE-208ENST00000430554 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.79■■■■■ 4.12
ACHE-208ENST00000430554 SMARCA2P51531 1590 aa40.73■■■■■ 4.11
ACHE-208ENST00000430554 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.69■■■■■ 4.1
ACHE-208ENST00000430554 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.58■■■■■ 4.09
ACHE-208ENST00000430554 HMGXB3Q12766 1538 aa40.56■■■■■ 4.08
ACHE-208ENST00000430554 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
ACHE-208ENST00000430554 WIZO95785 1651 aa40.26■■■■■ 4.04
ACHE-208ENST00000430554 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
ACHE-208ENST00000430554 NESP48681 1621 aa39.87■■■■□ 3.97
ACHE-208ENST00000430554 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
ACHE-208ENST00000430554 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.74■■■■□ 3.95
ACHE-208ENST00000430554 ERCC6Q03468 1493 aa39.73■■■■□ 3.95
ACHE-208ENST00000430554 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.6■■■■□ 3.93
ACHE-208ENST00000430554 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.47■■■■□ 3.91
ACHE-208ENST00000430554 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.41■■■■□ 3.9
ACHE-208ENST00000430554 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.34■■■■□ 3.89
ACHE-208ENST00000430554 CUX2O14529 1486 aa39.34■■■■□ 3.89
ACHE-208ENST00000430554 CFTRP13569 1480 aa39.34■■■■□ 3.89
ACHE-208ENST00000430554 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
ACHE-208ENST00000430554 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.14■■■■□ 3.86
ACHE-208ENST00000430554 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.09■■■■□ 3.85
ACHE-208ENST00000430554 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.09■■■■□ 3.85
ACHE-208ENST00000430554 PRDM2Q13029 1718 aa39.06■■■■□ 3.84
ACHE-208ENST00000430554 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.06■■■■□ 3.84
ACHE-208ENST00000430554 WDR62O43379 1518 aa38.94■■■■□ 3.82
ACHE-208ENST00000430554 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.76■■■■□ 3.8
ACHE-208ENST00000430554 TOPBP1Q92547 1522 aa38.5■■■■□ 3.75
ACHE-208ENST00000430554 ABCC8Q09428 1581 aa38.49■■■■□ 3.75
ACHE-208ENST00000430554 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.44■■■■□ 3.74
ACHE-208ENST00000430554 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.33■■■■□ 3.73
ACHE-208ENST00000430554 IFT140Q96RY7 1462 aa38.28■■■■□ 3.72
ACHE-208ENST00000430554 CUX1P39880 1505 aa38.18■■■■□ 3.7
ACHE-208ENST00000430554 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.16■■■■□ 3.7
ACHE-208ENST00000430554 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.14■■■■□ 3.7
ACHE-208ENST00000430554 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.11■■■■□ 3.69
ACHE-208ENST00000430554 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.05■■■■□ 3.68
ACHE-208ENST00000430554 SOGA1O94964 1423 aa38.02■■■■□ 3.68
ACHE-208ENST00000430554 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.01■■■■□ 3.68
ACHE-208ENST00000430554 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.97■■■■□ 3.67
ACHE-208ENST00000430554 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.91■■■■□ 3.66
ACHE-208ENST00000430554 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.87■■■■□ 3.65
ACHE-208ENST00000430554 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
ACHE-208ENST00000430554 TOP2BQ02880 1626 aa37.82■■■■□ 3.64
ACHE-208ENST00000430554 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.81■■■■□ 3.64
ACHE-208ENST00000430554 SYNJ1O43426 1573 aa37.8■■■■□ 3.64
ACHE-208ENST00000430554 WDR97A6NE52 1622 aa37.77■■■■□ 3.64
ACHE-208ENST00000430554 OSCARQ8IYS5 282 aa37.74■■■■□ 3.63
ACHE-208ENST00000430554 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.68■■■■□ 3.62
ACHE-208ENST00000430554 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.58■■■■□ 3.61
ACHE-208ENST00000430554 GRIN2BQ13224 1484 aa37.57■■■■□ 3.61
ACHE-208ENST00000430554 CHD1O14646 1710 aa37.55■■■■□ 3.6
ACHE-208ENST00000430554 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.54■■■■□ 3.6
ACHE-208ENST00000430554 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.54■■■■□ 3.6
ACHE-208ENST00000430554 PBRM1Q86U86 1689 aa37.52■■■■□ 3.6
ACHE-208ENST00000430554 FBLN2P98095 1184 aa37.5■■■■□ 3.59
ACHE-208ENST00000430554 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.49■■■■□ 3.59
ACHE-208ENST00000430554 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
ACHE-208ENST00000430554 SYNJ2O15056 1496 aa37.35■■■■□ 3.57
ACHE-208ENST00000430554 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.23■■■■□ 3.55
ACHE-208ENST00000430554 ADAMTS12P58397 1594 aa37.18■■■■□ 3.54
ACHE-208ENST00000430554 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.13■■■■□ 3.53
ACHE-208ENST00000430554 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.13■■■■□ 3.53
ACHE-208ENST00000430554 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.13■■■■□ 3.53
ACHE-208ENST00000430554 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.13■■■■□ 3.53
ACHE-208ENST00000430554 ARHGEF11O15085 1522 aa37.1■■■■□ 3.53
ACHE-208ENST00000430554 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.1■■■■□ 3.53
ACHE-208ENST00000430554 KIF27Q86VH2 1401 aa37.09■■■■□ 3.53
ACHE-208ENST00000430554 GRIN2AQ12879 1464 aa37.09■■■■□ 3.53
ACHE-208ENST00000430554 TRIM41Q8WV44 630 aa37.01■■■■□ 3.52
ACHE-208ENST00000430554 IGF1RP08069 1367 aa36.99■■■■□ 3.51
ACHE-208ENST00000430554 NUP160Q12769 1436 aa36.94■■■■□ 3.5
ACHE-208ENST00000430554 CEP170Q5SW79 1584 aa36.92■■■■□ 3.5
ACHE-208ENST00000430554 CUL7Q14999 1698 aa36.87■■■■□ 3.49
ACHE-208ENST00000430554 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.8■■■■□ 3.48
ACHE-208ENST00000430554 ARAP1Q96P48 1450 aa36.79■■■■□ 3.48
ACHE-208ENST00000430554 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.75■■■■□ 3.47
ACHE-208ENST00000430554 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.75■■■■□ 3.47
ACHE-208ENST00000430554 SHROOM2Q13796 1616 aa36.68■■■■□ 3.46
ACHE-208ENST00000430554 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.61■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 178.2 ms