RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426722.5

NELFE-203, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 765 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-203ENST00000426722 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.33■■■□□ 2.77
NELFE-203ENST00000426722 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.08■■■□□ 2.25
NELFE-203ENST00000426722 ABCC9O60706 1549 aa28.98■■■□□ 2.23
NELFE-203ENST00000426722 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.67■■■□□ 2.02
NELFE-203ENST00000426722 NACADO15069 1562 aa27.49■■□□□ 1.99
NELFE-203ENST00000426722 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.23■■□□□ 1.95
NELFE-203ENST00000426722 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.18■■□□□ 1.94
NELFE-203ENST00000426722 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.15■■□□□ 1.94
NELFE-203ENST00000426722 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.02■■□□□ 1.92
NELFE-203ENST00000426722 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.95■■□□□ 1.9
NELFE-203ENST00000426722 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.8■■□□□ 1.88
NELFE-203ENST00000426722 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
NELFE-203ENST00000426722 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.77■■□□□ 1.88
NELFE-203ENST00000426722 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.56■■□□□ 1.84
NELFE-203ENST00000426722 SCRIBQ14160 1630 aa26.38■■□□□ 1.81
NELFE-203ENST00000426722 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.23■■□□□ 1.79
NELFE-203ENST00000426722 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
NELFE-203ENST00000426722 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.15■■□□□ 1.78
NELFE-203ENST00000426722 NCAPD3P42695 1498 aa25.36■■□□□ 1.65
NELFE-203ENST00000426722 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.25■■□□□ 1.63
NELFE-203ENST00000426722 SMARCA4P51532 1647 aa25.22■■□□□ 1.63
NELFE-203ENST00000426722 SMARCA2P51531 1590 aa25.22■■□□□ 1.63
NELFE-203ENST00000426722 HMGXB3Q12766 1538 aa25.17■■□□□ 1.62
NELFE-203ENST00000426722 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
NELFE-203ENST00000426722 CUX2O14529 1486 aa25.09■■□□□ 1.61
NELFE-203ENST00000426722 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.07■■□□□ 1.6
NELFE-203ENST00000426722 ERCC6Q03468 1493 aa25.06■■□□□ 1.6
NELFE-203ENST00000426722 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.01■■□□□ 1.59
NELFE-203ENST00000426722 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
NELFE-203ENST00000426722 NESP48681 1621 aa24.87■■□□□ 1.57
NELFE-203ENST00000426722 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.86■■□□□ 1.57
NELFE-203ENST00000426722 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.81■■□□□ 1.56
NELFE-203ENST00000426722 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
NELFE-203ENST00000426722 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.66■■□□□ 1.54
NELFE-203ENST00000426722 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.6■■□□□ 1.53
NELFE-203ENST00000426722 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.58■■□□□ 1.53
NELFE-203ENST00000426722 WIZO95785 1651 aa24.58■■□□□ 1.53
NELFE-203ENST00000426722 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.41■■□□□ 1.5
NELFE-203ENST00000426722 WDR62O43379 1518 aa24.36■■□□□ 1.49
NELFE-203ENST00000426722 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
NELFE-203ENST00000426722 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.32■■□□□ 1.48
NELFE-203ENST00000426722 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
NELFE-203ENST00000426722 CFTRP13569 1480 aa24.29■■□□□ 1.48
NELFE-203ENST00000426722 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.26■■□□□ 1.47
NELFE-203ENST00000426722 PRDM2Q13029 1718 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-203ENST00000426722 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
NELFE-203ENST00000426722 CCDC88BA6NC98 1476 aa24■■□□□ 1.43
NELFE-203ENST00000426722 OSCARQ8IYS5 282 aa23.93■■□□□ 1.42
NELFE-203ENST00000426722 TRIM41Q8WV44 630 aa23.88■■□□□ 1.41
NELFE-203ENST00000426722 ABCC8Q09428 1581 aa23.86■■□□□ 1.41
NELFE-203ENST00000426722 IFT140Q96RY7 1462 aa23.85■■□□□ 1.41
NELFE-203ENST00000426722 TOPBP1Q92547 1522 aa23.81■■□□□ 1.4
NELFE-203ENST00000426722 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.74■■□□□ 1.39
NELFE-203ENST00000426722 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
NELFE-203ENST00000426722 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
NELFE-203ENST00000426722 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
NELFE-203ENST00000426722 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.58■■□□□ 1.36
NELFE-203ENST00000426722 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.58■■□□□ 1.36
NELFE-203ENST00000426722 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.58■■□□□ 1.36
NELFE-203ENST00000426722 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
NELFE-203ENST00000426722 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.368e-7■■■□□ 14.6
NELFE-203ENST00000426722 ARHGEF11O15085 1522 aa23.49■■□□□ 1.35
NELFE-203ENST00000426722 CHD1O14646 1710 aa23.48■■□□□ 1.35
NELFE-203ENST00000426722 SOGA1O94964 1423 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-203ENST00000426722 WDR97A6NE52 1622 aa23.46■■□□□ 1.35
NELFE-203ENST00000426722 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-203ENST00000426722 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.4■■□□□ 1.34
NELFE-203ENST00000426722 FBLN2P98095 1184 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-203ENST00000426722 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
NELFE-203ENST00000426722 CUX1P39880 1505 aa23.36■■□□□ 1.33
NELFE-203ENST00000426722 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.31■■□□□ 1.32
NELFE-203ENST00000426722 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.3■■□□□ 1.32
NELFE-203ENST00000426722 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
NELFE-203ENST00000426722 GRIN2BQ13224 1484 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-203ENST00000426722 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
NELFE-203ENST00000426722 ARAP1Q96P48 1450 aa23.24■■□□□ 1.31
NELFE-203ENST00000426722 SYNJ1O43426 1573 aa23.23■■□□□ 1.31
NELFE-203ENST00000426722 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-203ENST00000426722 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
NELFE-203ENST00000426722 SYNJ2O15056 1496 aa23.2■■□□□ 1.3
NELFE-203ENST00000426722 PBRM1Q86U86 1689 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-203ENST00000426722 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-203ENST00000426722 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-203ENST00000426722 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.12■■□□□ 1.29
NELFE-203ENST00000426722 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
NELFE-203ENST00000426722 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
NELFE-203ENST00000426722 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.04■■□□□ 1.28
NELFE-203ENST00000426722 TOP2BQ02880 1626 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-203ENST00000426722 GRIN2AQ12879 1464 aa22.96■■□□□ 1.27
NELFE-203ENST00000426722 ADAMTS12P58397 1594 aa22.93■■□□□ 1.26
NELFE-203ENST00000426722 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.91■■□□□ 1.26
NELFE-203ENST00000426722 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.9■■□□□ 1.26
NELFE-203ENST00000426722 NUP160Q12769 1436 aa22.9■■□□□ 1.26
NELFE-203ENST00000426722 CEP170Q5SW79 1584 aa22.86■■□□□ 1.25
NELFE-203ENST00000426722 SHROOM2Q13796 1616 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-203ENST00000426722 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.78■■□□□ 1.24
NELFE-203ENST00000426722 JPH4Q96JJ6 628 aa22.68■■□□□ 1.22
NELFE-203ENST00000426722 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
NELFE-203ENST00000426722 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-203ENST00000426722 KIF27Q86VH2 1401 aa22.58■■□□□ 1.21
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